ChangeLog

   1 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
   2
   3         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
   4         procsignal.cpp
   5
   6         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
   7         bug in parsing command-line parameters.
   8
   9         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  10         plotfiles
  11
  12         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  13
  14         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  15
  16         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  17         for frequency/inverse-fourier filtering
  18
  19 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  20
  21         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  22
  23         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  24         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  25
  26         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  27         for math tips]
  28
  29         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  30
  31         * ctsim: Added more analyze menuitems
  32
  33         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  34         through this master shell. Has both command-line and interactive
  35         interface
  36
  37         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  38
  39         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  40
  41         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  42
  43 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  44
  45         * ctsim: Added plotting of histograms
  46
  47         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  48
  49         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  50
  51 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  52
  53         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  54
  55         * ctsim: added generation of filter images
  56
  57         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  58
  59         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  60
  61         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  62
  63         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  64         text files suitable for reading.
  65
  66         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  67         when performing properties of images.
  68
  69         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  70         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  71         fourier.cpp
  72
  73         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  74         image math functions to complex-valued math.
  75
  76         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  77
  78 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  79
  80         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  81         and column plots and comparison plots
  82
  83         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  84
  85         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  86
  87         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  88         files.
  89
  90         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  91         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  92         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  93
  94         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  95         imagefile and plotfile classes.
  96
  97         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  98         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  99         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 100         images.
 101
 102         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 103         images.
 104
 105         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 106         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 107
 108         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 109         math functions
 110
 111         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 112
 113         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 114         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 115         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 116
 117         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 118         class.
 119
 120         * sgp: Added linestyle settings
 121
 122 2.5.0 - 12/18/00
 123    First Microsoft Windows GUI version
 124    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 125    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 126         when manually compiling phantoms that vary during projection
 127         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 128    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 129    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 130    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 131    Fixed display of plotting in Projection views
 132    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 133    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 134         "namespace using std" statements
 135    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 136    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 137
 138 2.0.6 - 12/03/00
 139    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 140    Updated README file
 141    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 142    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 143
 144 2.0.5 - 12/01/00
 145    Improved compilation on RedHat 7
 146    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 147    Removed README.RedHat7
 148
 149 2.0.4 - 11/25/00
 150    Added documentation for --geometry setting
 151    Added README.RedHat7 document
 152
 153 2.0.3 - 11/20/00
 154    Fixed bug in generation of binary PGM files
 155    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 156    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 157
 158 2.0.2 - 11/8/00
 159    Additions to man pages (Ian Kay)
 160    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 161
 162 2.0.1 - 10/1/00
 163    Fixed syntax error in fftw configuration
 164    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 165
 166 2.0.0 - 9/7/00
 167    Version 2.0.0 released!
 168    ctsim: Added Window menu to Main frame
 169    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 170    Fixed obscure bug in sys_error
 171    Fixed compilation in mingw environment not present
 172    Fixed compilation in non-graphical environments
 173
 174 2.0.0-b12 - 9/4/00
 175    ctsim: Added animation of reconstruction
 176    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 177    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 178    ctsim: used setpriority to set lower priority
 179    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 180    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 181
 182 2.0.0-b11 - 9/1/00
 183    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 184    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 185    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 186    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 187    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 188    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 189    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 190    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 191    Separated reconstruction into Reconstructor class
 192    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 193    Added --enable-static to generate statically linked programs
 194
 195 2.0.0-b10 - 8/25/00
 196    ctsim: Added animation of projection collection processs
 197    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 198    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 199    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 200    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 201    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 202    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 203    Fixed bug in backprojection selection
 204
 205 2.0.0-b9 - 8/22/00
 206    Added RCS Id strings to executable files
 207    Added RPM Spec file for RPM package creation
 208    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 209    Fixed compilation for non-SGP architectures
 210    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 211    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 212         inverse_fourier construction of filters
 213    Added median to statistics and to auto-windowing
 214
 215 2.0.0-b8 - 8/1/00
 216    Added line color support to SGP
 217    Fixed lineAbs bug
 218
 219 2.0.0-b7 - 7/25/00
 220    Finished support for dmallocxx library
 221    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 222    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 223         G2 windows and well as WXWindows.
 224    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 225    Fixed row-plot bug in if-2
 226    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 227
 228 2.0.0-b6 - 7/22/00
 229    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 230         and projection files
 231    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 232         and reconstruction parameters dialogs
 233    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 234    Completely reorganized option processing in classes to improve
 235         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 236
 237 2.0.0-b5 - 7/17/00
 238    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 239    Started ctsim.tex document file
 240
 241 2.0.0-b4 - 7/13/00
 242    Fixed compiler warnings at -Wall level
 243    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 244    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 245    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 246
 247 2.0.0-b3 - 7/10/00
 248    Added highly optimized backprojection method idiff3
 249    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 250    Fixed image display in if2img using G2 library
 251    Added column-plot and row-plot options to if-2
 252    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 253    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 254         backprojection method. Currently, this technique is still under
 255         development and debugging
 256    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 257
 258 2.0.0-b2 - 7/07/00
 259    Cleaned up SignalFilter class
 260    Added zeropad option to pjrec
 261    Added zeropad options to html and cgi files
 262    Added fourier_table and rfttw filter methods
 263    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 264
 265 2.0.0-b1 - 7/05/00
 266    Updated trace level processing
 267    Added trace level to SignalFilter
 268    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 269
 270 1.9.9 - 7/04/00
 271    Fixed const issue with ImageFileArray
 272    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 273    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 274    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 275    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 276    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 277         between convolution, dft, & fft filtering
 278    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 279    Added support for FFTW library
 280
 281 1.9.8 - 6/27/2000
 282    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 283    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 284    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 285    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 286    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 287    Added signature tag and creation date/time to projection files
 288
 289 1.9.7 - 6/25/2000
 290    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 291         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 292         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 293    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 294    Rewrote ImageFile class
 295    Started support for dmallocxx library, not finished
 296    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 297    Updated ifinfo to show comparative statistics
 298    Added printLabels() to Array2dFile class
 299    Added printStatistics() to ImageFile class
 300
 301 1.9.6 - 6/22/2000
 302    Moved conversion filter name/id to Filter class
 303    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 304    Added MPI broadcasting of strings
 305
 306 1.9.5 - 6/21/2000
 307    Merged proj_reconstr into class Projections
 308    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 309    Code cleanup in projections.cpp
 310    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 311
 312 1.9.4 - 6/20/2000
 313    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 314    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 315    Converted filter and convolution to object-oriented code
 316    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 317    Optimized image file writing on little-endian architectures
 318    Updated README and INSTALL
 319
 320 1.9.3 - 6/19/2000
 321    Reorganized source files
 322    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 323
 324 1.9.2 - 6/18/2000
 325    Reorganized include files
 326    Fixed const pointers in strfuncs
 327
 328 1.9.1 - 6/16/2000
 329    Renamed directories, moved source files, combined source files
 330    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 331    and libctgraphics)
 332
 333 1.9.0 - 6/15/2000
 334    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 335    Renamed Raysums to Projections throughout files
 336    Renamed Detector to Scanner
 337    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 338
 339 0.6.1 - 6/12/2000
 340    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 341    Converted Detector to Object-Oriented
 342
 343 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 344    Improved Integer backprojection method
 345         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 346         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 347    Finished converting all C files to C++
 348    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 349    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 350
 351 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 352    Converted MPI data structures to C++ object
 353    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 354
 355 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 356    First C++ conversions
 357    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 358         - Now all data files are cross-platform compatible
 359    Converted from MPI to MPI++
 360    Converted backprojection to object-oriented
 361    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 362
 363 0.5.4 - 6/4/2000
 364    Simpilifed endian handling
 365
 366 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 367    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 368    Removed broken B-spline interpolation
 369    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 370    Added support for 16-bit PNG graphics
 371
 372 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 373    Added compile-time configuration of endian order
 374
 375 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 376    Modified the raysum file format to be platform independent
 377
 378 0.5.3 - 5/11/2000
 379    Added Microsoft VC compatibility
 380    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 381
 382 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 383    Continued conversion to ANSI C
 384    Removed old CRT routines
 385
 386 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 387    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 388    Continued code cleanup
 389
 390 0.5.2-b3 - 4/30/200
 391     More code cleanup with reorganizing libraries
 392     Added --log and --exp to sdf-1
 393     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 394
 395 0.5.2-b2 - 4/30/200
 396     Continued code cleanup
 397
 398 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 399     Fixed a few MPI bugs
 400     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 401
 402 0.5.1 - 4/28/2000
 403     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 404     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 405
 406 0.5.0 - 4/27/2000
 407     First open source distribution for GNU/Linux
 408
 409 6/1999
 410   Converted to GNU/Linux
 411   added MPI support via LAM library
 412
 413 1983-84
 414   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 415