ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * global: Projection files are not compatible with previous version
   4         due to new scanner definitions.
   5
   6         * global: deleted concept of field-of-view and added
   7           view ratio and scan ratio concepts.
   8
   9         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  10         registry storage between executions.
  11
  12         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  13
  14         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  15
  16         * ctsim: Added graphical About box
  17
  18         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  19
  20         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  21
  22         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  23
  24         * ctsim: Online help added as well as HTML help
  25
  26         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  27
  28         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  29         reconstruction dialogs.
  30
  31         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  32
  33         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  34
  35         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  36
  37         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
  38
  39         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  40
  41 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  42
  43         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  44         procsignal.cpp
  45
  46         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  47         bug in parsing command-line parameters.
  48
  49         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  50         plotfiles
  51
  52         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  53
  54         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  55
  56         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  57         for frequency/inverse-fourier filtering
  58
  59 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  60
  61         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  62
  63         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  64         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  65
  66         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  67         for math tips]
  68
  69         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  70
  71         * ctsim: Added more analyze menuitems
  72
  73         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  74         through this master shell. Has both command-line and interactive
  75         interface
  76
  77         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  78
  79         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  80
  81         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  82
  83 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  84
  85         * ctsim: Added plotting of histograms
  86
  87         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  88
  89         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  90
  91 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  92
  93         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  94
  95         * ctsim: added generation of filter images
  96
  97         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  98
  99         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 100
 101         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 102
 103         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 104         text files suitable for reading.
 105
 106         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 107         when performing properties of images.
 108
 109         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 110         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 111         fourier.cpp
 112
 113         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 114         image math functions to complex-valued math.
 115
 116         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 117
 118 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 119
 120         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 121         and column plots and comparison plots
 122
 123         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 124
 125         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 126
 127         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 128         files.
 129
 130         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 131         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 132         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 133
 134         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 135         imagefile and plotfile classes.
 136
 137         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 138         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 139         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 140         images.
 141
 142         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 143         images.
 144
 145         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 146         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 147
 148         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 149         math functions
 150
 151         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 152
 153         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 154         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 155         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 156
 157         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 158         class.
 159
 160         * sgp: Added linestyle settings
 161
 162 2.5.0 - 12/18/00
 163    First Microsoft Windows GUI version
 164    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 165    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 166         when manually compiling phantoms that vary during projection
 167         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 168    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 169    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 170    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 171    Fixed display of plotting in Projection views
 172    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 173    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 174         "namespace using std" statements
 175    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 176    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 177
 178 2.0.6 - 12/03/00
 179    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 180    Updated README file
 181    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 182    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 183
 184 2.0.5 - 12/01/00
 185    Improved compilation on RedHat 7
 186    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 187    Removed README.RedHat7
 188
 189 2.0.4 - 11/25/00
 190    Added documentation for --geometry setting
 191    Added README.RedHat7 document
 192
 193 2.0.3 - 11/20/00
 194    Fixed bug in generation of binary PGM files
 195    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 196    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 197
 198 2.0.2 - 11/8/00
 199    Additions to man pages (Ian Kay)
 200    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 201
 202 2.0.1 - 10/1/00
 203    Fixed syntax error in fftw configuration
 204    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 205
 206 2.0.0 - 9/7/00
 207    Version 2.0.0 released!
 208    ctsim: Added Window menu to Main frame
 209    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 210    Fixed obscure bug in sys_error
 211    Fixed compilation in mingw environment not present
 212    Fixed compilation in non-graphical environments
 213
 214 2.0.0-b12 - 9/4/00
 215    ctsim: Added animation of reconstruction
 216    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 217    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 218    ctsim: used setpriority to set lower priority
 219    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 220    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 221
 222 2.0.0-b11 - 9/1/00
 223    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 224    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 225    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 226    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 227    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 228    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 229    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 230    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 231    Separated reconstruction into Reconstructor class
 232    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 233    Added --enable-static to generate statically linked programs
 234
 235 2.0.0-b10 - 8/25/00
 236    ctsim: Added animation of projection collection processs
 237    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 238    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 239    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 240    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 241    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 242    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 243    Fixed bug in backprojection selection
 244
 245 2.0.0-b9 - 8/22/00
 246    Added RCS Id strings to executable files
 247    Added RPM Spec file for RPM package creation
 248    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 249    Fixed compilation for non-SGP architectures
 250    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 251    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 252         inverse_fourier construction of filters
 253    Added median to statistics and to auto-windowing
 254
 255 2.0.0-b8 - 8/1/00
 256    Added line color support to SGP
 257    Fixed lineAbs bug
 258
 259 2.0.0-b7 - 7/25/00
 260    Finished support for dmallocxx library
 261    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 262    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 263         G2 windows and well as WXWindows.
 264    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 265    Fixed row-plot bug in if-2
 266    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 267
 268 2.0.0-b6 - 7/22/00
 269    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 270         and projection files
 271    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 272         and reconstruction parameters dialogs
 273    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 274    Completely reorganized option processing in classes to improve
 275         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 276
 277 2.0.0-b5 - 7/17/00
 278    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 279    Started ctsim.tex document file
 280
 281 2.0.0-b4 - 7/13/00
 282    Fixed compiler warnings at -Wall level
 283    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 284    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 285    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 286
 287 2.0.0-b3 - 7/10/00
 288    Added highly optimized backprojection method idiff3
 289    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 290    Fixed image display in if2img using G2 library
 291    Added column-plot and row-plot options to if-2
 292    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 293    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 294         backprojection method. Currently, this technique is still under
 295         development and debugging
 296    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 297
 298 2.0.0-b2 - 7/07/00
 299    Cleaned up SignalFilter class
 300    Added zeropad option to pjrec
 301    Added zeropad options to html and cgi files
 302    Added fourier_table and rfttw filter methods
 303    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 304
 305 2.0.0-b1 - 7/05/00
 306    Updated trace level processing
 307    Added trace level to SignalFilter
 308    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 309
 310 1.9.9 - 7/04/00
 311    Fixed const issue with ImageFileArray
 312    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 313    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 314    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 315    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 316    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 317         between convolution, dft, & fft filtering
 318    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 319    Added support for FFTW library
 320
 321 1.9.8 - 6/27/2000
 322    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 323    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 324    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 325    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 326    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 327    Added signature tag and creation date/time to projection files
 328
 329 1.9.7 - 6/25/2000
 330    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 331         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 332         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 333    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 334    Rewrote ImageFile class
 335    Started support for dmallocxx library, not finished
 336    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 337    Updated ifinfo to show comparative statistics
 338    Added printLabels() to Array2dFile class
 339    Added printStatistics() to ImageFile class
 340
 341 1.9.6 - 6/22/2000
 342    Moved conversion filter name/id to Filter class
 343    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 344    Added MPI broadcasting of strings
 345
 346 1.9.5 - 6/21/2000
 347    Merged proj_reconstr into class Projections
 348    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 349    Code cleanup in projections.cpp
 350    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 351
 352 1.9.4 - 6/20/2000
 353    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 354    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 355    Converted filter and convolution to object-oriented code
 356    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 357    Optimized image file writing on little-endian architectures
 358    Updated README and INSTALL
 359
 360 1.9.3 - 6/19/2000
 361    Reorganized source files
 362    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 363
 364 1.9.2 - 6/18/2000
 365    Reorganized include files
 366    Fixed const pointers in strfuncs
 367
 368 1.9.1 - 6/16/2000
 369    Renamed directories, moved source files, combined source files
 370    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 371    and libctgraphics)
 372
 373 1.9.0 - 6/15/2000
 374    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 375    Renamed Raysums to Projections throughout files
 376    Renamed Detector to Scanner
 377    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 378
 379 0.6.1 - 6/12/2000
 380    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 381    Converted Detector to Object-Oriented
 382
 383 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 384    Improved Integer backprojection method
 385         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 386         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 387    Finished converting all C files to C++
 388    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 389    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 390
 391 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 392    Converted MPI data structures to C++ object
 393    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 394
 395 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 396    First C++ conversions
 397    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 398         - Now all data files are cross-platform compatible
 399    Converted from MPI to MPI++
 400    Converted backprojection to object-oriented
 401    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 402
 403 0.5.4 - 6/4/2000
 404    Simpilifed endian handling
 405
 406 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 407    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 408    Removed broken B-spline interpolation
 409    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 410    Added support for 16-bit PNG graphics
 411
 412 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 413    Added compile-time configuration of endian order
 414
 415 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 416    Modified the raysum file format to be platform independent
 417
 418 0.5.3 - 5/11/2000
 419    Added Microsoft VC compatibility
 420    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 421
 422 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 423    Continued conversion to ANSI C
 424    Removed old CRT routines
 425
 426 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 427    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 428    Continued code cleanup
 429
 430 0.5.2-b3 - 4/30/200
 431     More code cleanup with reorganizing libraries
 432     Added --log and --exp to sdf-1
 433     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 434
 435 0.5.2-b2 - 4/30/200
 436     Continued code cleanup
 437
 438 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 439     Fixed a few MPI bugs
 440     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 441
 442 0.5.1 - 4/28/2000
 443     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 444     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 445
 446 0.5.0 - 4/27/2000
 447     First open source distribution for GNU/Linux
 448
 449 6/1999
 450   Converted to GNU/Linux
 451   added MPI support via LAM library
 452
 453 1983-84
 454   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 455