ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3
   4 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
   5
   6         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
   7         procsignal.cpp
   8
   9         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  10         bug in parsing command-line parameters.
  11
  12         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  13         plotfiles
  14
  15         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  16
  17         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  18
  19         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  20         for frequency/inverse-fourier filtering
  21
  22 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  23
  24         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  25
  26         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  27         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  28
  29         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  30         for math tips]
  31
  32         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  33
  34         * ctsim: Added more analyze menuitems
  35
  36         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  37         through this master shell. Has both command-line and interactive
  38         interface
  39
  40         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  41
  42         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  43
  44         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  45
  46 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  47
  48         * ctsim: Added plotting of histograms
  49
  50         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  51
  52         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  53
  54 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  55
  56         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  57
  58         * ctsim: added generation of filter images
  59
  60         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  61
  62         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  63
  64         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  65
  66         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  67         text files suitable for reading.
  68
  69         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  70         when performing properties of images.
  71
  72         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  73         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  74         fourier.cpp
  75
  76         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  77         image math functions to complex-valued math.
  78
  79         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  80
  81 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  82
  83         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  84         and column plots and comparison plots
  85
  86         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  87
  88         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  89
  90         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  91         files.
  92
  93         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  94         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  95         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  96
  97         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  98         imagefile and plotfile classes.
  99
 100         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 101         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 102         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 103         images.
 104
 105         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 106         images.
 107
 108         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 109         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 110
 111         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 112         math functions
 113
 114         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 115
 116         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 117         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 118         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 119
 120         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 121         class.
 122
 123         * sgp: Added linestyle settings
 124
 125 2.5.0 - 12/18/00
 126    First Microsoft Windows GUI version
 127    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 128    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 129         when manually compiling phantoms that vary during projection
 130         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 131    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 132    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 133    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 134    Fixed display of plotting in Projection views
 135    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 136    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 137         "namespace using std" statements
 138    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 139    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 140
 141 2.0.6 - 12/03/00
 142    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 143    Updated README file
 144    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 145    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 146
 147 2.0.5 - 12/01/00
 148    Improved compilation on RedHat 7
 149    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 150    Removed README.RedHat7
 151
 152 2.0.4 - 11/25/00
 153    Added documentation for --geometry setting
 154    Added README.RedHat7 document
 155
 156 2.0.3 - 11/20/00
 157    Fixed bug in generation of binary PGM files
 158    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 159    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 160
 161 2.0.2 - 11/8/00
 162    Additions to man pages (Ian Kay)
 163    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 164
 165 2.0.1 - 10/1/00
 166    Fixed syntax error in fftw configuration
 167    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 168
 169 2.0.0 - 9/7/00
 170    Version 2.0.0 released!
 171    ctsim: Added Window menu to Main frame
 172    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 173    Fixed obscure bug in sys_error
 174    Fixed compilation in mingw environment not present
 175    Fixed compilation in non-graphical environments
 176
 177 2.0.0-b12 - 9/4/00
 178    ctsim: Added animation of reconstruction
 179    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 180    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 181    ctsim: used setpriority to set lower priority
 182    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 183    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 184
 185 2.0.0-b11 - 9/1/00
 186    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 187    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 188    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 189    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 190    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 191    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 192    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 193    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 194    Separated reconstruction into Reconstructor class
 195    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 196    Added --enable-static to generate statically linked programs
 197
 198 2.0.0-b10 - 8/25/00
 199    ctsim: Added animation of projection collection processs
 200    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 201    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 202    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 203    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 204    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 205    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 206    Fixed bug in backprojection selection
 207
 208 2.0.0-b9 - 8/22/00
 209    Added RCS Id strings to executable files
 210    Added RPM Spec file for RPM package creation
 211    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 212    Fixed compilation for non-SGP architectures
 213    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 214    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 215         inverse_fourier construction of filters
 216    Added median to statistics and to auto-windowing
 217
 218 2.0.0-b8 - 8/1/00
 219    Added line color support to SGP
 220    Fixed lineAbs bug
 221
 222 2.0.0-b7 - 7/25/00
 223    Finished support for dmallocxx library
 224    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 225    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 226         G2 windows and well as WXWindows.
 227    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 228    Fixed row-plot bug in if-2
 229    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 230
 231 2.0.0-b6 - 7/22/00
 232    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 233         and projection files
 234    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 235         and reconstruction parameters dialogs
 236    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 237    Completely reorganized option processing in classes to improve
 238         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 239
 240 2.0.0-b5 - 7/17/00
 241    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 242    Started ctsim.tex document file
 243
 244 2.0.0-b4 - 7/13/00
 245    Fixed compiler warnings at -Wall level
 246    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 247    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 248    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 249
 250 2.0.0-b3 - 7/10/00
 251    Added highly optimized backprojection method idiff3
 252    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 253    Fixed image display in if2img using G2 library
 254    Added column-plot and row-plot options to if-2
 255    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 256    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 257         backprojection method. Currently, this technique is still under
 258         development and debugging
 259    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 260
 261 2.0.0-b2 - 7/07/00
 262    Cleaned up SignalFilter class
 263    Added zeropad option to pjrec
 264    Added zeropad options to html and cgi files
 265    Added fourier_table and rfttw filter methods
 266    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 267
 268 2.0.0-b1 - 7/05/00
 269    Updated trace level processing
 270    Added trace level to SignalFilter
 271    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 272
 273 1.9.9 - 7/04/00
 274    Fixed const issue with ImageFileArray
 275    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 276    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 277    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 278    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 279    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 280         between convolution, dft, & fft filtering
 281    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 282    Added support for FFTW library
 283
 284 1.9.8 - 6/27/2000
 285    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 286    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 287    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 288    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 289    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 290    Added signature tag and creation date/time to projection files
 291
 292 1.9.7 - 6/25/2000
 293    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 294         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 295         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 296    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 297    Rewrote ImageFile class
 298    Started support for dmallocxx library, not finished
 299    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 300    Updated ifinfo to show comparative statistics
 301    Added printLabels() to Array2dFile class
 302    Added printStatistics() to ImageFile class
 303
 304 1.9.6 - 6/22/2000
 305    Moved conversion filter name/id to Filter class
 306    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 307    Added MPI broadcasting of strings
 308
 309 1.9.5 - 6/21/2000
 310    Merged proj_reconstr into class Projections
 311    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 312    Code cleanup in projections.cpp
 313    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 314
 315 1.9.4 - 6/20/2000
 316    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 317    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 318    Converted filter and convolution to object-oriented code
 319    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 320    Optimized image file writing on little-endian architectures
 321    Updated README and INSTALL
 322
 323 1.9.3 - 6/19/2000
 324    Reorganized source files
 325    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 326
 327 1.9.2 - 6/18/2000
 328    Reorganized include files
 329    Fixed const pointers in strfuncs
 330
 331 1.9.1 - 6/16/2000
 332    Renamed directories, moved source files, combined source files
 333    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 334    and libctgraphics)
 335
 336 1.9.0 - 6/15/2000
 337    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 338    Renamed Raysums to Projections throughout files
 339    Renamed Detector to Scanner
 340    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 341
 342 0.6.1 - 6/12/2000
 343    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 344    Converted Detector to Object-Oriented
 345
 346 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 347    Improved Integer backprojection method
 348         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 349         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 350    Finished converting all C files to C++
 351    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 352    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 353
 354 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 355    Converted MPI data structures to C++ object
 356    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 357
 358 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 359    First C++ conversions
 360    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 361         - Now all data files are cross-platform compatible
 362    Converted from MPI to MPI++
 363    Converted backprojection to object-oriented
 364    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 365
 366 0.5.4 - 6/4/2000
 367    Simpilifed endian handling
 368
 369 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 370    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 371    Removed broken B-spline interpolation
 372    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 373    Added support for 16-bit PNG graphics
 374
 375 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 376    Added compile-time configuration of endian order
 377
 378 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 379    Modified the raysum file format to be platform independent
 380
 381 0.5.3 - 5/11/2000
 382    Added Microsoft VC compatibility
 383    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 384
 385 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 386    Continued conversion to ANSI C
 387    Removed old CRT routines
 388
 389 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 390    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 391    Continued code cleanup
 392
 393 0.5.2-b3 - 4/30/200
 394     More code cleanup with reorganizing libraries
 395     Added --log and --exp to sdf-1
 396     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 397
 398 0.5.2-b2 - 4/30/200
 399     Continued code cleanup
 400
 401 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 402     Fixed a few MPI bugs
 403     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 404
 405 0.5.1 - 4/28/2000
 406     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 407     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 408
 409 0.5.0 - 4/27/2000
 410     First open source distribution for GNU/Linux
 411
 412 6/1999
 413   Converted to GNU/Linux
 414   added MPI support via LAM library
 415
 416 1983-84
 417   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 418