ChangeLog

   1 3.1.0 - Released 2//01
   2
   3         * ctsim: Added tips to be displayed at startup and via the help menu.
   4
   5         * ctsim: Added generic threaded tasks and background manager for
   6         background processing as well as taking advantage of multiple-CPU's
   7         on SMP systems.
   8
   9         * ctsim: Added background and SMP processing for reconstructions.
  10
  11         * ctsim: Added background and SMP processing for scanning.
  12
  13         * ctsim: Added "Verbose Logging", "Startup Tips", and
  14         "Background processes" options  to Preferences dialog.
  15
  16         * ctsim: Added accelerator key for File-Properties
  17
  18         * views.cpp: Added out of memory checks to display for huge
  19         image and projection files.
  20
  21         * distribution: fixed problem with documentation files not
  22         being included with the distribution [Reported by Ian Kay].
  23
  24 3.0.3 - Released 2/20/01
  25
  26         * ctsim: Fixed core dump on Linux with OpenGL
  27
  28         * ctsim: Fixed context-sensitive help on Linux
  29
  30         * ctsim: Fixed About box on Linux
  31
  32 3.0.2 - Released 2/20/01
  33
  34         * scanner.cpp: Fixed bug when number of detectors was even.
  35
  36         * ctsim: Improved error handling when trying to convert
  37         divergent projections into polar form.
  38
  39 3.0.1 - Released 2/19/01
  40
  41         * ctsim: Fixed dialog box for reconstruction so that
  42         rotation angle setting will stay fixed in-between use
  43         of the dialog box.
  44
  45         * syserror: Fixed display bug for trace messages
  46
  47         * ctsim: MSVC optimization bug work-around, compiler
  48         options changed.
  49
  50 3.0.0 - Released 2/19/01
  51
  52         * ctsim: Massive update/fix to online help and print manual.
  53
  54         * ctsim: Added context-sensitive help to dialog boxes
  55
  56         * ctsim: Reformated all dialog boxes, much nicer now.
  57
  58         * ctsim: Improved accelerator key handling
  59
  60         * global: Added Hanning filter.
  61
  62         * global: Improved default parameters to that all defaults give
  63         sensible output.
  64
  65 3.0.0beta1 - Released 2/11/01
  66
  67         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
  68         registry storage between executions.
  69
  70         * ctsim: Hides arcane features unless enabled by Preferences dialog
  71
  72         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default for Windows.
  73
  74         * ctsim: Added 3-D wireframe view of images (uses OpenGL)
  75
  76         * ctsim: Added graphical About box
  77
  78         * ctsim: Escape key now removes cursor lines from image file view
  79
  80         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  81
  82         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  83
  84         * ctsim: Online help added!
  85
  86         * backprojector: Added cubic interpolation
  87
  88         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  89
  90         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  91         reconstruction dialogs.
  92
  93         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  94
  95         * global: Projection files are not compatible with previous version
  96         due to new scanner definitions.
  97
  98         * global: deleted concept of field-of-view and added
  99           view ratio and scan ratio concepts.
 100
 101         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
 102
 103         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
 104
 105         * phm2pj: Fixed MPI bug with broadcasting of variables
 106
 107         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
 108
 109
 110 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
 111
 112         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
 113         procsignal.cpp
 114
 115         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
 116         bug in parsing command-line parameters.
 117
 118         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
 119         plotfiles
 120
 121         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
 122
 123         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
 124
 125         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
 126         for frequency/inverse-fourier filtering
 127
 128 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
 129
 130         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
 131
 132         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
 133         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
 134
 135         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
 136         for math tips]
 137
 138         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
 139
 140         * ctsim: Added more analyze menuitems
 141
 142         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
 143         through this master shell. Has both command-line and interactive
 144         interface
 145
 146         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
 147
 148         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
 149
 150         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
 151
 152 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
 153
 154         * ctsim: Added plotting of histograms
 155
 156         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
 157
 158         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
 159
 160 3.0alpha2 - Released 1/02/01
 161
 162         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
 163
 164         * ctsim: added generation of filter images
 165
 166         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
 167
 168         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
 169
 170         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
 171
 172         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
 173         text files suitable for reading.
 174
 175         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
 176         when performing properties of images.
 177
 178         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 179         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 180         fourier.cpp
 181
 182         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 183         image math functions to complex-valued math.
 184
 185         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 186
 187 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 188
 189         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 190         and column plots and comparison plots
 191
 192         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 193
 194         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 195
 196         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 197         files.
 198
 199         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 200         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 201         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 202
 203         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 204         imagefile and plotfile classes.
 205
 206         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 207         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 208         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 209         images.
 210
 211         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 212         images.
 213
 214         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 215         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 216
 217         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 218         math functions
 219
 220         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 221
 222         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 223         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 224         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 225
 226         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 227         class.
 228
 229         * sgp: Added linestyle settings
 230
 231 2.5.0 - 12/18/00
 232    First Microsoft Windows GUI version
 233    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 234    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 235         when manually compiling phantoms that vary during projection
 236         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 237    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 238    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 239    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 240    Fixed display of plotting in Projection views
 241    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 242    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 243         "namespace using std" statements
 244    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 245    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 246
 247 2.0.6 - 12/03/00
 248    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 249    Updated README file
 250    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 251    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 252
 253 2.0.5 - 12/01/00
 254    Improved compilation on RedHat 7
 255    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 256    Removed README.RedHat7
 257
 258 2.0.4 - 11/25/00
 259    Added documentation for --geometry setting
 260    Added README.RedHat7 document
 261
 262 2.0.3 - 11/20/00
 263    Fixed bug in generation of binary PGM files
 264    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 265    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 266
 267 2.0.2 - 11/8/00
 268    Additions to man pages (Ian Kay)
 269    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 270
 271 2.0.1 - 10/1/00
 272    Fixed syntax error in fftw configuration
 273    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 274
 275 2.0.0 - 9/7/00
 276    Version 2.0.0 released!
 277    ctsim: Added Window menu to Main frame
 278    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 279    Fixed obscure bug in sys_error
 280    Fixed compilation in mingw environment not present
 281    Fixed compilation in non-graphical environments
 282
 283 2.0.0-b12 - 9/4/00
 284    ctsim: Added animation of reconstruction
 285    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 286    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 287    ctsim: used setpriority to set lower priority
 288    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 289    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 290
 291 2.0.0-b11 - 9/1/00
 292    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 293    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 294    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 295    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 296    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 297    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 298    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 299    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 300    Separated reconstruction into Reconstructor class
 301    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 302    Added --enable-static to generate statically linked programs
 303
 304 2.0.0-b10 - 8/25/00
 305    ctsim: Added animation of projection collection processs
 306    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 307    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 308    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 309    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 310    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 311    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 312    Fixed bug in backprojection selection
 313
 314 2.0.0-b9 - 8/22/00
 315    Added RCS Id strings to executable files
 316    Added RPM Spec file for RPM package creation
 317    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 318    Fixed compilation for non-SGP architectures
 319    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 320    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 321         inverse_fourier construction of filters
 322    Added median to statistics and to auto-windowing
 323
 324 2.0.0-b8 - 8/1/00
 325    Added line color support to SGP
 326    Fixed lineAbs bug
 327
 328 2.0.0-b7 - 7/25/00
 329    Finished support for dmallocxx library
 330    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 331    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 332         G2 windows and well as WXWindows.
 333    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 334    Fixed row-plot bug in if-2
 335    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 336
 337 2.0.0-b6 - 7/22/00
 338    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 339         and projection files
 340    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 341         and reconstruction parameters dialogs
 342    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 343    Completely reorganized option processing in classes to improve
 344         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 345
 346 2.0.0-b5 - 7/17/00
 347    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 348    Started ctsim.tex document file
 349
 350 2.0.0-b4 - 7/13/00
 351    Fixed compiler warnings at -Wall level
 352    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 353    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 354    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 355
 356 2.0.0-b3 - 7/10/00
 357    Added highly optimized backprojection method idiff3
 358    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 359    Fixed image display in if2img using G2 library
 360    Added column-plot and row-plot options to if-2
 361    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 362    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 363         backprojection method. Currently, this technique is still under
 364         development and debugging
 365    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 366
 367 2.0.0-b2 - 7/07/00
 368    Cleaned up SignalFilter class
 369    Added zeropad option to pjrec
 370    Added zeropad options to html and cgi files
 371    Added fourier_table and rfttw filter methods
 372    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 373
 374 2.0.0-b1 - 7/05/00
 375    Updated trace level processing
 376    Added trace level to SignalFilter
 377    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 378
 379 1.9.9 - 7/04/00
 380    Fixed const issue with ImageFileArray
 381    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 382    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 383    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 384    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 385    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 386         between convolution, dft, & fft filtering
 387    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 388    Added support for FFTW library
 389
 390 1.9.8 - 6/27/2000
 391    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 392    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 393    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 394    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 395    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 396    Added signature tag and creation date/time to projection files
 397
 398 1.9.7 - 6/25/2000
 399    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 400         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 401         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 402    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 403    Rewrote ImageFile class
 404    Started support for dmallocxx library, not finished
 405    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 406    Updated ifinfo to show comparative statistics
 407    Added printLabels() to Array2dFile class
 408    Added printStatistics() to ImageFile class
 409
 410 1.9.6 - 6/22/2000
 411    Moved conversion filter name/id to Filter class
 412    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 413    Added MPI broadcasting of strings
 414
 415 1.9.5 - 6/21/2000
 416    Merged proj_reconstr into class Projections
 417    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 418    Code cleanup in projections.cpp
 419    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 420
 421 1.9.4 - 6/20/2000
 422    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 423    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 424    Converted filter and convolution to object-oriented code
 425    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 426    Optimized image file writing on little-endian architectures
 427    Updated README and INSTALL
 428
 429 1.9.3 - 6/19/2000
 430    Reorganized source files
 431    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 432
 433 1.9.2 - 6/18/2000
 434    Reorganized include files
 435    Fixed const pointers in strfuncs
 436
 437 1.9.1 - 6/16/2000
 438    Renamed directories, moved source files, combined source files
 439    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 440    and libctgraphics)
 441
 442 1.9.0 - 6/15/2000
 443    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 444    Renamed Raysums to Projections throughout files
 445    Renamed Detector to Scanner
 446    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 447
 448 0.6.1 - 6/12/2000
 449    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 450    Converted Detector to Object-Oriented
 451
 452 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 453    Improved Integer backprojection method
 454         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 455         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 456    Finished converting all C files to C++
 457    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 458    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 459
 460 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 461    Converted MPI data structures to C++ object
 462    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 463
 464 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 465    First C++ conversions
 466    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 467         - Now all data files are cross-platform compatible
 468    Converted from MPI to MPI++
 469    Converted backprojection to object-oriented
 470    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 471
 472 0.5.4 - 6/4/2000
 473    Simpilifed endian handling
 474
 475 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 476    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 477    Removed broken B-spline interpolation
 478    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 479    Added support for 16-bit PNG graphics
 480
 481 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 482    Added compile-time configuration of endian order
 483
 484 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 485    Modified the raysum file format to be platform independent
 486
 487 0.5.3 - 5/11/2000
 488    Added Microsoft VC compatibility
 489    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 490
 491 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 492    Continued conversion to ANSI C
 493    Removed old CRT routines
 494
 495 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 496    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 497    Continued code cleanup
 498
 499 0.5.2-b3 - 4/30/200
 500     More code cleanup with reorganizing libraries
 501     Added --log and --exp to sdf-1
 502     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 503
 504 0.5.2-b2 - 4/30/200
 505     Continued code cleanup
 506
 507 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 508     Fixed a few MPI bugs
 509     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 510
 511 0.5.1 - 4/28/2000
 512     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 513     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 514
 515 0.5.0 - 4/27/2000
 516     First open source distribution for GNU/Linux
 517
 518 6/1999
 519   Converted to GNU/Linux
 520   added MPI support via LAM library
 521
 522 1983-84
 523   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 524