ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Online help added as well as HTML help
   4
   5         * ctsim: Added icons to Frames on Windows versions
   6
   7         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
   8
   9         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  10
  11 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  12
  13         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  14         procsignal.cpp
  15
  16         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  17         bug in parsing command-line parameters.
  18
  19         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  20         plotfiles
  21
  22         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  23
  24         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  25
  26         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  27         for frequency/inverse-fourier filtering
  28
  29 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  30
  31         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  32
  33         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  34         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  35
  36         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  37         for math tips]
  38
  39         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  40
  41         * ctsim: Added more analyze menuitems
  42
  43         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  44         through this master shell. Has both command-line and interactive
  45         interface
  46
  47         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  48
  49         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  50
  51         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  52
  53 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  54
  55         * ctsim: Added plotting of histograms
  56
  57         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  58
  59         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  60
  61 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  62
  63         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  64
  65         * ctsim: added generation of filter images
  66
  67         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  68
  69         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  70
  71         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  72
  73         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  74         text files suitable for reading.
  75
  76         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  77         when performing properties of images.
  78
  79         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  80         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  81         fourier.cpp
  82
  83         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  84         image math functions to complex-valued math.
  85
  86         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  87
  88 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  89
  90         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  91         and column plots and comparison plots
  92
  93         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  94
  95         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  96
  97         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  98         files.
  99
 100         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 101         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 102         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 103
 104         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 105         imagefile and plotfile classes.
 106
 107         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 108         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 109         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 110         images.
 111
 112         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 113         images.
 114
 115         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 116         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 117
 118         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 119         math functions
 120
 121         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 122
 123         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 124         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 125         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 126
 127         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 128         class.
 129
 130         * sgp: Added linestyle settings
 131
 132 2.5.0 - 12/18/00
 133    First Microsoft Windows GUI version
 134    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 135    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 136         when manually compiling phantoms that vary during projection
 137         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 138    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 139    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 140    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 141    Fixed display of plotting in Projection views
 142    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 143    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 144         "namespace using std" statements
 145    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 146    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 147
 148 2.0.6 - 12/03/00
 149    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 150    Updated README file
 151    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 152    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 153
 154 2.0.5 - 12/01/00
 155    Improved compilation on RedHat 7
 156    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 157    Removed README.RedHat7
 158
 159 2.0.4 - 11/25/00
 160    Added documentation for --geometry setting
 161    Added README.RedHat7 document
 162
 163 2.0.3 - 11/20/00
 164    Fixed bug in generation of binary PGM files
 165    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 166    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 167
 168 2.0.2 - 11/8/00
 169    Additions to man pages (Ian Kay)
 170    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 171
 172 2.0.1 - 10/1/00
 173    Fixed syntax error in fftw configuration
 174    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 175
 176 2.0.0 - 9/7/00
 177    Version 2.0.0 released!
 178    ctsim: Added Window menu to Main frame
 179    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 180    Fixed obscure bug in sys_error
 181    Fixed compilation in mingw environment not present
 182    Fixed compilation in non-graphical environments
 183
 184 2.0.0-b12 - 9/4/00
 185    ctsim: Added animation of reconstruction
 186    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 187    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 188    ctsim: used setpriority to set lower priority
 189    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 190    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 191
 192 2.0.0-b11 - 9/1/00
 193    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 194    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 195    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 196    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 197    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 198    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 199    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 200    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 201    Separated reconstruction into Reconstructor class
 202    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 203    Added --enable-static to generate statically linked programs
 204
 205 2.0.0-b10 - 8/25/00
 206    ctsim: Added animation of projection collection processs
 207    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 208    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 209    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 210    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 211    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 212    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 213    Fixed bug in backprojection selection
 214
 215 2.0.0-b9 - 8/22/00
 216    Added RCS Id strings to executable files
 217    Added RPM Spec file for RPM package creation
 218    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 219    Fixed compilation for non-SGP architectures
 220    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 221    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 222         inverse_fourier construction of filters
 223    Added median to statistics and to auto-windowing
 224
 225 2.0.0-b8 - 8/1/00
 226    Added line color support to SGP
 227    Fixed lineAbs bug
 228
 229 2.0.0-b7 - 7/25/00
 230    Finished support for dmallocxx library
 231    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 232    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 233         G2 windows and well as WXWindows.
 234    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 235    Fixed row-plot bug in if-2
 236    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 237
 238 2.0.0-b6 - 7/22/00
 239    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 240         and projection files
 241    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 242         and reconstruction parameters dialogs
 243    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 244    Completely reorganized option processing in classes to improve
 245         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 246
 247 2.0.0-b5 - 7/17/00
 248    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 249    Started ctsim.tex document file
 250
 251 2.0.0-b4 - 7/13/00
 252    Fixed compiler warnings at -Wall level
 253    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 254    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 255    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 256
 257 2.0.0-b3 - 7/10/00
 258    Added highly optimized backprojection method idiff3
 259    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 260    Fixed image display in if2img using G2 library
 261    Added column-plot and row-plot options to if-2
 262    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 263    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 264         backprojection method. Currently, this technique is still under
 265         development and debugging
 266    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 267
 268 2.0.0-b2 - 7/07/00
 269    Cleaned up SignalFilter class
 270    Added zeropad option to pjrec
 271    Added zeropad options to html and cgi files
 272    Added fourier_table and rfttw filter methods
 273    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 274
 275 2.0.0-b1 - 7/05/00
 276    Updated trace level processing
 277    Added trace level to SignalFilter
 278    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 279
 280 1.9.9 - 7/04/00
 281    Fixed const issue with ImageFileArray
 282    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 283    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 284    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 285    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 286    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 287         between convolution, dft, & fft filtering
 288    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 289    Added support for FFTW library
 290
 291 1.9.8 - 6/27/2000
 292    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 293    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 294    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 295    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 296    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 297    Added signature tag and creation date/time to projection files
 298
 299 1.9.7 - 6/25/2000
 300    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 301         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 302         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 303    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 304    Rewrote ImageFile class
 305    Started support for dmallocxx library, not finished
 306    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 307    Updated ifinfo to show comparative statistics
 308    Added printLabels() to Array2dFile class
 309    Added printStatistics() to ImageFile class
 310
 311 1.9.6 - 6/22/2000
 312    Moved conversion filter name/id to Filter class
 313    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 314    Added MPI broadcasting of strings
 315
 316 1.9.5 - 6/21/2000
 317    Merged proj_reconstr into class Projections
 318    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 319    Code cleanup in projections.cpp
 320    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 321
 322 1.9.4 - 6/20/2000
 323    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 324    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 325    Converted filter and convolution to object-oriented code
 326    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 327    Optimized image file writing on little-endian architectures
 328    Updated README and INSTALL
 329
 330 1.9.3 - 6/19/2000
 331    Reorganized source files
 332    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 333
 334 1.9.2 - 6/18/2000
 335    Reorganized include files
 336    Fixed const pointers in strfuncs
 337
 338 1.9.1 - 6/16/2000
 339    Renamed directories, moved source files, combined source files
 340    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 341    and libctgraphics)
 342
 343 1.9.0 - 6/15/2000
 344    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 345    Renamed Raysums to Projections throughout files
 346    Renamed Detector to Scanner
 347    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 348
 349 0.6.1 - 6/12/2000
 350    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 351    Converted Detector to Object-Oriented
 352
 353 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 354    Improved Integer backprojection method
 355         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 356         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 357    Finished converting all C files to C++
 358    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 359    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 360
 361 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 362    Converted MPI data structures to C++ object
 363    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 364
 365 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 366    First C++ conversions
 367    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 368         - Now all data files are cross-platform compatible
 369    Converted from MPI to MPI++
 370    Converted backprojection to object-oriented
 371    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 372
 373 0.5.4 - 6/4/2000
 374    Simpilifed endian handling
 375
 376 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 377    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 378    Removed broken B-spline interpolation
 379    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 380    Added support for 16-bit PNG graphics
 381
 382 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 383    Added compile-time configuration of endian order
 384
 385 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 386    Modified the raysum file format to be platform independent
 387
 388 0.5.3 - 5/11/2000
 389    Added Microsoft VC compatibility
 390    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 391
 392 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 393    Continued conversion to ANSI C
 394    Removed old CRT routines
 395
 396 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 397    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 398    Continued code cleanup
 399
 400 0.5.2-b3 - 4/30/200
 401     More code cleanup with reorganizing libraries
 402     Added --log and --exp to sdf-1
 403     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 404
 405 0.5.2-b2 - 4/30/200
 406     Continued code cleanup
 407
 408 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 409     Fixed a few MPI bugs
 410     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 411
 412 0.5.1 - 4/28/2000
 413     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 414     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 415
 416 0.5.0 - 4/27/2000
 417     First open source distribution for GNU/Linux
 418
 419 6/1999
 420   Converted to GNU/Linux
 421   added MPI support via LAM library
 422
 423 1983-84
 424   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 425