ChangeLog

   1 3.0.0beta1 - Released
   2
   3         * ctsim: Added most-recently-used files to File menu with
   4         registry storage between executions.
   5
   6         * ctsim: Added MDI interface for Windows version and made it default
   7
   8         * ctsim: Added graphical About box
   9
  10         * ctsim: Escape key now removes cursor from image files
  11
  12         * ctsim: Added Revert to ImageFile menu
  13
  14         * ctsim: Added accelerator (hotkeys) to frames
  15
  16         * ctsim: Online help added as well as HTML help
  17
  18         * ctsim: Added icons to Frames on X-Window and MS Windows versions
  19
  20         * ctsim: Fixed tick-label placement for plots on projection and
  21         reconstruction dialogs.
  22
  23         * timer.h: Add use of _ftime when compiling on MSVC
  24
  25         * ctsim: Fixed crash on shutdown bug
  26
  27         * pjinfo: Fixed bug when doing --dump and not specifing --endview
  28
  29         * ctsimtext-lam: Changes for first version to compile under lam
  30
  31 3.0.0alpha5 - Released 1/12/00
  32
  33         * ctsim: Added EZPlotDialog, used by debugging plots in
  34         procsignal.cpp
  35
  36         * ctsimtext: Fixed bugs for MSVC and with empty input lines. Fixed
  37         bug in parsing command-line parameters.
  38
  39         * views.cpp: Fixed bug in copying of labels from images to
  40         plotfiles
  41
  42         * syserror.cpp: fixed reporting for fatal errors
  43
  44         * projections.cpp: fixed MSVC failure with std:: namespace
  45
  46         * procsignal.cpp: fixed bug in equiangular reconstructions
  47         for frequency/inverse-fourier filtering
  48
  49 3.0.0alpha4 - Released 1/09/01
  50
  51         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
  52
  53         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
  54         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
  55
  56         * ctsim: improve bilinear scaling of image size [Thanks to Ian Kay
  57         for math tips]
  58
  59         * ctsim: imagefile labels are now copied to plotfiles
  60
  61         * ctsim: Added more analyze menuitems
  62
  63         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  64         through this master shell. Has both command-line and interactive
  65         interface
  66
  67         * ctsim: Fixed initialization of min/max bug for PlotFiles
  68
  69         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  70
  71         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  72
  73 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  74
  75         * ctsim: Added plotting of histograms
  76
  77         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  78
  79         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  80
  81 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  82
  83         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  84
  85         * ctsim: added generation of filter images
  86
  87         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  88
  89         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  90
  91         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  92
  93         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  94         text files suitable for reading.
  95
  96         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  97         when performing properties of images.
  98
  99         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
 100         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
 101         fourier.cpp
 102
 103         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
 104         image math functions to complex-valued math.
 105
 106         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
 107
 108 3.0alpha1 - Released 12/29/00
 109
 110         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
 111         and column plots and comparison plots
 112
 113         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
 114
 115         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
 116
 117         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
 118         files.
 119
 120         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
 121         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
 122         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
 123
 124         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
 125         imagefile and plotfile classes.
 126
 127         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
 128         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
 129         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
 130         images.
 131
 132         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
 133         images.
 134
 135         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
 136         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
 137
 138         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
 139         math functions
 140
 141         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
 142
 143         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
 144         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
 145         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
 146
 147         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
 148         class.
 149
 150         * sgp: Added linestyle settings
 151
 152 2.5.0 - 12/18/00
 153    First Microsoft Windows GUI version
 154    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 155    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 156         when manually compiling phantoms that vary during projection
 157         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 158    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 159    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 160    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 161    Fixed display of plotting in Projection views
 162    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 163    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 164         "namespace using std" statements
 165    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 166    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 167
 168 2.0.6 - 12/03/00
 169    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 170    Updated README file
 171    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 172    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 173
 174 2.0.5 - 12/01/00
 175    Improved compilation on RedHat 7
 176    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 177    Removed README.RedHat7
 178
 179 2.0.4 - 11/25/00
 180    Added documentation for --geometry setting
 181    Added README.RedHat7 document
 182
 183 2.0.3 - 11/20/00
 184    Fixed bug in generation of binary PGM files
 185    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 186    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 187
 188 2.0.2 - 11/8/00
 189    Additions to man pages (Ian Kay)
 190    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 191
 192 2.0.1 - 10/1/00
 193    Fixed syntax error in fftw configuration
 194    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 195
 196 2.0.0 - 9/7/00
 197    Version 2.0.0 released!
 198    ctsim: Added Window menu to Main frame
 199    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 200    Fixed obscure bug in sys_error
 201    Fixed compilation in mingw environment not present
 202    Fixed compilation in non-graphical environments
 203
 204 2.0.0-b12 - 9/4/00
 205    ctsim: Added animation of reconstruction
 206    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 207    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 208    ctsim: used setpriority to set lower priority
 209    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 210    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 211
 212 2.0.0-b11 - 9/1/00
 213    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 214    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 215    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 216    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 217    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 218    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 219    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 220    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 221    Separated reconstruction into Reconstructor class
 222    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 223    Added --enable-static to generate statically linked programs
 224
 225 2.0.0-b10 - 8/25/00
 226    ctsim: Added animation of projection collection processs
 227    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 228    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 229    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 230    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 231    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 232    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 233    Fixed bug in backprojection selection
 234
 235 2.0.0-b9 - 8/22/00
 236    Added RCS Id strings to executable files
 237    Added RPM Spec file for RPM package creation
 238    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 239    Fixed compilation for non-SGP architectures
 240    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 241    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 242         inverse_fourier construction of filters
 243    Added median to statistics and to auto-windowing
 244
 245 2.0.0-b8 - 8/1/00
 246    Added line color support to SGP
 247    Fixed lineAbs bug
 248
 249 2.0.0-b7 - 7/25/00
 250    Finished support for dmallocxx library
 251    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 252    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 253         G2 windows and well as WXWindows.
 254    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 255    Fixed row-plot bug in if-2
 256    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 257
 258 2.0.0-b6 - 7/22/00
 259    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 260         and projection files
 261    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 262         and reconstruction parameters dialogs
 263    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 264    Completely reorganized option processing in classes to improve
 265         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 266
 267 2.0.0-b5 - 7/17/00
 268    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 269    Started ctsim.tex document file
 270
 271 2.0.0-b4 - 7/13/00
 272    Fixed compiler warnings at -Wall level
 273    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 274    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 275    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 276
 277 2.0.0-b3 - 7/10/00
 278    Added highly optimized backprojection method idiff3
 279    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 280    Fixed image display in if2img using G2 library
 281    Added column-plot and row-plot options to if-2
 282    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 283    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 284         backprojection method. Currently, this technique is still under
 285         development and debugging
 286    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 287
 288 2.0.0-b2 - 7/07/00
 289    Cleaned up SignalFilter class
 290    Added zeropad option to pjrec
 291    Added zeropad options to html and cgi files
 292    Added fourier_table and rfttw filter methods
 293    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 294
 295 2.0.0-b1 - 7/05/00
 296    Updated trace level processing
 297    Added trace level to SignalFilter
 298    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 299
 300 1.9.9 - 7/04/00
 301    Fixed const issue with ImageFileArray
 302    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 303    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 304    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 305    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 306    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 307         between convolution, dft, & fft filtering
 308    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 309    Added support for FFTW library
 310
 311 1.9.8 - 6/27/2000
 312    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 313    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 314    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 315    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 316    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 317    Added signature tag and creation date/time to projection files
 318
 319 1.9.7 - 6/25/2000
 320    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 321         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 322         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 323    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 324    Rewrote ImageFile class
 325    Started support for dmallocxx library, not finished
 326    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 327    Updated ifinfo to show comparative statistics
 328    Added printLabels() to Array2dFile class
 329    Added printStatistics() to ImageFile class
 330
 331 1.9.6 - 6/22/2000
 332    Moved conversion filter name/id to Filter class
 333    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 334    Added MPI broadcasting of strings
 335
 336 1.9.5 - 6/21/2000
 337    Merged proj_reconstr into class Projections
 338    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 339    Code cleanup in projections.cpp
 340    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 341
 342 1.9.4 - 6/20/2000
 343    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 344    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 345    Converted filter and convolution to object-oriented code
 346    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 347    Optimized image file writing on little-endian architectures
 348    Updated README and INSTALL
 349
 350 1.9.3 - 6/19/2000
 351    Reorganized source files
 352    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 353
 354 1.9.2 - 6/18/2000
 355    Reorganized include files
 356    Fixed const pointers in strfuncs
 357
 358 1.9.1 - 6/16/2000
 359    Renamed directories, moved source files, combined source files
 360    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 361    and libctgraphics)
 362
 363 1.9.0 - 6/15/2000
 364    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 365    Renamed Raysums to Projections throughout files
 366    Renamed Detector to Scanner
 367    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 368
 369 0.6.1 - 6/12/2000
 370    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 371    Converted Detector to Object-Oriented
 372
 373 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 374    Improved Integer backprojection method
 375         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 376         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 377    Finished converting all C files to C++
 378    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 379    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 380
 381 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 382    Converted MPI data structures to C++ object
 383    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 384
 385 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 386    First C++ conversions
 387    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 388         - Now all data files are cross-platform compatible
 389    Converted from MPI to MPI++
 390    Converted backprojection to object-oriented
 391    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 392
 393 0.5.4 - 6/4/2000
 394    Simpilifed endian handling
 395
 396 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 397    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 398    Removed broken B-spline interpolation
 399    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 400    Added support for 16-bit PNG graphics
 401
 402 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 403    Added compile-time configuration of endian order
 404
 405 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 406    Modified the raysum file format to be platform independent
 407
 408 0.5.3 - 5/11/2000
 409    Added Microsoft VC compatibility
 410    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 411
 412 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 413    Continued conversion to ANSI C
 414    Removed old CRT routines
 415
 416 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 417    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 418    Continued code cleanup
 419
 420 0.5.2-b3 - 4/30/200
 421     More code cleanup with reorganizing libraries
 422     Added --log and --exp to sdf-1
 423     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 424
 425 0.5.2-b2 - 4/30/200
 426     Continued code cleanup
 427
 428 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 429     Fixed a few MPI bugs
 430     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 431
 432 0.5.1 - 4/28/2000
 433     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 434     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 435
 436 0.5.0 - 4/27/2000
 437     First open source distribution for GNU/Linux
 438
 439 6/1999
 440   Converted to GNU/Linux
 441   added MPI support via LAM library
 442
 443 1983-84
 444   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 445