ChangeLog

   1 3.0.0alpha4
   2
   3         * ctsim: Added reset to full-intensity scale menu item
   4
   5         * ctsim: Add conversion of projections to polar plot [Thanks to
   6         Ian Kay for reference and math hints in polar bilinear scaling]
   7
   8         * ctsim: improve bilinear scaling of image size
   9
  10         * ctsim: copies imagefile labels to plotfiles
  11
  12         * ctsim: Added more analyze menuitems
  13
  14         * ctsim: Fixed initialization of min/max for PlotFiles
  15
  16         * ctsimtext: First version. All command-line tools are now accessed
  17         through this master shell. Has both command-line and interactive
  18         interface
  19
  20         * ezplot: Cleaned up y-tick label placement
  21
  22         * sgp: Added better support for projection/reconstruction animation
  23
  24 3.0.0alpha3 - Released 1/02/01
  25
  26         * ctsim: Added plotting of histograms
  27
  28         * imagefile.cpp: fixed bug in generation of 16-bit PNG images
  29
  30         * ezplot.cpp: adjusted xtick label displays for better placement
  31
  32 3.0alpha2 - Released 1/02/01
  33
  34         * ctsim: All functions of command-line tools are now in graphical ctsim
  35
  36         * ctsim: added generation of filter images
  37
  38         * ctsim: Added 2-image math functions (mul, add, div, sub)
  39
  40         * ctsim: Added export of imagefiles to graphic file formats
  41
  42         * ctsim: Added support for scaling imagefiles in new sizes
  43
  44         * ctsim: Added ability to save standard phantom definitions as
  45         text files suitable for reading.
  46
  47         * ctsim: Add labels for image transformations and display of labels
  48         when performing properties of images.
  49
  50         * processsignal.cpp: Fixed "off by one" bug in
  51         shuffleNaturalToFourierOrder when n is even. Moved functions to
  52         fourier.cpp
  53
  54         * imagefile.cpp: Added FFTW library to imagefile processing. Converted
  55         image math functions to complex-valued math.
  56
  57         * phantom.cpp: Added ability to save phantom files as ASCII text.
  58
  59 3.0alpha1 - Released 12/29/00
  60
  61         * Added PlotFile class to system, used by if2 and ctsim for row
  62         and column plots and comparison plots
  63
  64         * ctsim: Added image comparison statistics and image subtraction
  65
  66         * ctsim: Added plotting of rows & columns with y-axis scaling
  67
  68         * ctsim: Added row and column plot comparisons between two image
  69         files.
  70
  71         * ctsim: Added "Process" menu to image file display with math
  72         functions. Added 2-dimensional inverse Fourier to math
  73         functions. Added support for complex (real/imaginary) images.
  74
  75         * mathfuncs.cpp: Reworked statistics algorithm to share between
  76         imagefile and plotfile classes.
  77
  78         * imagefile.cpp: Fixed scaling bug when rasterizing Phantom with
  79         nsamples > 2.  Added generic mage math functions, moved from
  80         if1.cpp and if2.cpp to imagefile.cpp. Added support complex
  81         images.
  82
  83         * array2dfile.cpp: Added code to support complex (real/imaginary)
  84         images.
  85
  86         * if1: Updated to handle error conditions, such as sqrt of a
  87         negative number. Converted to use new ImageFile math functions.
  88
  89         * if2: Updated to output plot files and use new ImageFile class
  90         math functions
  91
  92         * if1: Updated to use new ImageFile class math functions
  93
  94         * ezplot: Reworked to better store colors/linestyles/symbols with
  95         individual curves. Improved display of labels and ticks. Updated
  96         to use POL class member variable. Updated to more C++ conventions.
  97
  98         * pol: converted to C++ class. Extracted HashTable to separate
  99         class.
 100
 101         * sgp: Added linestyle settings
 102
 103 2.5.0 - 12/18/00
 104    First Microsoft Windows GUI version
 105    Modifications for Microsoft Visual C++ compilation.
 106    Improved pjinfo to output binary headers and view data, useful
 107         when manually compiling phantoms that vary during projection
 108         process. Thanks to Ian Kay for idea and code submission.
 109    Improved sorting to find median in ImageFile::statistics
 110    Fixed core-dump bug in Array2dFile::labelsCopy() function (Ian Kay)
 111    Changed reconstruction dialog to fix onto smaller screens
 112    Fixed display of plotting in Projection views
 113    Improved animation displays for Projections and Reconstructions
 114    Changed code to explicitly use std:: namespace rather than
 115         "namespace using std" statements
 116    Fixed reconstruction scaling bug introduced in 2.0.6
 117    Renamed if2img to ifexport, if-1 to if1, if-2 to if2
 118
 119 2.0.6 - 12/03/00
 120    Fixed minor compilation problem with procsignal.h
 121    Updated README file
 122    Fixed bug when simulating projections and Trace == CONSOLE
 123    Fixed scaling bug when performing redundant rotations around object
 124
 125 2.0.5 - 12/01/00
 126    Improved compilation on RedHat 7
 127    Changed some of ANSI C header files to C++ header files
 128    Removed README.RedHat7
 129
 130 2.0.4 - 11/25/00
 131    Added documentation for --geometry setting
 132    Added README.RedHat7 document
 133
 134 2.0.3 - 11/20/00
 135    Fixed bug in generation of binary PGM files
 136    Fixed MPI compilation bug in phm2pj.cpp
 137    Inverted y-axis output for pj2if (bug alert from Ian Kay)
 138
 139 2.0.2 - 11/8/00
 140    Additions to man pages (Ian Kay)
 141    Fix problem with reading of ASCII phantom files (Ian Kay)
 142
 143 2.0.1 - 10/1/00
 144    Fixed syntax error in fftw configuration
 145    Slight modifications to support gcc v2.9.6
 146
 147 2.0.0 - 9/7/00
 148    Version 2.0.0 released!
 149    ctsim: Added Window menu to Main frame
 150    ctsim: Disabled not support reconstruction method
 151    Fixed obscure bug in sys_error
 152    Fixed compilation in mingw environment not present
 153    Fixed compilation in non-graphical environments
 154
 155 2.0.0-b12 - 9/4/00
 156    ctsim: Added animation of reconstruction
 157    ctsim: Added saving of dialog parameters for Projection & Reconstruction
 158    ctsim: Added progress dialog for rasterization of phantom
 159    ctsim: used setpriority to set lower priority
 160    ctsim: fixed pReconstruct not being deleted causing scaling problem
 161    ctsim: fixed projection animation dialog buttons
 162
 163 2.0.0-b11 - 9/1/00
 164    ctsim: Added projection graph to animation of projection collection
 165    ctsim: Added single stepping to projection collection animation
 166    ctsim: improved File/Properties display for projection files
 167    ctsim: Added progress dialog for reconstructions
 168    ctsim: Added file labels for projection and reconstruction images
 169    ctsim: Made File/Properties bring up modal dialogs
 170    Added reconstruction for Equilinear and Equiangular geometries
 171    Changed theta to be -PI/2 to make compliant with Kak-Slaney formulas
 172    Separated reconstruction into Reconstructor class
 173    Fixed center of detector adjustment for even number of detectors
 174    Added --enable-static to generate statically linked programs
 175
 176 2.0.0-b10 - 8/25/00
 177    ctsim: Added animation of projection collection processs
 178    ctsim: Added Auto Scaling for image windows
 179    ctsim: Change menus from "windowing" to "display scaling"
 180    Added FieldOfView and FocalLength ratio parameters to projection collection
 181    Added FocalLength & FieldOfView fields to projection data files
 182    Added Projection collection for Equilinear and Equiangular geometries
 183    Changed name of Rowland Phantom to correct name of Shepp-Logan
 184    Fixed bug in backprojection selection
 185
 186 2.0.0-b9 - 8/22/00
 187    Added RCS Id strings to executable files
 188    Added RPM Spec file for RPM package creation
 189    Added loading of ASCII phanthom definitions from files
 190    Fixed compilation for non-SGP architectures
 191    Decomposed SignalFilter class into ProcessSignal and SignalFilter classes
 192    Added Filter-Generation option to reconstruction to allow direct or
 193         inverse_fourier construction of filters
 194    Added median to statistics and to auto-windowing
 195
 196 2.0.0-b8 - 8/1/00
 197    Added line color support to SGP
 198    Fixed lineAbs bug
 199
 200 2.0.0-b7 - 7/25/00
 201    Finished support for dmallocxx library
 202    Fixed bug in SignalFilter::convertFilterMethodNameToID()
 203    Rewrote SGP & EZPlot to use C++ object-oriented. SGP can now write to
 204         G2 windows and well as WXWindows.
 205    ctsim program: "Create Phantom" now shows phantom object
 206    Fixed row-plot bug in if-2
 207    Reworked EZPlot's multiple plot operation
 208
 209 2.0.0-b6 - 7/22/00
 210    ctsim program: improved initial size and scroll area for image
 211         and projection files
 212    ctsim program: added rasterization parameters, projections parameters,
 213         and reconstruction parameters dialogs
 214    Moved char[] static definition from header files to c++ files
 215    Completely reorganized option processing in classes to improve
 216         expandability and to assist ctsim graphical user interface.
 217
 218 2.0.0-b5 - 7/17/00
 219    ctsim program: Added dialog to set minimum/maximum display levels
 220    Started ctsim.tex document file
 221
 222 2.0.0-b4 - 7/13/00
 223    Fixed compiler warnings at -Wall level
 224    Began work on CTSim program to be graphical front-end of all functions
 225    Moved current src/*.cpp to tools/*.cpp
 226    Made CTSim graphical front-end's home to be src/
 227
 228 2.0.0-b3 - 7/10/00
 229    Added highly optimized backprojection method idiff3
 230    Moved comparative stats to if-2 program from ifinfo
 231    Fixed image display in if2img using G2 library
 232    Added column-plot and row-plot options to if-2
 233    Added autoselection of analytic/calculated spatial responses to SignalFilter
 234    Added frequency-based preinterpolation to SignalFilter and idiff3
 235         backprojection method. Currently, this technique is still under
 236         development and debugging
 237    Moved graphic file writing to ImageFile class from if2img program
 238
 239 2.0.0-b2 - 7/07/00
 240    Cleaned up SignalFilter class
 241    Added zeropad option to pjrec
 242    Added zeropad options to html and cgi files
 243    Added fourier_table and rfttw filter methods
 244    Added FFTW routines to use real/half-complex transformations
 245
 246 2.0.0-b1 - 7/05/00
 247    Updated trace level processing
 248    Added trace level to SignalFilter
 249    Fixed magnitude vs. real output bug in FFT/Fourier filter
 250
 251 1.9.9 - 7/04/00
 252    Fixed const issue with ImageFileArray
 253    Fixed Array2dFile::labelsCopy()
 254    Added copy constructor and assignment for Array2dFileLabel class
 255    Added Timer to if-2.cpp and ifinfo.cpp
 256    Added beginning of frequency-based (DFT & FFT) filter to SignalFilter
 257    Added option processing for filter-method for pjrec to choose
 258         between convolution, dft, & fft filtering
 259    Fixed format string for EZPlot so axis labels now print
 260    Added support for FFTW library
 261
 262 1.9.8 - 6/27/2000
 263    Rewrote Array2dFile class to be non-templated
 264    Rewrote Array2dFile class to make reads and writes atomic. No disk files are kept open.
 265    Rewrote Array2dFileLabel class to make members private, added access routines
 266    Removed timedate.cpp in favor of standard C library time/date functions
 267    Renamed ctrec to pjrec, sample-ctrec.sh to sample-ctsim
 268    Added signature tag and creation date/time to projection files
 269
 270 1.9.7 - 6/25/2000
 271    Standardized string option processing by classes. All classes use character strings
 272         to select options rather than numeric constants. Added fail() and failMessage()
 273         methods to verify that objects are created correctly by character strings.
 274    Hid C++ assignment and copy constructors in classes that should not have assignment/copy
 275    Rewrote ImageFile class
 276    Started support for dmallocxx library, not finished
 277    Added G.T. Herman image comparision statistics to ifinfo (see imagefile.cpp)
 278    Updated ifinfo to show comparative statistics
 279    Added printLabels() to Array2dFile class
 280    Added printStatistics() to ImageFile class
 281
 282 1.9.6 - 6/22/2000
 283    Moved conversion filter name/id to Filter class
 284    Moved conversion backprojection name/id to Backproj class
 285    Added MPI broadcasting of strings
 286
 287 1.9.5 - 6/21/2000
 288    Merged proj_reconstr into class Projections
 289    Used auto_ptr in Projections::reconstruct to make sure destructor is always called
 290    Code cleanup in projections.cpp
 291    Moved conversion of phantom names/id to Phantom class
 292
 293 1.9.4 - 6/20/2000
 294    Converted projection files to C++ library with frnetorderstream
 295    Converted image files to C++ library with frnetorderstream
 296    Converted filter and convolution to object-oriented code
 297    Changed default image file to float from double -- Changable in imagefile.h
 298    Optimized image file writing on little-endian architectures
 299    Updated README and INSTALL
 300
 301 1.9.3 - 6/19/2000
 302    Reorganized source files
 303    MPI bug fixed to phm2pj.cpp
 304
 305 1.9.2 - 6/18/2000
 306    Reorganized include files
 307    Fixed const pointers in strfuncs
 308
 309 1.9.1 - 6/16/2000
 310    Renamed directories, moved source files, combined source files
 311    to change from 6 libraries to 3 libraries (libctsim, libctsupport,
 312    and libctgraphics)
 313
 314 1.9.0 - 6/15/2000
 315    Skip versions to make version 2.0 the first fully C++ version
 316    Renamed Raysums to Projections throughout files
 317    Renamed Detector to Scanner
 318    Converted Scanner and Projecions to full object-oriented
 319
 320 0.6.1 - 6/12/2000
 321    Converted Phantom and PhantomElements to Object-Oriented
 322    Converted Detector to Object-Oriented
 323
 324 0.6.0-b3 - 6/10/2000
 325    Improved Integer backprojection method
 326         Fixed nearest neighbor to be truly nearest neighbor
 327         Made linear interpolation more integer arithmetic -> speed improvement
 328    Finished converting all C files to C++
 329    Converted all use of malloc/free to C++ new/delete
 330    Began object-oriented conversion of Phantom and Projection structures
 331
 332 0.6.0-b2 - 6/8/2000
 333    Converted MPI data structures to C++ object
 334    Made ImageFile directly inherit from Array2dFile
 335
 336 0.6.0-b1 - 6/6/2000
 337    First C++ conversions
 338    Portable IF (image file) format implemented with objects (SDF removed)
 339         - Now all data files are cross-platform compatible
 340    Converted from MPI to MPI++
 341    Converted backprojection to object-oriented
 342    Removed MTX from libkmath as no longer need -- replaced with C++ matrices
 343
 344 0.5.4 - 6/4/2000
 345    Simpilifed endian handling
 346
 347 0.5.4-b3 - 6/1/2000
 348    Added support for 64-bit (IA64) CPU
 349    Removed broken B-spline interpolation
 350    Added support for cygwin platform under Windows 2000
 351    Added support for 16-bit PNG graphics
 352
 353 0.5.4-b2 - 5/16/2000
 354    Added compile-time configuration of endian order
 355
 356 0.5.4-b1 - 5/14/2000
 357    Modified the raysum file format to be platform independent
 358
 359 0.5.3 - 5/11/2000
 360    Added Microsoft VC compatibility
 361    Cleaned up compilation warnings in libgraph
 362
 363 0.5.2-b5 - 5/7/2000
 364    Continued conversion to ANSI C
 365    Removed old CRT routines
 366
 367 0.5.2-b4 - 5/4/2000
 368    Renamed pictures to phantoms, objects to phantom elements
 369    Continued code cleanup
 370
 371 0.5.2-b3 - 4/30/200
 372     More code cleanup with reorganizing libraries
 373     Added --log and --exp to sdf-1
 374     Allowed negative numbers for window levels in CGI interface
 375
 376 0.5.2-b2 - 4/30/200
 377     Continued code cleanup
 378
 379 0.5.2-b1 - 4/29/2000
 380     Fixed a few MPI bugs
 381     Better documented, coded raysum in-memory on on-disk options
 382
 383 0.5.1 - 4/28/2000
 384     Cleaned out library that wasn't being used by CTSim
 385     Modified ctsim.cgi to read in configuration file ctsim.conf
 386
 387 0.5.0 - 4/27/2000
 388     First open source distribution for GNU/Linux
 389
 390 6/1999
 391   Converted to GNU/Linux
 392   added MPI support via LAM library
 393
 394 1983-84
 395   Developed under MS-DOS and IBM EGA graphics
 396