man/pjrec.1

   1 .\"  -*- NROFF -*-
   2 .TH pjrec 1
   3
   4 .SH NAME
   5 pjrec - reconstruction from projections
   6
   7 .SH SYNOPSIS
   8 .B pjrec projection-file image-file nx-image ny-image [OPTIONS]
   9
  10 .SH DESCRIPTION
  11 \fIpjrec\fP takes projection data from \fIraysum-file\P and produces an
  12 (IF) image file \fIimage-file\fP, of size \fInx-image\fP by
  13 \fIny-image\fP pixels, containing the reconstructed image.
  14
  15 .SH OPTIONS
  16 \fIpjrec\fP accepts the following options, which control the
  17 reconstruction algorithm:
  18 .TP 12
  19 .B \-\-interp
  20 Interpolation method during backprojection
  21 .RS
  22 .TP
  23 .B nearest
  24 Nearest neighbor interpolation
  25 .TP
  26 .B linear
  27 Linear interpolation
  28 .RE
  29 .TP 12
  30 .B \-\-preinterpolate
  31 Preinterpolation factor (default = 1).  Used only with frequency-based
  32 filtering
  33 .TP 12
  34 .B \-\-filter
  35 Filter name
  36 .RS
  37 .TP 15
  38 .B abs_bandlimit
  39 Abs * Bandlimiting (default)
  40 .TP 15
  41 .B abs_sinc
  42 Abs * Sinc
  43 .TP 15
  44 .B abs_cosine
  45 Abs * Cosine
  46 .TP 15
  47 .B abs_hamming
  48 Abs * Hamming
  49 .TP 15
  50 .B shepp
  51 Shepp-Logan
  52 .TP 15
  53 .B bandlimit
  54 Bandlimiting
  55 .TP 15
  56 .B sinc
  57 Sinc
  58 .TP 15
  59 .B cosine
  60 Cosine
  61 .TP 15
  62 .B triangle
  63 Triangle
  64 .TP 15
  65 .B hamming
  66 Hamming
  67 .RE
  68 .TP 12
  69 .B \-\-filter-method
  70 Filter method before backprojections
  71 .RS
  72 .TP 15
  73 .B convolution
  74 Spatial filtering (default)
  75 .TP 15
  76 .B fourier
  77 Frequency filtering with discete fourier
  78 .TP 15
  79 .B fourier_table
  80 Frequency filtering with table lookup fourier
  81 .TP 15
  82 .B fft
  83 Fast Fourier Transform
  84 .RE
  85 .TP 12
  86 .B \-\-zeropad n
  87 Set zeropad level (default = 0).  set n to number of powers to two to pad
  88 .TP 12
  89 .B \-\-filter-generation
  90 Filter Generation mode
  91 .RS
  92 .TP 12
  93 .B direct
  94 Use direct filter in spatial or frequency domain (default)
  95 .TP 12
  96 .B inverse_fourier
  97 Use inverse fourier transform of inverse filter
  98 .RE
  99 .TP 12
 100 .B \-\-backproj
 101 Backprojection Method
 102 .RS
 103 .TP
 104 .B trig
 105 Trigometric functions at every point
 106 .TP
 107 .B table
 108 Trigometric functions with precalculated table
 109 .TP
 110 .B diff
 111 Difference method
 112 .TP
 113 .B diff2
 114 Optimized difference method (default)
 115 .TP
 116 .B idiff2
 117 Optimized difference method with integer math
 118 .TP
 119 .B idiff3
 120 Highly-optimized difference method with integer math
 121 .RE
 122 .TP 12
 123 .B \-\-filter-param
 124 Alpha level for Hamming filter
 125 .TP 12
 126 .B \-\-trace
 127 Set tracing to level:
 128 .RS
 129 .TP 12
 130 .B none
 131 No tracing (default)
 132 .TP 12
 133 .B console
 134 Text level tracing
 135 .TP 12
 136 .B phantom
 137 Trace phantom
 138 .TP 12
 139 .B proj
 140 Trace allrays
 141 .TP 12
 142 .B plot
 143 Trace plotting
 144 .TP 12
 145 .B clipping
 146 Trace clipping
 147 .RE
 148 .TP 12
 149 .B \-\-verbose      Turn on verbose mode
 150 .TP 12
 151 .B \-\-debug        Turn on debug mode
 152 .TP 12
 153 .B \-\-version      Print version
 154 .TP 12
 155 .B \-\-help         Print a terse help message
 156
 157 .SH AUTHORS
 158 Kevin Rosenberg, M.D. <kevin@rosenberg.net>
 159
 160 .SH HISTORY
 161 .Nm pjrec
 162 was first written in 1983 using MS-DOS and an EGA display adapter. In 1999 it was ported to GNU/Linux and later ported to Microsoft Windows.
 163
 164 .SH SEE ALSO
 165 .BR ctsim (1), ifinfo (1), if1 (1), if2 (1), ifexport (1), phm2pj (1), phm2if (1), pj2if (1), pjinfo (1)