src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.121 2001/02/27 03:59:30 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 #include "wx/wxprec.h"
  29 #ifndef WX_PRECOMP
  30 #include "wx/wx.h"
  31 #endif
  32
  33 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  34 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  35 #endif
  36
  37 #include "wx/image.h"
  38 #include "wx/progdlg.h"
  39
  40 #include "ct.h"
  41 #include "ctsim.h"
  42 #include "docs.h"
  43 #include "views.h"
  44 #include "dialogs.h"
  45 #include "dlgprojections.h"
  46 #include "dlgreconstruct.h"
  47 #include "backprojectors.h"
  48 #include "reconstruct.h"
  49 #include "timer.h"
  50 #include "threadproj.h"
  51 #include "threadrecon.h"
  52 #include "threadraster.h"
  53
  54 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  55 #include <sstream>
  56 #else
  57 #include <sstream_subst>
  58 #endif
  59
  60
  61 // ImageFileCanvas
  62
  63 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  64 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  65 EVT_CHAR(ImageFileCanvas::OnChar)
  66 END_EVENT_TABLE()
  67
  68
  69 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  70 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
  71 {
  72 }
  73
  74 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
  75 {
  76   m_pView = NULL;
  77 }
  78
  79 void
  80 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  81 {
  82   if (m_pView)
  83     m_pView->OnDraw(& dc);
  84 }
  85
  86 void
  87 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  88 {
  89   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  90   int nx = rIF.nx();
  91   int ny = rIF.ny();
  92
  93   int yPt = ny - y - 1;
  94   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  95   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  96   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  97   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  98   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
  99 }
 100
 101 bool
 102 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 103 {
 104   x = m_xCursor;
 105   y = m_yCursor;
 106
 107   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 108     return true;
 109   else
 110     return false;
 111 }
 112
 113 void
 114 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 115 {
 116   if (! m_pView)
 117     return;
 118
 119
 120   wxClientDC dc(this);
 121   PrepareDC(dc);
 122
 123   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 124
 125   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 126   if (! pIFDoc)
 127     return;
 128   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 129   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 130   int nx = rIF.nx();
 131   int ny = rIF.ny();
 132   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 133   if (event.RightIsDown()) {
 134     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 135       std::ostringstream os;
 136       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 137       if (rIF.isComplex()) {
 138         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 139         if (dImag < 0)
 140           os << " - " << -dImag;
 141         else
 142           os << " + " << dImag;
 143         os << "i\n";
 144       } else
 145         os << "\n";
 146       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 147     } else
 148       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 149   }
 150   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 151     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 152       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 153         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 154       }
 155       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 156       m_xCursor = pt.x;
 157       m_yCursor = yPt;
 158       wxMenu* pMenu = m_pView->getMenuAnalyze();
 159       if (pMenu && ! pMenu->IsEnabled(IFMENU_PLOT_ROW)) {
 160         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, true);
 161         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_COL, true);
 162         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, true);
 163         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, true);
 164         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, true);
 165         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, true);
 166       }
 167     } else
 168       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 169   }
 170   if (event.LeftUp()) {
 171     std::ostringstream os;
 172     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 173     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 174   }
 175 }
 176
 177 void
 178 ImageFileCanvas::OnChar (wxKeyEvent& event)
 179 {
 180   if (event.GetKeyCode() == WXK_ESCAPE) {
 181     m_xCursor = -1;
 182     m_yCursor = -1;
 183     if (m_pView)
 184       m_pView->OnUpdate (NULL);
 185   } else
 186     wxScrolledWindow::OnChar (event);
 187 }
 188
 189 wxSize
 190 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 191 {
 192   if (! m_pView)
 193     return wxSize(0,0);
 194
 195   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 196   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
 197 }
 198
 199
 200 // ImageFileView
 201
 202 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 203
 204 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 205 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 206 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 207 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 208 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 209 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 210 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 211 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 212 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 213 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 214 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 215 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 216 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 217 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 218 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 219 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 220 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 221 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 222 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 223 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 224 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 225 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 226 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 227 #if wxUSE_GLCANVAS
 228 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, ImageFileView::OnConvert3d)
 229 #endif
 230 #ifdef HAVE_FFT
 231 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 232 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 233 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 234 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 235 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 236 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 237 #endif
 238 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 239 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 240 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 241 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 242 #ifdef HAVE_FFT
 243 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 244 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 245 #endif
 246 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 247 END_EVENT_TABLE()
 248
 249 ImageFileView::ImageFileView()
 250 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 251 {
 252   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 253 }
 254
 255 ImageFileView::~ImageFileView()
 256 {
 257   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
 258   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
 259 }
 260
 261
 262 void
 263 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 264 {
 265   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 266   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 267     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 268   else {
 269     const std::string rFilename = m_pFrame->GetTitle().c_str();
 270     std::ostringstream os;
 271     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 272     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 273     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 274     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 275     os << "Data type: ";
 276     if (rIF.isComplex())
 277       os << "Complex\n";
 278     else
 279       os << "Real\n";
 280     os << "Minimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 281     if (rIF.isComplex()) {
 282       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 283       os << "Imaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 284     }
 285     if (rIF.nLabels() > 0) {
 286       rIF.printLabelsBrief (os);
 287     }
 288     *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 289     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 290     dialogMsg.ShowModal();
 291   }
 292 }
 293
 294 void
 295 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 296 {
 297   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 298   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 299   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 300   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 301   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 302   if (iRetVal == wxID_OK) {
 303     m_bMinSpecified = true;
 304     m_bMaxSpecified = true;
 305     double dMin, dMax;
 306     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 307       m_dMinPixel = dMin;
 308       m_dMaxPixel = dMax;
 309       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 310       OnUpdate (this, NULL);
 311     }
 312   }
 313 }
 314
 315 void
 316 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 317 {
 318   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 319   double min, max;
 320   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 321     rIF.getMinMax (min, max);
 322
 323   if (m_bMinSpecified)
 324     min = m_dMinPixel;
 325   if (m_bMaxSpecified)
 326     max = m_dMaxPixel;
 327
 328   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 329   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 330   if (retVal == wxID_OK) {
 331     m_bMinSpecified = true;
 332     m_bMaxSpecified = true;
 333     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 334     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 335     OnUpdate (this, NULL);
 336   }
 337 }
 338
 339 void
 340 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 341 {
 342   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 343     m_bMinSpecified = false;
 344     m_bMaxSpecified = false;
 345     OnUpdate (this, NULL);
 346   }
 347 }
 348
 349 void
 350 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 351 {
 352   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 353   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 354
 355   if (vecIF.size() == 0) {
 356     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 357   } else {
 358     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
 359
 360     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 361       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 362       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 363       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 364       std::ostringstream os;
 365       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 366       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 367       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 368       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 369       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 370       double d, r, e;
 371       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 372       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 373       *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 374       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 375         ImageFile* pDifferenceImage = new ImageFile;
 376
 377         pDifferenceImage->setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 378         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, *pDifferenceImage)) {
 379           *theApp->getLog() << "Unable to subtract images\n";
 380           delete pDifferenceImage;
 381           return;
 382         }
 383         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
 384         if (! pDifferenceDoc) {
 385           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 386           return;
 387         }
 388         pDifferenceDoc->setImageFile (pDifferenceImage);
 389
 390         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 391         pDifferenceImage->labelsCopy (rIF, s.c_str());
 392         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 393         pDifferenceImage->labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 394         std::ostringstream osLabel;
 395         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 396           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 397           << os.str().c_str();
 398         pDifferenceImage->labelAdd (os.str().c_str());
 399         if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 400           pDifferenceDoc->Modify (true);
 401         pDifferenceDoc->UpdateAllViews (this);
 402         pDifferenceDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 403         pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 404       }
 405       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 406     }
 407   }
 408 }
 409
 410 void
 411 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 412 {
 413   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 414   rIF.invertPixelValues (rIF);
 415   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 416   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 417     GetDocument()->Modify (true);
 418   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 419 }
 420
 421 void
 422 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 423 {
 424   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 425   rIF.square (rIF);
 426   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 427   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 428     GetDocument()->Modify (true);
 429   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 430 }
 431
 432 void
 433 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 434 {
 435   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 436   rIF.sqrt (rIF);
 437   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 438   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 439     GetDocument()->Modify (true);
 440   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 441 }
 442
 443 void
 444 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 445 {
 446   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 447   rIF.log (rIF);
 448   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 449   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 450     GetDocument()->Modify (true);
 451   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 452 }
 453
 454 void
 455 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 456 {
 457   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 458   rIF.exp (rIF);
 459   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 460   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 461     GetDocument()->Modify (true);
 462   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 463 }
 464
 465 void
 466 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 467 {
 468   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 469   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 470
 471   if (vecIF.size() == 0) {
 472     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 473   } else {
 474     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
 475
 476     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 477       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 478       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 479       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 480       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 481       if (! pNewDoc) {
 482         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 483         return;
 484       }
 485       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 486       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 487       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 488       std::ostringstream os;
 489       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 490         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 491       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 492       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 493       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 494       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 495       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 496       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 497       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 498         pNewDoc->Modify (true);
 499       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 500       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 501       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 502     }
 503   }
 504 }
 505
 506 void
 507 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 508 {
 509   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 510   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 511
 512   if (vecIF.size() == 0) {
 513     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 514   } else {
 515     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 516
 517     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 518       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 519       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 520       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 521       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 522       if (! pNewDoc) {
 523         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 524         return;
 525       }
 526       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 527       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 528       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 529       std::ostringstream os;
 530       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 531         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 532       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 533       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 534       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 535       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 536       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 537       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 538       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 539         pNewDoc->Modify (true);
 540       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 541       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 542       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 543     }
 544   }
 545 }
 546
 547 void
 548 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 549 {
 550   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 551   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 552
 553   if (vecIF.size() == 0) {
 554     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 555   } else {
 556     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 557
 558     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 559       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 560       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 561       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 562       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 563       if (! pNewDoc) {
 564         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 565         return;
 566       }
 567       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 568       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 569       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 570       std::ostringstream os;
 571       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 572         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 573       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 574       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 575       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 576       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 577       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 578       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 579       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 580         pNewDoc->Modify (true);
 581       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 582       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 583       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 584     }
 585   }
 586 }
 587
 588 void
 589 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 590 {
 591   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 592   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 593
 594   if (vecIF.size() == 0) {
 595     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 596   } else {
 597     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
 598
 599     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 600       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 601       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 602       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 603       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 604       if (! pNewDoc) {
 605         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 606         return;
 607       }
 608       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 609       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 610       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 611       std::ostringstream os;
 612       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 613         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 614       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 615       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 616       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 617       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 618       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 619       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 620       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 621         pNewDoc->Modify (true);
 622       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 623       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 624       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 625     }
 626   }
 627 }
 628
 629
 630 #ifdef HAVE_FFT
 631 void
 632 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 633 {
 634   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 635   rIF.fft (rIF);
 636   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 637   m_bMinSpecified = false;
 638   m_bMaxSpecified = false;
 639   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 640     GetDocument()->Modify (true);
 641   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 642 }
 643
 644 void
 645 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 646 {
 647   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 648   rIF.ifft (rIF);
 649   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 650   m_bMinSpecified = false;
 651   m_bMaxSpecified = false;
 652   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 653     GetDocument()->Modify (true);
 654   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 655 }
 656
 657 void
 658 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 659 {
 660   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 661   rIF.fftRows (rIF);
 662   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 663   m_bMinSpecified = false;
 664   m_bMaxSpecified = false;
 665   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 666     GetDocument()->Modify (true);
 667   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 668 }
 669
 670 void
 671 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 672 {
 673   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 674   rIF.ifftRows (rIF);
 675   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 676   m_bMinSpecified = false;
 677   m_bMaxSpecified = false;
 678   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 679     GetDocument()->Modify (true);
 680   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 681 }
 682
 683 void
 684 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 685 {
 686   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 687   rIF.fftCols (rIF);
 688   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 689   m_bMinSpecified = false;
 690   m_bMaxSpecified = false;
 691   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 692     GetDocument()->Modify (true);
 693   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 694 }
 695
 696 void
 697 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 698 {
 699   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 700   rIF.ifftCols (rIF);
 701   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 702   m_bMinSpecified = false;
 703   m_bMaxSpecified = false;
 704   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 705     GetDocument()->Modify (true);
 706   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 707 }
 708 #endif
 709
 710 void
 711 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 712 {
 713   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 714   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 715   rIF.fourier (rIF);
 716   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 717   m_bMinSpecified = false;
 718   m_bMaxSpecified = false;
 719   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 720     GetDocument()->Modify (true);
 721   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 722 }
 723
 724 void
 725 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 726 {
 727   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 728   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 729   rIF.inverseFourier (rIF);
 730   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 731   m_bMinSpecified = false;
 732   m_bMaxSpecified = false;
 733   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 734     GetDocument()->Modify (true);
 735   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 736 }
 737
 738 void
 739 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 740 {
 741   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 742   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 743   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 744   m_bMinSpecified = false;
 745   m_bMaxSpecified = false;
 746   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 747     GetDocument()->Modify (true);
 748   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 749 }
 750
 751 void
 752 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 753 {
 754   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 755   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 756   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 757   m_bMinSpecified = false;
 758   m_bMaxSpecified = false;
 759   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 760     GetDocument()->Modify (true);
 761   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 762 }
 763
 764 void
 765 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 766 {
 767   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 768   if (rIF.isComplex()) {
 769     rIF.magnitude (rIF);
 770     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 771     m_bMinSpecified = false;
 772     m_bMaxSpecified = false;
 773     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 774       GetDocument()->Modify (true);
 775     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 776   }
 777 }
 778
 779 void
 780 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 781 {
 782   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 783   if (rIF.isComplex()) {
 784     rIF.phase (rIF);
 785     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 786     m_bMinSpecified = false;
 787     m_bMaxSpecified = false;
 788     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 789       GetDocument()->Modify (true);
 790     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 791   }
 792 }
 793
 794
 795 ImageFileCanvas*
 796 ImageFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
 797 {
 798   ImageFileCanvas* pCanvas;
 799   int width, height;
 800   parent->GetClientSize(&width, &height);
 801
 802   pCanvas = new ImageFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 803
 804   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 805   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 806   pCanvas->Clear();
 807
 808   return pCanvas;
 809 }
 810
 811 #if CTSIM_MDI
 812 wxDocMDIChildFrame*
 813 #else
 814 wxDocChildFrame*
 815 #endif
 816 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 817 {
 818 #if CTSIM_MDI
 819   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 820 #else
 821   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 822 #endif
 823   theApp->setIconForFrame (subframe);
 824
 825   m_pFileMenu = new wxMenu;
 826
 827   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
 828   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
 829   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
 830   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
 831   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 832   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
 833   m_pFileMenu->Append(wxID_REVERT, "Re&vert");
 834
 835   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 836   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
 837   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 838
 839   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 840   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 841   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 842   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Preview");
 843 #ifdef CTSIM_MDI
 844   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 845   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
 846   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
 847 #endif
 848   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
 849   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
 850
 851   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 852   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
 853   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
 854   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
 855
 856   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 857   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 858   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 859   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 860   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 861   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 862   filter_menu->AppendSeparator();
 863 #ifdef HAVE_FFT
 864   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2-D &FFT");
 865   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2-D &IFFT");
 866   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 867   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 868   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 869   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 870   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "2-D F&ourier");
 871   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "2-D Inverse Fo&urier");
 872 #else
 873   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 874   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 875 #endif
 876   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 877   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 878   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 879   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 880
 881   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 882   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 883   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 884   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 885   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 886   image_menu->AppendSeparator();
 887   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 888 #if wxUSE_GLCANVAS
 889   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, "Convert &3-D\tCtrl-3");
 890 #endif
 891
 892   m_pMenuAnalyze = new wxMenu;
 893   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 894   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 895   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 896   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 897   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "P&lot FFT Row");
 898   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plo&t FFT Column");
 899   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 900   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 901   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare Ro&w");
 902   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare Colu&mn");
 903   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, false);
 904   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_COL, false);
 905   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, false);
 906   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, false);
 907   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, false);
 908   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, false);
 909
 910   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 911   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
 912   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
 913   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
 914   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 915
 916   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 917
 918   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
 919   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 920   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 921   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 922   menu_bar->Append(m_pMenuAnalyze, "&Analyze");
 923   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 924
 925   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 926
 927   subframe->Centre(wxBOTH);
 928
 929   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
 930   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
 931   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
 932   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
 933   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), IFMENU_FILE_PROPERTIES);
 934 #if wxUSE_GLCANVAS
 935   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('3'), IFMENU_IMAGE_CONVERT3D);
 936   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
 937 #else
 938   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
 939 #endif
 940
 941   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
 942
 943   return subframe;
 944 }
 945
 946
 947 bool
 948 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 949 {
 950   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
 951
 952   m_bMinSpecified = false;
 953   m_bMaxSpecified = false;
 954   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 955
 956   int width, height;
 957   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
 958   m_pFrame->SetTitle("ImageFileView");
 959   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
 960
 961   int x, y;  // X requires a forced resize
 962   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
 963   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
 964   m_pFrame->SetFocus();
 965   m_pFrame->Show(true);
 966   Activate(true);
 967
 968   return true;
 969 }
 970
 971 void
 972 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 973 {
 974   wxSize sizeWindow = m_pFrame->GetClientSize();
 975   wxSize sizeBest = m_pCanvas->GetBestSize();
 976   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
 977     m_pFrame->SetClientSize (sizeBest);
 978
 979   if (m_bitmap.Ok())
 980     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 981
 982   int xCursor, yCursor;
 983   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 984     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 985 }
 986
 987
 988 void
 989 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 990 {
 991   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 992   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 993   int nx = rIF.nx();
 994   int ny = rIF.ny();
 995   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 996     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 997       double min, max;
 998       rIF.getMinMax (min, max);
 999       if (! m_bMinSpecified)
1000         m_dMinPixel = min;
1001       if (! m_bMaxSpecified)
1002         m_dMaxPixel = max;
1003     }
1004     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
1005
1006     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
1007     if (! imageData) {
1008       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for Image display");
1009       return;
1010     }
1011     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
1012       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1013         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
1014         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
1015         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
1016         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
1017         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
1018       }
1019     }
1020     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
1021     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
1022     delete imageData;
1023     int xSize = nx;
1024     int ySize = ny;
1025     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
1026     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
1027     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
1028     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1029   }
1030
1031   if (m_pCanvas)
1032     m_pCanvas->Refresh();
1033 }
1034
1035 bool
1036 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1037 {
1038   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
1039   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1040     return false;
1041
1042   Activate (false);
1043   if (m_pCanvas) {
1044     m_pCanvas->setView(NULL);
1045     m_pCanvas = NULL;
1046   }
1047   wxString s(theApp->GetAppName());
1048   if (m_pFrame)
1049     m_pFrame->SetTitle(s);
1050
1051   SetFrame(NULL);
1052
1053   if (deleteWindow) {
1054     delete m_pFrame;
1055     m_pFrame = NULL;
1056     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
1057       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
1058   }
1059
1060   return true;
1061 }
1062
1063 void
1064 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1065 {
1066   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1067   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1068   int nx = rIF.nx();
1069   int ny = rIF.ny();
1070   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1071     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1072       double min, max;
1073       rIF.getMinMax (min, max);
1074       if (! m_bMinSpecified)
1075         m_dMinPixel = min;
1076       if (! m_bMaxSpecified)
1077         m_dMaxPixel = max;
1078     }
1079
1080     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1081     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1082       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1083       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1084
1085       wxString strExt;
1086       wxString strWildcard;
1087       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
1088         strExt = ".pgm";
1089         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1090       }
1091 #ifdef HAVE_PNG
1092       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
1093         strExt = ".png";
1094         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1095       }
1096 #endif
1097
1098       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1099         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1100       if (strFilename) {
1101         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1102         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1103       }
1104     }
1105   }
1106 }
1107
1108 void
1109 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1110 {
1111   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1112   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1113   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1114
1115   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1116   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1117     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1118     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1119     std::ostringstream os;
1120     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1121     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1122     if (! pScaledDoc) {
1123       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1124       return;
1125     }
1126     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1127     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1128     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1129     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1130     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1131     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1132     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1133       pScaledDoc->Modify (true);
1134     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1135     pScaledDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1136     pScaledDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1137   }
1138 }
1139
1140 #if wxUSE_GLCANVAS
1141 void
1142 ImageFileView::OnConvert3d (wxCommandEvent& event)
1143 {
1144   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1145   Graph3dFileDocument* pGraph3d = theApp->newGraph3dDoc();
1146   pGraph3d->setBadFileOpen();
1147   pGraph3d->createFromImageFile (rIF);
1148   pGraph3d->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1149   pGraph3d->UpdateAllViews();
1150   pGraph3d->getView()->getFrame()->SetClientSize (400, 400);
1151   pGraph3d->getView()->getFrame()->Show (true);
1152   GetDocumentManager()->ActivateView (pGraph3d->getView(), true, false);
1153   ::wxYield();
1154   pGraph3d->getView()->getCanvas()->SetFocus();
1155 }
1156 #endif
1157
1158 void
1159 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1160 {
1161   int xCursor, yCursor;
1162   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1163     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1164     return;
1165   }
1166
1167   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1168   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1169   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1170   int nx = rIF.nx();
1171   int ny = rIF.ny();
1172
1173   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1174     double* pX = new double [nx];
1175     double* pYReal = new double [nx];
1176     double *pYImag = NULL;
1177     double *pYMag = NULL;
1178     if (rIF.isComplex()) {
1179       pYImag = new double [nx];
1180       pYMag = new double [nx];
1181     }
1182     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1183       pX[i] = i;
1184       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1185       if (rIF.isComplex()) {
1186         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1187         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1188       }
1189     }
1190     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1191     if (! pPlotDoc) {
1192       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1193     } else {
1194       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1195       std::ostringstream os;
1196       os << "Row " << yCursor;
1197       std::string title("title ");
1198       title += os.str();
1199       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1200       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1201       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1202       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1203       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1204       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1205       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1206       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1207       if (rIF.isComplex()) {
1208         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1209         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1210         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1211         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1212         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1213         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1214         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1215         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1216       } else
1217         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1218       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1219       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1220       if (rIF.isComplex()) {
1221         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1222         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1223       }
1224       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1225         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1226       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1227       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1228       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1229     }
1230     delete pX;
1231     delete pYReal;
1232     if (rIF.isComplex()) {
1233       delete pYImag;
1234       delete pYMag;
1235     }
1236     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1237       pPlotDoc->Modify (true);
1238     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1239     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1240     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1241   }
1242 }
1243
1244 void
1245 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1246 {
1247   int xCursor, yCursor;
1248   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1249     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1250     return;
1251   }
1252
1253   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1254   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1255   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1256   int nx = rIF.nx();
1257   int ny = rIF.ny();
1258
1259   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1260     double* pX = new double [ny];
1261     double* pYReal = new double [ny];
1262     double* pYImag = NULL;
1263     double* pYMag = NULL;
1264     if (rIF.isComplex()) {
1265       pYImag = new double [ny];
1266       pYMag = new double [ny];
1267     }
1268     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1269       pX[i] = i;
1270       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1271       if (rIF.isComplex()) {
1272         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1273         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1274       }
1275     }
1276     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1277     if (! pPlotDoc) {
1278       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1279     } else {
1280       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1281       std::ostringstream os;
1282       os << "Column " << xCursor;
1283       std::string title("title ");
1284       title += os.str();
1285       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1286       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1287       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1288       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1289       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1290       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1291       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1292       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1293       if (rIF.isComplex()) {
1294         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1295         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1296         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1297         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1298         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1299         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1300         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1301         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1302       } else
1303         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1304       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1305       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1306       if (rIF.isComplex()) {
1307         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1308         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1309       }
1310       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1311         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1312       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1313       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1314       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1315     }
1316     delete pX;
1317     delete pYReal;
1318     if (rIF.isComplex()) {
1319       delete pYImag;
1320       delete pYMag;
1321     }
1322     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1323       pPlotDoc->Modify (true);
1324     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1325     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1326     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1327   }
1328 }
1329
1330 #ifdef HAVE_FFT
1331 void
1332 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1333 {
1334   int xCursor, yCursor;
1335   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1336     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1337     return;
1338   }
1339
1340   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1341   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1342   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1343   int nx = rIF.nx();
1344   int ny = rIF.ny();
1345
1346   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1347     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1348
1349     int i;
1350     for (i = 0; i < nx; i++) {
1351       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1352       if (rIF.isComplex())
1353         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1354       else
1355         pcIn[i].im = 0;
1356     }
1357
1358     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1359     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1360     fftw_destroy_plan (plan);
1361
1362     double* pX = new double [nx];
1363     double* pYReal = new double [nx];
1364     double* pYImag = new double [nx];
1365     double* pYMag = new double [nx];
1366     for (i = 0; i < nx; i++) {
1367       pX[i] = i;
1368       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1369       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1370       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1371     }
1372     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1373     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1374     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1375
1376     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1377     if (! pPlotDoc) {
1378       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1379     } else {
1380       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1381       std::ostringstream os;
1382       os << "Row " << yCursor;
1383       std::string title("title ");
1384       title += os.str();
1385       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1386       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1387       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1388       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1389       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1390       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1391       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1392       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1393       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1394       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1395       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1396       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1397       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1398       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1399       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1400       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1401       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1402       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1403       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1404       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1405       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1406         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1407       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1408       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1409       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1410     }
1411     delete pX;
1412     delete pYReal;
1413     delete pYImag;
1414     delete pYMag;
1415     delete [] pcIn;
1416
1417     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1418       pPlotDoc->Modify (true);
1419     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1420     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1421     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1422   }
1423 }
1424
1425 void
1426 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1427 {
1428   int xCursor, yCursor;
1429   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1430     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1431     return;
1432   }
1433
1434   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1435   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1436   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1437   int nx = rIF.nx();
1438   int ny = rIF.ny();
1439
1440   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1441     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1442     double *pdTemp = new double [ny];
1443
1444     int i;
1445     for (i = 0; i < ny; i++)
1446       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1447     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1448     for (i = 0; i < ny; i++)
1449       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1450
1451     for (i = 0; i < ny; i++) {
1452       if (rIF.isComplex())
1453         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1454       else
1455         pdTemp[i] = 0;
1456     }
1457     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1458     for (i = 0; i < ny; i++)
1459       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1460
1461     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1462     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1463     fftw_destroy_plan (plan);
1464
1465     double* pX = new double [ny];
1466     double* pYReal = new double [ny];
1467     double* pYImag = new double [ny];
1468     double* pYMag = new double [ny];
1469     for (i = 0; i < ny; i++) {
1470       pX[i] = i;
1471       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1472       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1473       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1474     }
1475
1476     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1477     if (! pPlotDoc) {
1478       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1479     } else {
1480       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1481       std::ostringstream os;
1482       os << "Column " << xCursor;
1483       std::string title("title ");
1484       title += os.str();
1485       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1486       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1487       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1488       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1489       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1490       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1491       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1492       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1493       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1494       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1495       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1496       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1497       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1498       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1499       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1500       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1501       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1502       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1503       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1504       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1505       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1506         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1507       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1508       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1509       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1510     }
1511     delete pX;
1512     delete pYReal;
1513     delete pYImag;
1514     delete pYMag;
1515     delete pdTemp;
1516     delete [] pcIn;
1517
1518     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1519       pPlotDoc->Modify (true);
1520     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1521     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1522     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1523   }
1524 }
1525 #endif
1526
1527 void
1528 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1529 {
1530   int xCursor, yCursor;
1531   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1532     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1533     return;
1534   }
1535
1536   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1537   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1538   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1539     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1540     return;
1541   }
1542   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1543
1544   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1545     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1546     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1547     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1548
1549     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1550     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1551     int nx = rIF.nx();
1552     int ny = rIF.ny();
1553
1554     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1555       double* pX = new double [ny];
1556       double* pY1 = new double [ny];
1557       double* pY2 = new double [ny];
1558       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1559         pX[i] = i;
1560         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1561         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1562       }
1563       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1564       if (! pPlotDoc) {
1565         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1566       } else {
1567         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1568         std::ostringstream os;
1569         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1570         std::string title("title ");
1571         title += os.str();
1572         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1573         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1574         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1575         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1576         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1577         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1578         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1579         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1580         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1581         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1582         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1583         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1584         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1585         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1586         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1587
1588         unsigned int iL;
1589         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1590           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1591           s += ": ";
1592           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1593           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1594         }
1595         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1596           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1597           s += ": ";
1598           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1599           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1600         }
1601         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1602           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1603         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1604         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1605       }
1606       delete pX;
1607       delete pY1;
1608       delete pY2;
1609       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1610         pPlotDoc->Modify (true);
1611       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1612       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1613       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1614     }
1615   }
1616 }
1617
1618 void
1619 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1620 {
1621   int xCursor, yCursor;
1622   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1623     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1624     return;
1625   }
1626
1627   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1628   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1629
1630   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1631     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1632     return;
1633   }
1634
1635   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1636
1637   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1638     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1639     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1640     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1641
1642     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1643     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1644     int nx = rIF.nx();
1645     int ny = rIF.ny();
1646
1647     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1648       double* pX = new double [nx];
1649       double* pY1 = new double [nx];
1650       double* pY2 = new double [nx];
1651       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1652         pX[i] = i;
1653         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1654         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1655       }
1656       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1657       if (! pPlotDoc) {
1658         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1659       } else {
1660         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1661         std::ostringstream os;
1662         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1663         std::string title("title ");
1664         title += os.str();
1665         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1666         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1667         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1668         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1669         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1670         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1671         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1672         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1673         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1674         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1675         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1676         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1677         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1678         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1679         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1680         unsigned int iL;
1681         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1682           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1683           s += ": ";
1684           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1685           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1686         }
1687         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1688           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1689           s += ": ";
1690           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1691           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1692         }
1693         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1694           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1695         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1696         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1697       }
1698       delete pX;
1699       delete pY1;
1700       delete pY2;
1701       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1702         pPlotDoc->Modify (true);
1703       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1704       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1705       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1706     }
1707   }
1708 }
1709
1710 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1711
1712 void
1713 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1714 {
1715   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1716   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1717   int nx = rIF.nx();
1718   int ny = rIF.ny();
1719
1720   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1721     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1722     if (! pPlotDoc) {
1723       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1724       return;
1725     }
1726
1727     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1728     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1729     double dMin, dMax;
1730     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1731     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1732
1733     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1734       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1735       pY[i] = 0;
1736     }
1737     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1738       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1739         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1740         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1741           pY[iBin] += 1;
1742       }
1743
1744       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1745       std::ostringstream os;
1746       os << "Histogram";
1747       std::string title("title ");
1748       title += os.str();
1749       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1750       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1751       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1752       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1753       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1754       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1755       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1756       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1757       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1758         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1759         s += ": ";
1760         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1761         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1762       }
1763       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1764       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1765       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1766       delete pX;
1767       delete pY;
1768       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1769         pPlotDoc->Modify (true);
1770       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1771       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1772       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1773   }
1774 }
1775
1776
1777 // PhantomCanvas
1778
1779 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1780 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1781 {
1782   m_pView = v;
1783 }
1784
1785 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1786 {
1787   m_pView = NULL;
1788 }
1789
1790 void
1791 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1792 {
1793   if (m_pView)
1794     m_pView->OnDraw(& dc);
1795 }
1796
1797 wxSize
1798 PhantomCanvas::GetBestSize() const
1799 {
1800   if (! m_pView)
1801     return wxSize(0,0);
1802
1803   int xSize, ySize;
1804   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
1805   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
1806   ySize = xSize = (xSize / 4);
1807   return wxSize (xSize, ySize);
1808 }
1809
1810
1811
1812 // PhantomFileView
1813
1814 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
1815
1816 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
1817 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
1818 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
1819 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
1820 END_EVENT_TABLE()
1821
1822 PhantomFileView::PhantomFileView()
1823 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
1824 {
1825 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
1826   m_iDefaultNDet = 165;
1827   m_iDefaultNView = 180;
1828 #else
1829   m_iDefaultNDet = 367;
1830   m_iDefaultNView = 320;
1831 #endif
1832   m_iDefaultNSample = 2;
1833   m_dDefaultRotation = 1;
1834   m_dDefaultFocalLength = 2;
1835   m_dDefaultViewRatio = 1;
1836   m_dDefaultScanRatio = 1;
1837   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1838   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1839
1840 #ifdef DEBUG
1841   m_iDefaultRasterNX = 115;
1842   m_iDefaultRasterNY = 115;
1843   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1844 #else
1845   m_iDefaultRasterNX = 256;
1846   m_iDefaultRasterNY = 256;
1847   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1848 #endif
1849   m_dDefaultRasterViewRatio = 1;
1850 }
1851
1852 PhantomFileView::~PhantomFileView()
1853 {
1854   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
1855   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
1856 }
1857
1858 void
1859 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1860 {
1861   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1862   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1863   std::ostringstream os;
1864   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1865   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1866   rPhantom.printDefinitions (os);
1867 #if DEBUG
1868   rPhantom.print (os);
1869 #endif
1870   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
1871   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1872 }
1873
1874
1875 void
1876 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1877 {
1878   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(),
1879     m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation,
1880     m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio, m_iDefaultGeometry,
1881     m_iDefaultTrace);
1882   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1883   if (retVal != wxID_OK)
1884     return;
1885
1886   m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1887   m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1888   m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1889   m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1890   m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1891   m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1892   m_dDefaultViewRatio = dialogProjection.getViewRatio();
1893   m_dDefaultScanRatio = dialogProjection.getScanRatio();
1894   wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1895   m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1896   double dRotationRadians = m_dDefaultRotation;
1897   m_dDefaultRotation /= TWOPI;  // convert back to fraction of a circle
1898
1899   if (m_iDefaultNDet <= 0 || m_iDefaultNView <= 0 || sGeometry == "")
1900     return;
1901
1902   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1903   Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample,
1904     dRotationRadians, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio);
1905   if (theScanner.fail()) {
1906     wxString msg = "Failed making scanner\n";
1907     msg += theScanner.failMessage().c_str();
1908     *theApp->getLog() << msg << "\n";
1909     wxMessageBox (msg, "Error");
1910     return;
1911   }
1912
1913   std::ostringstream os;
1914   os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet
1915     << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample
1916     << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength
1917     << ", ViewRatio=" << m_dDefaultViewRatio << ", ScanRatio=" << m_dDefaultScanRatio
1918     << ", Geometry=" << sGeometry.c_str() << ", FanBeamAngle=" <<
1919     convertRadiansToDegrees (theScanner.fanBeamAngle());
1920
1921   Timer timer;
1922   Projections* pProj = NULL;
1923   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1924     pProj = new Projections;
1925     pProj->initFromScanner (theScanner);
1926
1927     ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, *pProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1928     for (int iView = 0; iView < pProj->nView(); iView++) {
1929       ::wxYield();
1930       if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1931         delete pProj;
1932         return;
1933       }
1934       ::wxYield();
1935       while (dialogProjections.isPaused()) {
1936         ::wxYield();
1937         ::wxUsleep(50);
1938       }
1939     }
1940   } else {
1941     if (theApp->getUseBackgroundTasks() || theApp->getNumberCPU() > 1) {
1942       ProjectorSupervisorThread* pProjector = new ProjectorSupervisorThread (this, m_iDefaultNDet,
1943         m_iDefaultNView, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNSample, dRotationRadians,
1944         m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio, os.str().c_str());
1945       if (pProjector->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
1946         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating projector thread");
1947         delete pProjector;
1948         return;
1949       }
1950       pProjector->SetPriority(60);
1951       pProjector->Run();
1952       return;
1953     } else {
1954       pProj = new Projections;
1955       pProj->initFromScanner (theScanner);
1956       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), pProj->nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
1957       for (int i = 0; i < pProj->nView(); i++) {
1958         theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1959         if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1960           delete pProj;
1961           return;
1962         }
1963       }
1964     }
1965   }
1966
1967   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1968   pProj->setRemark (os.str());
1969   pProj->setCalcTime (timer.timerEnd());
1970
1971   ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
1972   if (! pProjectionDoc) {
1973     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1974     return;
1975   }
1976   pProjectionDoc->setProjections (pProj);
1977   ProjectionFileView* projView = pProjectionDoc->getView();
1978   if (projView) {
1979     projView->OnUpdate (projView, NULL);
1980     if (projView->getCanvas())
1981       projView->getCanvas()->SetClientSize (m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView);
1982     if (wxFrame* pFrame = projView->getFrame()) {
1983       pFrame->Show(true);
1984       pFrame->SetFocus();
1985       pFrame->Raise();
1986     }
1987     GetDocumentManager()->ActivateView (projView, true, false);
1988   }
1989   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1990     pProjectionDoc-> Modify(true);
1991   pProjectionDoc->UpdateAllViews (this);
1992 }
1993
1994
1995 void
1996 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1997 {
1998   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
1999     m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio);
2000   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
2001   if (retVal != wxID_OK)
2002     return;
2003
2004   m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
2005   m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
2006   m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
2007   m_dDefaultRasterViewRatio = dialogRaster.getViewRatio();
2008   if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
2009     m_iDefaultRasterNSamples = 1;
2010   if (m_dDefaultRasterViewRatio < 0)
2011     m_dDefaultRasterViewRatio = 0;
2012   if (m_iDefaultRasterNX <= 0 || m_iDefaultRasterNY <= 0)
2013     return;
2014
2015   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2016   std::ostringstream os;
2017   os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
2018     << m_iDefaultRasterNY << ", ViewRatio=" << m_dDefaultRasterViewRatio << ", nSamples="
2019     << m_iDefaultRasterNSamples;;
2020
2021   if (theApp->getUseBackgroundTasks() || theApp->getNumberCPU() > 1) {
2022     RasterizerSupervisorThread* pThread = new RasterizerSupervisorThread (this, m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
2023       m_dDefaultRasterViewRatio, m_iDefaultRasterNSamples, os.str().c_str());
2024     if (pThread->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2025       *theApp->getLog() << "Error creating rasterizer thread\n";
2026       return;
2027     }
2028     pThread->SetPriority (60);
2029     pThread->Run();
2030   } else {
2031     ImageFile* pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY);
2032     wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"),
2033       pImageFile->nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2034     Timer timer;
2035     for (unsigned int i = 0; i < pImageFile->nx(); i++) {
2036       rPhantom.convertToImagefile (*pImageFile, m_dDefaultRasterViewRatio, m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
2037       if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
2038         delete pImageFile;
2039         return;
2040       }
2041     }
2042
2043     ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
2044     if (! pRasterDoc) {
2045       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2046       return;
2047     }
2048     pRasterDoc->setImageFile (pImageFile);
2049     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2050       pRasterDoc->Modify (true);
2051     pRasterDoc->UpdateAllViews (this);
2052     pRasterDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2053     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2054     pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
2055     ImageFileView* rasterView = pRasterDoc->getView();
2056     if (rasterView) {
2057       rasterView->getFrame()->SetFocus();
2058       rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2059     }
2060   }
2061 }
2062
2063
2064 PhantomCanvas*
2065 PhantomFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2066 {
2067   PhantomCanvas* pCanvas;
2068
2069   pCanvas = new PhantomCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(0,0), 0);
2070   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2071   pCanvas->Clear();
2072
2073   return pCanvas;
2074 }
2075
2076 #if CTSIM_MDI
2077 wxDocMDIChildFrame*
2078 #else
2079 wxDocChildFrame*
2080 #endif
2081 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2082 {
2083 #if CTSIM_MDI
2084   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2085 #else
2086   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2087 #endif
2088   theApp->setIconForFrame (subframe);
2089
2090   m_pFileMenu = new wxMenu;
2091
2092   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2093   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2094   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2095   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2096   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2097
2098   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2099   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2100
2101   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2102   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2103   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2104   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2105 #ifdef CTSIM_MDI
2106   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2107   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2108   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2109 #endif
2110   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2111   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2112
2113   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
2114   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
2115   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
2116
2117   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2118   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2119   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2120   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2121   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2122
2123   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2124
2125   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2126   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
2127   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2128
2129   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2130   subframe->Centre(wxBOTH);
2131
2132   wxAcceleratorEntry accelEntries[3];
2133   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2134   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2135   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PHMMENU_FILE_PROPERTIES);
2136   wxAcceleratorTable accelTable (3, accelEntries);
2137   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2138
2139   return subframe;
2140 }
2141
2142
2143 bool
2144 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2145 {
2146   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2147   SetFrame(m_pFrame);
2148   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2149   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2150   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2151
2152   m_pFrame->SetTitle ("PhantomFileView");
2153
2154 #ifdef __X__
2155   int x, y;  // X requires a forced resize
2156   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2157   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2158 #endif
2159
2160   m_pFrame->Show(true);
2161   Activate(true);
2162
2163   return true;
2164 }
2165
2166 void
2167 PhantomFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2168 {
2169   if (m_pCanvas)
2170     m_pCanvas->Refresh();
2171 }
2172
2173 bool
2174 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2175 {
2176   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2177   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2178     return false;
2179
2180   Activate(false);
2181   if (m_pCanvas) {
2182     m_pCanvas->setView(NULL);
2183     m_pCanvas = NULL;
2184   }
2185   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2186   if (m_pFrame)
2187     m_pFrame->SetTitle(s);
2188
2189   SetFrame(NULL);
2190
2191   if (deleteWindow) {
2192     delete m_pFrame;
2193     m_pFrame = NULL;
2194     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2195       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2196   }
2197
2198   return true;
2199 }
2200
2201 void
2202 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2203 {
2204   int xsize, ysize;
2205   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2206   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2207   SGP sgp (driver);
2208   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2209   sgp.setColor (C_RED);
2210   rPhantom.show (sgp);
2211 }
2212
2213 // ProjectionCanvas
2214
2215 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2216 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2217 {
2218   m_pView = v;
2219 }
2220
2221 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2222 {
2223   m_pView = NULL;
2224 }
2225
2226 void
2227 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2228 {
2229   if (m_pView)
2230     m_pView->OnDraw(& dc);
2231 }
2232
2233 wxSize
2234 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2235 {
2236   wxSize best (0, 0);
2237   if (m_pView) {
2238     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2239     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2240   }
2241
2242   return best;
2243 }
2244
2245
2246 // ProjectionFileView
2247
2248 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2249
2250 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2251 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2252 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2253 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, ProjectionFileView::OnReconstructFourier)
2254 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2255 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2256 END_EVENT_TABLE()
2257
2258 ProjectionFileView::ProjectionFileView()
2259 : wxView(), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pFileMenu(0)
2260 {
2261 #ifdef DEBUG
2262   m_iDefaultNX = 115;
2263   m_iDefaultNY = 115;
2264 #else
2265   m_iDefaultNX = 256;
2266   m_iDefaultNY = 256;
2267 #endif
2268
2269   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2270   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2271 #if HAVE_FFTW
2272   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2273   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2274 #else
2275   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2276   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2277 #endif
2278   m_iDefaultZeropad = 1;
2279   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF;
2280   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2281   m_iDefaultInterpParam = 1;
2282   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2283
2284   m_iDefaultPolarNX = 256;
2285   m_iDefaultPolarNY = 256;
2286   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2287   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2288 }
2289
2290 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2291 {
2292   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2293   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2294 }
2295
2296 void
2297 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2298 {
2299   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2300   std::ostringstream os;
2301   rProj.printScanInfo(os);
2302   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
2303   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2304   dialogMsg.ShowModal();
2305 }
2306
2307
2308 void
2309 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2310 {
2311   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2312   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2313     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2314   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2315     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2316     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2317     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2318     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2319     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2320     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2321     if (! rProj.convertPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation)) {
2322       delete pIF;
2323       *theApp->getLog() << "Error converting to Polar\n";
2324       return;
2325     }
2326     pPolarDoc = theApp->newImageDoc ();
2327     if (! pPolarDoc) {
2328       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2329       return;
2330     }
2331     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2332     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2333     std::ostringstream os;
2334     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2335       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2336       << strInterpolation.c_str();
2337     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2338     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2339     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2340       pPolarDoc->Modify (true);
2341     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2342     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2343     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2344   }
2345 }
2346
2347 void
2348 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2349 {
2350   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2351   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2352     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2353   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2354     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2355     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2356     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2357     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2358     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2359
2360     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2361     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2362       delete pIF;
2363       *theApp->getLog() << "Error converting to polar\n";
2364       return;
2365     }
2366     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2367     if (! pPolarDoc) {
2368       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2369       return;
2370     }
2371     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2372     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2373     std::ostringstream os;
2374     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2375       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2376       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2377     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2378     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2379     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2380       pPolarDoc->Modify (true);
2381     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2382     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2383     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2384   }
2385 }
2386
2387 void
2388 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2389 {
2390   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2391 }
2392
2393 void
2394 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2395 {
2396   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY,
2397     m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration,
2398     m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector,
2399     m_iDefaultTrace);
2400
2401   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2402   if (retVal != wxID_OK)
2403     return;
2404
2405   m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2406   m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2407   wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2408   m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2409   m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2410   wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2411   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2412   m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2413   wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2414   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2415   wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2416   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2417   m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2418   wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2419   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2420   m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2421
2422   if (m_iDefaultNX <= 0 && m_iDefaultNY <= 0)
2423     return;
2424
2425   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2426   std::ostringstream os;
2427   os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2428
2429   Timer timerRecon;
2430   ImageFile rImageFile;
2431   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2432     rImageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2433     Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, rImageFile, optFilterName.c_str(),
2434       m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2435       optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2436
2437     ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstructor, rProj, rImageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2438     for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2439       ::wxYield();
2440       if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView, true)) {
2441         delete pDlgReconstruct;
2442         delete pReconstructor;
2443         return;
2444       }
2445       ::wxYield();
2446       ::wxYield();
2447       while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2448         ::wxYield();
2449         ::wxUsleep(50);
2450       }
2451     }
2452     pReconstructor->postProcessing();
2453     delete pDlgReconstruct;
2454     delete pReconstructor;
2455   } else {
2456     if (theApp->getUseBackgroundTasks() || theApp->getNumberCPU() > 1) {
2457       ReconstructorSupervisorThread* pReconstructor = new ReconstructorSupervisorThread (this,
2458         m_iDefaultNX, m_iDefaultNY, optFilterName.c_str(),
2459         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2460         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), os.str().c_str());
2461       if (pReconstructor->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2462         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating reconstructor thread");
2463         delete pReconstructor;
2464         return;
2465       }
2466       pReconstructor->SetPriority (60);
2467       pReconstructor->Run();
2468       return;
2469     } else {
2470       rImageFile.setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2471       Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, rImageFile, optFilterName.c_str(),
2472         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2473         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2474
2475       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2476       for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2477         pReconstructor->reconstructView (iView, 1);
2478         if (! dlgProgress.Update (iView + 1)) {
2479           delete pReconstructor;
2480           return; // don't make new window, thread will do this
2481         }
2482       }
2483       pReconstructor->postProcessing();
2484       delete pReconstructor;
2485       ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2486       if (! pReconDoc) {
2487         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2488         return;
2489       }
2490     }
2491   }
2492   ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2493   if (! pReconDoc) {
2494     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2495     return;
2496   }
2497   pReconDoc->setImageFile (&rImageFile);
2498   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2499     pReconDoc->Modify (true);
2500   pReconDoc->UpdateAllViews (this);
2501   if (ImageFileView* rasterView = pReconDoc->getView()) {
2502     rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2503     rasterView->getFrame()->SetFocus();
2504     rasterView->getFrame()->Show(true);
2505   }
2506   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2507   rImageFile.labelAdd (rProj.getLabel());
2508   rImageFile.labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2509 }
2510
2511
2512 ProjectionFileCanvas*
2513 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2514 {
2515   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2516   int width, height;
2517   parent->GetClientSize(&width, &height);
2518
2519   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2520
2521   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2522   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2523   pCanvas->Clear();
2524
2525   return pCanvas;
2526 }
2527
2528 #if CTSIM_MDI
2529 wxDocMDIChildFrame*
2530 #else
2531 wxDocChildFrame*
2532 #endif
2533 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2534 {
2535 #ifdef CTSIM_MDI
2536   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2537 #else
2538   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2539 #endif
2540   theApp->setIconForFrame (subframe);
2541
2542   m_pFileMenu = new wxMenu;
2543
2544   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2545   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2546   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2547   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2548   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2549   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2550
2551   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2552   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2553
2554   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2555   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2556   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2557   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2558 #ifdef CTSIM_MDI
2559   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2560   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2561   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2562 #endif
2563   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2564   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2565
2566   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2567   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2568   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-M");
2569
2570   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2571   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R", "Reconstruct image using filtered backprojection");
2572   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E", "Reconstruct image using inverse Fourier");
2573   reconstruct_menu->Enable (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, false);
2574
2575   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2576   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2577   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2578   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2579   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2580
2581   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2582
2583   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
2584   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2585   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2586   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2587
2588   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2589   subframe->Centre(wxBOTH);
2590
2591   wxAcceleratorEntry accelEntries[5];
2592   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2593   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('M'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2594   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2595   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2596   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_FILE_PROPERTIES);
2597   wxAcceleratorTable accelTable (5, accelEntries);
2598   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2599
2600   return subframe;
2601 }
2602
2603
2604 bool
2605 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2606 {
2607   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2608   SetFrame(m_pFrame);
2609
2610   int width, height;
2611   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
2612   m_pFrame->SetTitle ("ProjectionFileView");
2613   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2614
2615 #ifdef __X__
2616   int x, y;  // X requires a forced resize
2617   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2618   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2619 #endif
2620
2621   m_pFrame->Show(true);
2622   Activate(true);
2623
2624   return true;
2625 }
2626
2627 void
2628 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2629 {
2630   wxSize clientSize = m_pFrame->GetClientSize();
2631   wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
2632
2633   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2634     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
2635
2636   if (m_bitmap.Ok())
2637     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2638 }
2639
2640
2641 void
2642 ProjectionFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2643 {
2644   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2645   const int nDet = rProj.nDet();
2646   const int nView = rProj.nView();
2647   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2648     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2649     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2650     double min = detval[0];
2651     double max = detval[0];
2652     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2653       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2654       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2655       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2656         if (min > detval[ix])
2657           min = detval[ix];
2658         else if (max < detval[ix])
2659           max = detval[ix];
2660       }
2661     }
2662
2663     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2664     if (! imageData) {
2665       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for image display");
2666       return;
2667     }
2668     double scale = (max - min) / 255;
2669     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2670       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2671       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2672       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2673         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2674         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2675         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2676         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2677       }
2678     }
2679     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2680     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2681     delete imageData;
2682     int xSize = nDet;
2683     int ySize = nView;
2684     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2685     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2686     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
2687     m_pCanvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2688   }
2689
2690   if (m_pCanvas)
2691     m_pCanvas->Refresh();
2692 }
2693
2694 bool
2695 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2696 {
2697   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2698   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2699     return false;
2700
2701   Activate(false);
2702   if (m_pCanvas) {
2703         m_pCanvas->setView(NULL);
2704     m_pCanvas = NULL;
2705   }
2706   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2707   if (m_pFrame)
2708     m_pFrame->SetTitle(s);
2709
2710   SetFrame(NULL);
2711
2712   if (deleteWindow) {
2713     delete m_pFrame;
2714     m_pFrame = NULL;
2715     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2716       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2717   }
2718
2719   return true;
2720 }
2721
2722
2723
2724 // PlotFileCanvas
2725 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2726 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2727 {
2728   m_pView = v;
2729 }
2730
2731 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
2732 {
2733   m_pView = NULL;
2734 }
2735
2736 void
2737 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2738 {
2739   if (m_pView)
2740     m_pView->OnDraw(& dc);
2741 }
2742
2743
2744 // PlotFileView
2745
2746 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2747
2748 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2749 EVT_MENU(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2750 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2751 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2752 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2753 END_EVENT_TABLE()
2754
2755 PlotFileView::PlotFileView()
2756 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
2757 {
2758 }
2759
2760 PlotFileView::~PlotFileView()
2761 {
2762   if (m_pEZPlot)
2763     delete m_pEZPlot;
2764
2765   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2766 }
2767
2768 void
2769 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2770 {
2771   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2772   std::ostringstream os;
2773   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2774   rPlot.printHeadersBrief (os);
2775   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<<\n";
2776   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2777   dialogMsg.ShowModal();
2778 }
2779
2780
2781 void
2782 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2783 {
2784   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2785   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2786   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2787   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2788   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2789   if (iRetVal == wxID_OK) {
2790     m_bMinSpecified = true;
2791     m_bMaxSpecified = true;
2792     double dMin, dMax;
2793     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2794       m_dMinPixel = dMin;
2795       m_dMaxPixel = dMax;
2796       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2797       OnUpdate (this, NULL);
2798     }
2799   }
2800 }
2801
2802 void
2803 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2804 {
2805   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2806   double min;
2807   double max;
2808
2809   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2810     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2811       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2812       return;
2813     }
2814   }
2815
2816   if (m_bMinSpecified)
2817     min = m_dMinPixel;
2818   if (m_bMaxSpecified)
2819     max = m_dMaxPixel;
2820
2821   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2822   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2823   if (retVal == wxID_OK) {
2824     m_bMinSpecified = true;
2825     m_bMaxSpecified = true;
2826     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2827     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2828     OnUpdate (this, NULL);
2829   }
2830 }
2831
2832 void
2833 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2834 {
2835   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2836     m_bMinSpecified = false;
2837     m_bMaxSpecified = false;
2838     OnUpdate (this, NULL);
2839   }
2840 }
2841
2842
2843 PlotFileCanvas*
2844 PlotFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
2845 {
2846   PlotFileCanvas* pCanvas;
2847   int width, height;
2848   parent->GetClientSize(&width, &height);
2849
2850   pCanvas = new PlotFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2851
2852   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2853   pCanvas->Clear();
2854
2855   return pCanvas;
2856 }
2857
2858 #if CTSIM_MDI
2859 wxDocMDIChildFrame*
2860 #else
2861 wxDocChildFrame*
2862 #endif
2863 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2864 {
2865 #ifdef CTSIM_MDI
2866   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2867 #else
2868   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2869 #endif
2870   theApp->setIconForFrame (subframe);
2871
2872   m_pFileMenu = new wxMenu;
2873
2874   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2875   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2876   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2877   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2878   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2879   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2880
2881   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2882   m_pFileMenu->Append(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2883
2884   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2885   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2886   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2887   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2888 #ifdef CTSIM_MDI
2889   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2890   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2891   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2892 #endif
2893   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2894   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2895
2896   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2897   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2898   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2899   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2900
2901   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2902   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2903   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2904   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2905   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2906
2907   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2908
2909   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2910   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2911   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2912
2913   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2914   subframe->Centre(wxBOTH);
2915
2916   wxAcceleratorEntry accelEntries[4];
2917   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2918   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2919   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2920   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PLOTMENU_FILE_PROPERTIES);
2921   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
2922   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2923
2924   return subframe;
2925 }
2926
2927
2928 bool
2929 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2930 {
2931   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2932   SetFrame(m_pFrame);
2933
2934   m_bMinSpecified = false;
2935   m_bMaxSpecified = false;
2936   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2937
2938   int width, height;
2939   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2940   m_pFrame->SetTitle ("Plot File");
2941   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2942
2943 #ifdef __X__
2944   int x, y;  // X requires a forced resize
2945   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2946   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2947 #endif
2948
2949   m_pFrame->Show(true);
2950   Activate(true);
2951
2952   return true;
2953 }
2954
2955 void
2956 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2957 {
2958   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2959   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2960   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2961
2962   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2963     int xsize, ysize;
2964     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2965     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2966     SGP sgp (driver);
2967     if (m_pEZPlot)
2968       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2969   }
2970 }
2971
2972
2973 void
2974 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2975 {
2976   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2977   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2978   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2979
2980   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2981     if (m_pEZPlot)
2982       delete m_pEZPlot;
2983     m_pEZPlot = new EZPlot;
2984
2985     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2986       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2987
2988     if (m_bMinSpecified) {
2989       std::ostringstream os;
2990       os << "ymin " << m_dMinPixel;
2991       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2992     }
2993
2994     if (m_bMaxSpecified) {
2995       std::ostringstream os;
2996       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2997       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2998     }
2999
3000     m_pEZPlot->ezset("box");
3001     m_pEZPlot->ezset("grid");
3002
3003     double* pdXaxis = new double [iNRecords];
3004     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
3005
3006     double* pdY = new double [iNRecords];
3007     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
3008       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
3009       m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
3010     }
3011
3012     delete pdXaxis;
3013     delete pdY;
3014   }
3015
3016   if (m_pCanvas)
3017     m_pCanvas->Refresh();
3018 }
3019
3020 bool
3021 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3022 {
3023   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3024   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3025     return false;
3026
3027   Activate(false);
3028   if (m_pCanvas) {
3029     m_pCanvas->setView (NULL);
3030     m_pCanvas = NULL;
3031   }
3032   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
3033   if (m_pFrame)
3034     m_pFrame->SetTitle(s);
3035
3036   SetFrame(NULL);
3037   if (deleteWindow) {
3038     delete m_pFrame;
3039     m_pFrame = NULL;
3040     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3041       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3042   }
3043
3044   return true;
3045 }
3046
3047
3048 ////////////////////////////////////////////////////////////////
3049
3050
3051 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
3052
3053 TextFileView::~TextFileView()
3054 {
3055   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
3056   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
3057 }
3058
3059 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3060 {
3061   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3062   SetFrame (m_pFrame);
3063
3064   int width, height;
3065   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
3066   m_pFrame->SetTitle("TextFile");
3067   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
3068   m_pFrame->SetTitle("Log");
3069
3070 #ifdef __X__
3071   // X seems to require a forced resize
3072   int x, y;
3073   frame->GetSize(&x, &y);
3074   frame->SetSize(-1, -1, x, y);
3075 #endif
3076
3077   m_pFrame->Show (true);
3078   Activate (true);
3079
3080   return true;
3081 }
3082
3083 // Handled by wxTextWindow
3084 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
3085 {
3086 }
3087
3088 void TextFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3089 {
3090 }
3091
3092 bool
3093 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3094 {
3095   if (! theApp->getMainFrame()->getShuttingDown())
3096     return false;
3097
3098   Activate(false);
3099   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3100   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3101     return false;
3102
3103   SetFrame(NULL);
3104   if (deleteWindow) {
3105     delete m_pFrame;
3106     m_pFrame = NULL;
3107     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3108       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3109   }
3110
3111   return TRUE;
3112 }
3113
3114 #if CTSIM_MDI
3115 wxDocMDIChildFrame*
3116 #else
3117 wxDocChildFrame*
3118 #endif
3119 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
3120 {
3121 #if CTSIM_MDI
3122   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0,0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3123 #else
3124   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3125 #endif
3126   theApp->setIconForFrame (subframe);
3127
3128   m_pFileMenu = new wxMenu;
3129
3130   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
3131   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
3132   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
3133   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
3134   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
3135   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
3136
3137   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3138   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
3139   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
3140   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
3141 #ifdef CTSIM_MDI
3142   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3143   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
3144   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
3145 #endif
3146   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3147   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3148
3149   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3150   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
3151   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
3152   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
3153   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
3154
3155   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3156
3157   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
3158   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
3159
3160   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3161   subframe->Centre(wxBOTH);
3162
3163   return subframe;
3164 }
3165
3166
3167 // Define a constructor for my text subwindow
3168 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
3169 : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
3170 {
3171 }
3172
3173 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3174 {
3175   m_pView = NULL;
3176 }