src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          view.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.111 2001/02/22 00:56:50 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 // For compilers that support precompilation, includes "wx/wx.h".
  29 #include "wx/wxprec.h"
  30
  31 #ifdef __BORLANDC__
  32 #pragma hdrstop
  33 #endif
  34
  35 #ifndef WX_PRECOMP
  36 #include "wx/wx.h"
  37 #endif
  38
  39 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  40 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  41 #endif
  42
  43 #include "wx/image.h"
  44 #include "wx/progdlg.h"
  45
  46 #include "ct.h"
  47 #include "ctsim.h"
  48 #include "docs.h"
  49 #include "views.h"
  50 #include "dialogs.h"
  51 #include "dlgprojections.h"
  52 #include "dlgreconstruct.h"
  53 #include "backprojectors.h"
  54 #include "reconstruct.h"
  55 #include "timer.h"
  56
  57 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  58 #include <sstream>
  59 #else
  60 #include <sstream_subst>
  61 #endif
  62
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 EVT_CHAR(ImageFileCanvas::OnChar)
  69 END_EVENT_TABLE()
  70
  71
  72 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  73 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
  74 {
  75 }
  76
  77 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
  78 {
  79   m_pView = NULL;
  80 }
  81
  82 void
  83 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  84 {
  85   if (m_pView)
  86     m_pView->OnDraw(& dc);
  87 }
  88
  89 void
  90 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  91 {
  92   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  93   int nx = rIF.nx();
  94   int ny = rIF.ny();
  95
  96   int yPt = ny - y - 1;
  97   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  98   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  99   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
 100   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
 101   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
 102 }
 103
 104 bool
 105 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 106 {
 107   x = m_xCursor;
 108   y = m_yCursor;
 109
 110   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 111     return true;
 112   else
 113     return false;
 114 }
 115
 116 void
 117 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 118 {
 119   if (! m_pView)
 120     return;
 121
 122   wxClientDC dc(this);
 123   PrepareDC(dc);
 124
 125   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 126
 127   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 128   if (! pIFDoc)
 129     return;
 130   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 131   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 132   int nx = rIF.nx();
 133   int ny = rIF.ny();
 134   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 135   if (event.RightIsDown()) {
 136     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 137       std::ostringstream os;
 138       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 139       if (rIF.isComplex()) {
 140         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 141         if (dImag < 0)
 142           os << " - " << -dImag;
 143         else
 144           os << " + " << dImag;
 145         os << "i\n";
 146       } else
 147         os << "\n";
 148       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 149     } else
 150       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 151   }
 152   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 153     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 154       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 155         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 156       }
 157       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 158       m_xCursor = pt.x;
 159       m_yCursor = yPt;
 160       wxMenu* pMenu = m_pView->getMenuAnalyze();
 161       if (pMenu && ! pMenu->IsEnabled(IFMENU_PLOT_ROW)) {
 162         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, true);
 163         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_COL, true);
 164         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, true);
 165         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, true);
 166         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, true);
 167         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, true);
 168       }
 169     } else
 170       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 171   }
 172   if (event.LeftUp()) {
 173     std::ostringstream os;
 174     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 175     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 176   }
 177 }
 178
 179 void
 180 ImageFileCanvas::OnChar (wxKeyEvent& event)
 181 {
 182   if (event.GetKeyCode() == WXK_ESCAPE) {
 183     m_xCursor = -1;
 184     m_yCursor = -1;
 185     if (m_pView)
 186       m_pView->OnUpdate (NULL);
 187   } else
 188     wxScrolledWindow::OnChar (event);
 189 }
 190
 191 wxSize
 192 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 193 {
 194   if (! m_pView)
 195     return wxSize(0,0);
 196
 197   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 198   return wxSize (rIF.nx(), rIF.ny());
 199 }
 200
 201
 202 // ImageFileView
 203
 204 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 205
 206 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 207 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 208 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 209 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 210 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 211 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 212 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 213 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 214 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 215 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 216 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 217 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 218 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 219 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 220 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 221 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 222 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 223 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 224 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 225 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 226 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 227 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 228 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 229 #if wxUSE_GLCANVAS
 230 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, ImageFileView::OnConvert3d)
 231 #endif
 232 #ifdef HAVE_FFT
 233 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 234 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 235 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 236 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 237 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 238 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 239 #endif
 240 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 241 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 242 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 243 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 244 #ifdef HAVE_FFT
 245 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 246 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 247 #endif
 248 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 249 END_EVENT_TABLE()
 250
 251 ImageFileView::ImageFileView()
 252 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 253 {
 254   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::FORMAT_PNG;
 255 }
 256
 257 ImageFileView::~ImageFileView()
 258 {
 259   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
 260   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
 261 }
 262
 263
 264 void
 265 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 266 {
 267   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 268   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 269     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 270   else {
 271     const std::string rFilename = m_pFrame->GetTitle().c_str();
 272     std::ostringstream os;
 273     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 274     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 275     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 276     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 277     os << "Data type: ";
 278     if (rIF.isComplex())
 279       os << "Complex\n";
 280     else
 281       os << "Real\n";
 282     os << "Minimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 283     if (rIF.isComplex()) {
 284       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 285       os << "Imaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 286     }
 287     if (rIF.nLabels() > 0) {
 288       rIF.printLabelsBrief (os);
 289     }
 290     *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 291     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 292     dialogMsg.ShowModal();
 293   }
 294 }
 295
 296 void
 297 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 298 {
 299   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 300   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 301   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 302   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 303   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 304   if (iRetVal == wxID_OK) {
 305     m_bMinSpecified = true;
 306     m_bMaxSpecified = true;
 307     double dMin, dMax;
 308     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 309       m_dMinPixel = dMin;
 310       m_dMaxPixel = dMax;
 311       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 312       OnUpdate (this, NULL);
 313     }
 314   }
 315 }
 316
 317 void
 318 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 319 {
 320   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 321   double min, max;
 322   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 323     rIF.getMinMax (min, max);
 324
 325   if (m_bMinSpecified)
 326     min = m_dMinPixel;
 327   if (m_bMaxSpecified)
 328     max = m_dMaxPixel;
 329
 330   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 331   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 332   if (retVal == wxID_OK) {
 333     m_bMinSpecified = true;
 334     m_bMaxSpecified = true;
 335     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 336     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 337     OnUpdate (this, NULL);
 338   }
 339 }
 340
 341 void
 342 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 343 {
 344   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 345     m_bMinSpecified = false;
 346     m_bMaxSpecified = false;
 347     OnUpdate (this, NULL);
 348   }
 349 }
 350
 351 void
 352 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 353 {
 354   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 355   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 356
 357   if (vecIF.size() == 0) {
 358     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 359   } else {
 360     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
 361
 362     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 363       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 364       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 365       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 366       std::ostringstream os;
 367       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 368       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 369       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 370       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 371       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 372       double d, r, e;
 373       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 374       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 375       *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 376       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 377         ImageFile* pDifferenceImage = new ImageFile;
 378
 379         pDifferenceImage->setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 380         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, *pDifferenceImage)) {
 381           *theApp->getLog() << "Unable to subtract images\n";
 382           delete pDifferenceImage;
 383           return;
 384         }
 385         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
 386         if (! pDifferenceDoc) {
 387           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 388           return;
 389         }
 390         pDifferenceDoc->setImageFile (pDifferenceImage);
 391
 392         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 393         pDifferenceImage->labelsCopy (rIF, s.c_str());
 394         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 395         pDifferenceImage->labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 396         std::ostringstream osLabel;
 397         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 398           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 399           << os.str().c_str();
 400         pDifferenceImage->labelAdd (os.str().c_str());
 401         if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 402           pDifferenceDoc->Modify (true);
 403         pDifferenceDoc->UpdateAllViews (this);
 404         pDifferenceDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 405         pDifferenceDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 406       }
 407       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 408     }
 409   }
 410 }
 411
 412 void
 413 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 414 {
 415   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 416   rIF.invertPixelValues (rIF);
 417   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 418   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 419           GetDocument()->Modify (true);
 420   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 421 }
 422
 423 void
 424 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 425 {
 426   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 427   rIF.square (rIF);
 428   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 429   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 430      GetDocument()->Modify (true);
 431   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 432 }
 433
 434 void
 435 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 436 {
 437   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 438   rIF.sqrt (rIF);
 439   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 440   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 441      GetDocument()->Modify (true);
 442   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 443 }
 444
 445 void
 446 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 447 {
 448   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 449   rIF.log (rIF);
 450   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 451   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 452      GetDocument()->Modify (true);
 453   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 454 }
 455
 456 void
 457 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 458 {
 459   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 460   rIF.exp (rIF);
 461   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 462   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 463      GetDocument()->Modify (true);
 464   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 465 }
 466
 467 void
 468 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 469 {
 470   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 471   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 472
 473   if (vecIF.size() == 0) {
 474     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 475   } else {
 476     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
 477
 478     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 479       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 480       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 481       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 482       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 483       if (! pNewDoc) {
 484         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 485         return;
 486       }
 487       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 488       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 489       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 490       std::ostringstream os;
 491       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 492         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 493       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 494       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 495       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 496       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 497       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 498       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 499       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 500         pNewDoc->Modify (true);
 501       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 502       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 503       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 504     }
 505   }
 506 }
 507
 508 void
 509 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 510 {
 511   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 512   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 513
 514   if (vecIF.size() == 0) {
 515     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 516   } else {
 517     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 518
 519     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 520       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 521       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 522       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 523       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 524       if (! pNewDoc) {
 525         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 526         return;
 527       }
 528       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 529       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 530       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 531       std::ostringstream os;
 532       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 533         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 534       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 535       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 536       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 537       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 538       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 539       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 540       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 541         pNewDoc->Modify (true);
 542       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 543       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 544       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 545     }
 546   }
 547 }
 548
 549 void
 550 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 551 {
 552   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 553   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 554
 555   if (vecIF.size() == 0) {
 556     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 557   } else {
 558     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 559
 560     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 561       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 562       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 563       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 564       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 565       if (! pNewDoc) {
 566         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 567         return;
 568       }
 569       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 570       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 571       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 572       std::ostringstream os;
 573       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 574         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 575       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 576       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 577       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 578       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 579       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 580       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 581       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 582         pNewDoc->Modify (true);
 583       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 584       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 585       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 586     }
 587   }
 588 }
 589
 590 void
 591 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 592 {
 593   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 594   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 595
 596   if (vecIF.size() == 0) {
 597     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 598   } else {
 599     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
 600
 601     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 602       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 603       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 604       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 605       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 606       if (! pNewDoc) {
 607         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 608         return;
 609       }
 610       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 611       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 612       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 613       std::ostringstream os;
 614       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 615         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 616       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 617       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 618       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 619       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 620       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 621       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 622       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 623         pNewDoc->Modify (true);
 624       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 625       pNewDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
 626       pNewDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
 627     }
 628   }
 629 }
 630
 631
 632 #ifdef HAVE_FFT
 633 void
 634 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 635 {
 636   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 637   rIF.fft (rIF);
 638   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 639   m_bMinSpecified = false;
 640   m_bMaxSpecified = false;
 641   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 642      GetDocument()->Modify (true);
 643   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 644 }
 645
 646 void
 647 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 648 {
 649   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 650   rIF.ifft (rIF);
 651   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 652   m_bMinSpecified = false;
 653   m_bMaxSpecified = false;
 654   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 655      GetDocument()->Modify (true);
 656   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 657 }
 658
 659 void
 660 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 661 {
 662   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 663   rIF.fftRows (rIF);
 664   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 665   m_bMinSpecified = false;
 666   m_bMaxSpecified = false;
 667   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 668      GetDocument()->Modify (true);
 669   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 670 }
 671
 672 void
 673 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 674 {
 675   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 676   rIF.ifftRows (rIF);
 677   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 678   m_bMinSpecified = false;
 679   m_bMaxSpecified = false;
 680   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 681      GetDocument()->Modify (true);
 682   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 683 }
 684
 685 void
 686 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 687 {
 688   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 689   rIF.fftCols (rIF);
 690   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 691   m_bMinSpecified = false;
 692   m_bMaxSpecified = false;
 693   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 694      GetDocument()->Modify (true);
 695   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 696 }
 697
 698 void
 699 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 700 {
 701   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 702   rIF.ifftCols (rIF);
 703   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 704   m_bMinSpecified = false;
 705   m_bMaxSpecified = false;
 706   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 707      GetDocument()->Modify (true);
 708   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 709 }
 710 #endif
 711
 712 void
 713 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 714 {
 715   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 716   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 717   rIF.fourier (rIF);
 718   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 719   m_bMinSpecified = false;
 720   m_bMaxSpecified = false;
 721   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 722      GetDocument()->Modify (true);
 723   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 724 }
 725
 726 void
 727 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 728 {
 729   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 730   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 731   rIF.inverseFourier (rIF);
 732   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 733   m_bMinSpecified = false;
 734   m_bMaxSpecified = false;
 735   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 736      GetDocument()->Modify (true);
 737   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 738 }
 739
 740 void
 741 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 742 {
 743   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 744   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 745   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 746   m_bMinSpecified = false;
 747   m_bMaxSpecified = false;
 748   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 749      GetDocument()->Modify (true);
 750   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 751 }
 752
 753 void
 754 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 755 {
 756   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 757   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 758   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 759   m_bMinSpecified = false;
 760   m_bMaxSpecified = false;
 761   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 762      GetDocument()->Modify (true);
 763   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 764 }
 765
 766 void
 767 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 768 {
 769   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 770   if (rIF.isComplex()) {
 771     rIF.magnitude (rIF);
 772     rIF.labelAdd ("Magnitude of complex-image");
 773     m_bMinSpecified = false;
 774     m_bMaxSpecified = false;
 775     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 776        GetDocument()->Modify (true);
 777     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 778   }
 779 }
 780
 781 void
 782 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 783 {
 784   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 785   if (rIF.isComplex()) {
 786     rIF.phase (rIF);
 787     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 788     m_bMinSpecified = false;
 789     m_bMaxSpecified = false;
 790     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 791        GetDocument()->Modify (true);
 792     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 793   }
 794 }
 795
 796
 797 ImageFileCanvas*
 798 ImageFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
 799 {
 800   ImageFileCanvas* pCanvas;
 801   int width, height;
 802   parent->GetClientSize(&width, &height);
 803
 804   pCanvas = new ImageFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
 805
 806   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
 807   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 808   pCanvas->Clear();
 809
 810   return pCanvas;
 811 }
 812
 813 #if CTSIM_MDI
 814 wxDocMDIChildFrame*
 815 #else
 816 wxDocChildFrame*
 817 #endif
 818 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 819 {
 820 #if CTSIM_MDI
 821   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 822 #else
 823   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 824 #endif
 825   theApp->setIconForFrame (subframe);
 826
 827   m_pFileMenu = new wxMenu;
 828
 829   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
 830   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
 831   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
 832   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
 833   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 834   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
 835   m_pFileMenu->Append(wxID_REVERT, "Re&vert");
 836
 837   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 838   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
 839   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "&Export...");
 840
 841   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 842   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 843   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 844   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Preview");
 845 #ifdef CTSIM_MDI
 846   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 847   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
 848   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
 849 #endif
 850   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
 851   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
 852
 853   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 854   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
 855   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
 856   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
 857
 858   wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
 859   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "&Invert Values");
 860   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 861   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 862   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 863   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "&Exp");
 864   filter_menu->AppendSeparator();
 865 #ifdef HAVE_FFT
 866   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2-D &FFT");
 867   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2-D &IFFT");
 868   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 869   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 870   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 871   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 872   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "2-D F&ourier");
 873   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "2-D Inverse Fo&urier");
 874 #else
 875   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 876   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 877 #endif
 878   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "S&huffle Fourier to Natural Order");
 879   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shu&ffle Natural to Fourier Order");
 880   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 881   filter_menu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 882
 883   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 884   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 885   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 886   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 887   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 888   image_menu->AppendSeparator();
 889   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 890 #if wxUSE_GLCANVAS
 891   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, "Convert &3-D\tCtrl-3");
 892 #endif
 893
 894   m_pMenuAnalyze = new wxMenu;
 895   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 896   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 897   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 898   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 899   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "Plot FFT Row");
 900   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plot FFT Column");
 901   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 902   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 903   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare &Row");
 904   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare &Column");
 905   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, false);
 906   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_COL, false);
 907   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, false);
 908   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, false);
 909   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, false);
 910   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, false);
 911
 912   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 913   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
 914   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
 915   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
 916   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 917
 918   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 919
 920   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
 921   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 922   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 923   menu_bar->Append(filter_menu, "Fi&lter");
 924   menu_bar->Append(m_pMenuAnalyze, "&Analyze");
 925   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
 926
 927   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
 928
 929   subframe->Centre(wxBOTH);
 930
 931   wxAcceleratorEntry accelEntries[4];
 932   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
 933   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
 934   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
 935 #if wxUSE_GLCANVAS
 936   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('3'), IFMENU_IMAGE_CONVERT3D);
 937   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
 938 #else
 939   wxAcceleratorTable accelTable (3, accelEntries);
 940 #endif
 941
 942   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
 943
 944   return subframe;
 945 }
 946
 947
 948 bool
 949 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
 950 {
 951   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
 952
 953   m_bMinSpecified = false;
 954   m_bMaxSpecified = false;
 955   m_dAutoScaleFactor = 1.;
 956
 957   int width, height;
 958   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
 959   m_pFrame->SetTitle("ImageFileView");
 960   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
 961
 962   int x, y;  // X requires a forced resize
 963   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
 964   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
 965   m_pFrame->SetFocus();
 966   m_pFrame->Show(true);
 967   Activate(true);
 968
 969   return true;
 970 }
 971
 972 void
 973 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
 974 {
 975   wxSize sizeWindow = m_pFrame->GetClientSize();
 976   wxSize sizeBest = m_pCanvas->GetBestSize();
 977   if (sizeWindow.x > sizeBest.x || sizeWindow.y > sizeBest.y)
 978     m_pFrame->SetClientSize (sizeBest);
 979
 980   if (m_bitmap.Ok())
 981     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
 982
 983   int xCursor, yCursor;
 984   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
 985     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
 986 }
 987
 988
 989 void
 990 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
 991 {
 992   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 993   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 994   int nx = rIF.nx();
 995   int ny = rIF.ny();
 996   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
 997     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
 998       double min, max;
 999       rIF.getMinMax (min, max);
1000       if (! m_bMinSpecified)
1001         m_dMinPixel = min;
1002       if (! m_bMaxSpecified)
1003         m_dMaxPixel = max;
1004     }
1005     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
1006
1007     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
1008     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
1009       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1010         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
1011         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
1012         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
1013         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
1014         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
1015       }
1016     }
1017     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
1018     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
1019     delete imageData;
1020     int xSize = nx;
1021     int ySize = ny;
1022     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
1023     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
1024     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
1025     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1026   }
1027
1028   if (m_pCanvas)
1029     m_pCanvas->Refresh();
1030 }
1031
1032 bool
1033 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1034 {
1035   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
1036   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1037     return false;
1038
1039   Activate (false);
1040   if (m_pCanvas) {
1041     m_pCanvas->setView(NULL);
1042     m_pCanvas = NULL;
1043   }
1044   wxString s(theApp->GetAppName());
1045   if (m_pFrame)
1046     m_pFrame->SetTitle(s);
1047
1048   SetFrame(NULL);
1049
1050   if (deleteWindow) {
1051     delete m_pFrame;
1052     m_pFrame = NULL;
1053     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
1054       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
1055   }
1056
1057   return true;
1058 }
1059
1060 void
1061 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1062 {
1063   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1064   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1065   int nx = rIF.nx();
1066   int ny = rIF.ny();
1067   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1068     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1069       double min, max;
1070       rIF.getMinMax (min, max);
1071       if (! m_bMinSpecified)
1072         m_dMinPixel = min;
1073       if (! m_bMaxSpecified)
1074         m_dMaxPixel = max;
1075     }
1076
1077     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1078     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1079       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1080       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1081
1082       wxString strExt;
1083       wxString strWildcard;
1084       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PGMASCII) {
1085         strExt = ".pgm";
1086         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1087       }
1088 #ifdef HAVE_PNG
1089       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::FORMAT_PNG16) {
1090         strExt = ".png";
1091         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1092       }
1093 #endif
1094
1095       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1096         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1097       if (strFilename) {
1098         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1099         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1100       }
1101     }
1102   }
1103 }
1104
1105 void
1106 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1107 {
1108   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1109   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1110   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1111
1112   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1113   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1114     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1115     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1116     std::ostringstream os;
1117     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1118     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1119     if (! pScaledDoc) {
1120       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1121       return;
1122     }
1123     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1124     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1125     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1126     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1127     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1128     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1129     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1130        pScaledDoc->Modify (true);
1131     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1132     pScaledDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1133     pScaledDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1134   }
1135 }
1136
1137 #if wxUSE_GLCANVAS
1138 void
1139 ImageFileView::OnConvert3d (wxCommandEvent& event)
1140 {
1141   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1142   Graph3dFileDocument* pGraph3d = theApp->newGraph3dDoc();
1143   pGraph3d->setBadFileOpen();
1144   pGraph3d->createFromImageFile (rIF);
1145   pGraph3d->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1146   pGraph3d->UpdateAllViews();
1147   pGraph3d->getView()->getFrame()->SetClientSize (400, 400);
1148   pGraph3d->getView()->getFrame()->Show (true);
1149   GetDocumentManager()->ActivateView (pGraph3d->getView(), true, false);
1150   ::wxYield();
1151   pGraph3d->getView()->getCanvas()->SetFocus();
1152 }
1153 #endif
1154
1155 void
1156 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1157 {
1158   int xCursor, yCursor;
1159   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1160     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1161     return;
1162   }
1163
1164   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1165   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1166   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1167   int nx = rIF.nx();
1168   int ny = rIF.ny();
1169
1170   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1171     double* pX = new double [nx];
1172     double* pYReal = new double [nx];
1173     double *pYImag = NULL;
1174     double *pYMag = NULL;
1175     if (rIF.isComplex()) {
1176       pYImag = new double [nx];
1177       pYMag = new double [nx];
1178     }
1179     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1180       pX[i] = i;
1181       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1182       if (rIF.isComplex()) {
1183         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1184         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1185       }
1186     }
1187     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1188     if (! pPlotDoc) {
1189       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1190     } else {
1191       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1192       std::ostringstream os;
1193       os << "Row " << yCursor;
1194       std::string title("title ");
1195       title += os.str();
1196       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1197       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1198       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1199       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1200       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1201       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1202       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1203       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1204       if (rIF.isComplex()) {
1205         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1206         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1207         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1208         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1209         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1210         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1211         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1212         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1213       } else
1214         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1215       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1216       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1217       if (rIF.isComplex()) {
1218         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1219         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1220       }
1221       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1222         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1223       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1224       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1225       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1226     }
1227     delete pX;
1228     delete pYReal;
1229     if (rIF.isComplex()) {
1230       delete pYImag;
1231       delete pYMag;
1232     }
1233     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1234        pPlotDoc->Modify (true);
1235     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1236     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1237     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1238   }
1239 }
1240
1241 void
1242 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1243 {
1244   int xCursor, yCursor;
1245   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1246     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1247     return;
1248   }
1249
1250   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1251   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1252   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1253   int nx = rIF.nx();
1254   int ny = rIF.ny();
1255
1256   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1257     double* pX = new double [ny];
1258     double* pYReal = new double [ny];
1259     double* pYImag = NULL;
1260     double* pYMag = NULL;
1261     if (rIF.isComplex()) {
1262       pYImag = new double [ny];
1263       pYMag = new double [ny];
1264     }
1265     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1266       pX[i] = i;
1267       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1268       if (rIF.isComplex()) {
1269         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1270         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1271       }
1272     }
1273     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1274     if (! pPlotDoc) {
1275       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1276     } else {
1277       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1278       std::ostringstream os;
1279       os << "Column " << xCursor;
1280       std::string title("title ");
1281       title += os.str();
1282       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1283       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1284       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1285       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1286       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1287       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1288       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1289       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1290       if (rIF.isComplex()) {
1291         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1292         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1293         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1294         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1295         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1296         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1297         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1298         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1299       } else
1300         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1301       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1302       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1303       if (rIF.isComplex()) {
1304         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1305         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1306       }
1307       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1308         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1309       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1310       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1311       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1312     }
1313     delete pX;
1314     delete pYReal;
1315     if (rIF.isComplex()) {
1316       delete pYImag;
1317       delete pYMag;
1318     }
1319     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1320        pPlotDoc->Modify (true);
1321     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1322     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1323     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1324   }
1325 }
1326
1327 #ifdef HAVE_FFT
1328 void
1329 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1330 {
1331   int xCursor, yCursor;
1332   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1333     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1334     return;
1335   }
1336
1337   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1338   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1339   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1340   int nx = rIF.nx();
1341   int ny = rIF.ny();
1342
1343   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1344     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1345
1346     int i;
1347     for (i = 0; i < nx; i++) {
1348       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1349       if (rIF.isComplex())
1350         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1351       else
1352         pcIn[i].im = 0;
1353     }
1354
1355     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE);
1356     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1357     fftw_destroy_plan (plan);
1358
1359     double* pX = new double [nx];
1360     double* pYReal = new double [nx];
1361     double* pYImag = new double [nx];
1362     double* pYMag = new double [nx];
1363     for (i = 0; i < nx; i++) {
1364       pX[i] = i;
1365       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1366       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1367       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1368     }
1369     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1370     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1371     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1372
1373     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1374     if (! pPlotDoc) {
1375       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1376     } else {
1377       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1378       std::ostringstream os;
1379       os << "Row " << yCursor;
1380       std::string title("title ");
1381       title += os.str();
1382       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1383       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1384       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1385       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1386       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1387       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1388       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1389       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1390       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1391       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1392       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1393       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1394       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1395       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1396       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1397       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1398       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1399       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1400       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1401       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1402       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1403         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1404       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1405       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1406       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1407     }
1408     delete pX;
1409     delete pYReal;
1410     delete pYImag;
1411     delete pYMag;
1412     delete [] pcIn;
1413
1414     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1415        pPlotDoc->Modify (true);
1416     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1417     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1418     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1419   }
1420 }
1421
1422 void
1423 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1424 {
1425   int xCursor, yCursor;
1426   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1427     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1428     return;
1429   }
1430
1431   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1432   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1433   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1434   int nx = rIF.nx();
1435   int ny = rIF.ny();
1436
1437   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1438     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1439     double *pdTemp = new double [ny];
1440
1441     int i;
1442     for (i = 0; i < ny; i++)
1443       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1444     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1445     for (i = 0; i < ny; i++)
1446       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1447
1448     for (i = 0; i < ny; i++) {
1449       if (rIF.isComplex())
1450         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1451       else
1452         pdTemp[i] = 0;
1453     }
1454     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1455     for (i = 0; i < ny; i++)
1456       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1457
1458     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE);
1459     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1460     fftw_destroy_plan (plan);
1461
1462     double* pX = new double [ny];
1463     double* pYReal = new double [ny];
1464     double* pYImag = new double [ny];
1465     double* pYMag = new double [ny];
1466     for (i = 0; i < ny; i++) {
1467       pX[i] = i;
1468       pYReal[i] = pcIn[i].re;
1469       pYImag[i] = pcIn[i].im;
1470       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1471     }
1472
1473     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1474     if (! pPlotDoc) {
1475       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1476     } else {
1477       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1478       std::ostringstream os;
1479       os << "Column " << xCursor;
1480       std::string title("title ");
1481       title += os.str();
1482       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1483       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1484       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1485       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1486       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1487       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1488       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1489       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1490       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1491       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1492       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1493       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1494       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1495       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1496       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1497       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1498       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1499       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1500       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1501       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1502       for (int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1503         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1504       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1505       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1506       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1507     }
1508     delete pX;
1509     delete pYReal;
1510     delete pYImag;
1511     delete pYMag;
1512     delete pdTemp;
1513     delete [] pcIn;
1514
1515     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1516        pPlotDoc->Modify (true);
1517     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1518     pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1519     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1520   }
1521 }
1522 #endif
1523
1524 void
1525 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1526 {
1527   int xCursor, yCursor;
1528   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1529     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1530     return;
1531   }
1532
1533   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1534   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1535   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1536     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1537     return;
1538   }
1539   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1540
1541   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1542     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1543     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1544     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1545
1546     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1547     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1548     int nx = rIF.nx();
1549     int ny = rIF.ny();
1550
1551     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1552       double* pX = new double [ny];
1553       double* pY1 = new double [ny];
1554       double* pY2 = new double [ny];
1555       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1556         pX[i] = i;
1557         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1558         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1559       }
1560       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1561       if (! pPlotDoc) {
1562         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1563       } else {
1564         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1565         std::ostringstream os;
1566         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1567         std::string title("title ");
1568         title += os.str();
1569         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1570         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1571         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1572         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1573         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1574         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1575         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1576         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1577         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1578         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1579         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1580         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1581         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1582         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1583         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1584
1585         unsigned int iL;
1586         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1587           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1588           s += ": ";
1589           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1590           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1591         }
1592         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1593           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1594           s += ": ";
1595           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1596           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1597         }
1598         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1599           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1600         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1601         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1602       }
1603       delete pX;
1604       delete pY1;
1605       delete pY2;
1606       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1607         pPlotDoc->Modify (true);
1608       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1609       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1610       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1611     }
1612   }
1613 }
1614
1615 void
1616 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1617 {
1618   int xCursor, yCursor;
1619   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1620     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1621     return;
1622   }
1623
1624   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1625   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1626
1627   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1628     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1629     return;
1630   }
1631
1632   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1633
1634   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1635     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1636     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1637     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1638
1639     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1640     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1641     int nx = rIF.nx();
1642     int ny = rIF.ny();
1643
1644     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1645       double* pX = new double [nx];
1646       double* pY1 = new double [nx];
1647       double* pY2 = new double [nx];
1648       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1649         pX[i] = i;
1650         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1651         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1652       }
1653       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1654       if (! pPlotDoc) {
1655         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1656       } else {
1657         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1658         std::ostringstream os;
1659         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1660         std::string title("title ");
1661         title += os.str();
1662         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1663         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1664         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1665         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1666         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1667         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1668         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1669         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1670         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1671         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1672         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1673         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1674         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1675         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1676         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1677         unsigned int iL;
1678         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1679           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1680           s += ": ";
1681           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1682           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1683         }
1684         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1685           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1686           s += ": ";
1687           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1688           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1689         }
1690         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1691           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1692         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1693         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1694       }
1695       delete pX;
1696       delete pY1;
1697       delete pY2;
1698       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1699         pPlotDoc->Modify (true);
1700       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1701       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1702       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1703     }
1704   }
1705 }
1706
1707 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1708
1709 void
1710 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1711 {
1712   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1713   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1714   int nx = rIF.nx();
1715   int ny = rIF.ny();
1716
1717   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1718     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1719     if (! pPlotDoc) {
1720       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1721       return;
1722     }
1723
1724     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1725     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1726     double dMin, dMax;
1727     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1728     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1729
1730     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1731       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1732       pY[i] = 0;
1733     }
1734     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1735       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1736         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1737         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1738           pY[iBin] += 1;
1739       }
1740
1741       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1742       std::ostringstream os;
1743       os << "Histogram";
1744       std::string title("title ");
1745       title += os.str();
1746       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1747       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1748       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1749       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1750       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1751       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1752       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1753       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1754       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1755         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1756         s += ": ";
1757         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1758         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1759       }
1760       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1761       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1762       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1763       delete pX;
1764       delete pY;
1765       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1766         pPlotDoc->Modify (true);
1767       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1768       pPlotDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1769       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1770   }
1771 }
1772
1773
1774 // PhantomCanvas
1775
1776 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1777 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
1778 {
1779   m_pView = v;
1780 }
1781
1782 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1783 {
1784   m_pView = NULL;
1785 }
1786
1787 void
1788 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1789 {
1790   if (m_pView)
1791     m_pView->OnDraw(& dc);
1792 }
1793
1794 wxSize
1795 PhantomCanvas::GetBestSize() const
1796 {
1797   if (! m_pView)
1798     return wxSize(0,0);
1799
1800   int xSize, ySize;
1801   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
1802   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
1803   ySize = xSize = (xSize / 3);
1804   return wxSize (xSize, ySize);
1805 }
1806
1807
1808
1809 // PhantomFileView
1810
1811 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
1812
1813 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
1814 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
1815 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
1816 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
1817 END_EVENT_TABLE()
1818
1819 PhantomFileView::PhantomFileView()
1820 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
1821 {
1822 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
1823   m_iDefaultNDet = 165;
1824   m_iDefaultNView = 180;
1825 #else
1826   m_iDefaultNDet = 367;
1827   m_iDefaultNView = 320;
1828 #endif
1829   m_iDefaultNSample = 2;
1830   m_dDefaultRotation = 1;
1831   m_dDefaultFocalLength = 2;
1832   m_dDefaultViewRatio = 1;
1833   m_dDefaultScanRatio = 1;
1834   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
1835   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
1836
1837 #ifdef DEBUG
1838   m_iDefaultRasterNX = 115;
1839   m_iDefaultRasterNY = 115;
1840   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1841 #else
1842   m_iDefaultRasterNX = 256;
1843   m_iDefaultRasterNY = 256;
1844   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
1845 #endif
1846   m_dDefaultRasterViewRatio = 1;
1847 }
1848
1849 PhantomFileView::~PhantomFileView()
1850 {
1851   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
1852   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
1853 }
1854
1855 void
1856 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
1857 {
1858   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
1859   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
1860   std::ostringstream os;
1861   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
1862   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1863   rPhantom.printDefinitions (os);
1864 #if DEBUG
1865   rPhantom.print (os);
1866 #endif
1867   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
1868   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
1869 }
1870
1871
1872 void
1873 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
1874 {
1875   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(),
1876     m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation,
1877     m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio, m_iDefaultGeometry,
1878     m_iDefaultTrace);
1879   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
1880   if (retVal == wxID_OK) {
1881     m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
1882     m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
1883     m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
1884     m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
1885     m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
1886     m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
1887     m_dDefaultViewRatio = dialogProjection.getViewRatio();
1888     m_dDefaultScanRatio = dialogProjection.getScanRatio();
1889     wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
1890     m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
1891
1892     if (m_iDefaultNDet > 0 && m_iDefaultNView > 0 && sGeometry != "") {
1893       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1894       Projections* pProj = new Projections;
1895       Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultNSample,
1896                           m_dDefaultRotation, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio);
1897       if (theScanner.fail()) {
1898         wxString msg = "Failed making scanner\n";
1899         msg += theScanner.failMessage().c_str();
1900         *theApp->getLog() << msg << "\n";
1901         wxMessageBox (msg, "Error");
1902         return;
1903       }
1904       pProj->initFromScanner (theScanner);
1905       m_dDefaultRotation /= TWOPI;  // convert back to fraction of a circle
1906
1907       Timer timer;
1908       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
1909         ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, *pProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
1910         for (int iView = 0; iView < pProj->nView(); iView++) {
1911           ::wxYield();
1912           if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
1913             delete pProj;
1914             return;
1915           }
1916           ::wxYield();
1917           while (dialogProjections.isPaused()) {
1918             ::wxYield();
1919             ::wxUsleep(50);
1920           }
1921         }
1922       } else {
1923         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), pProj->nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1924         for (int i = 0; i < pProj->nView(); i++) {
1925           theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
1926           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
1927             delete pProj;
1928             return;
1929           }
1930         }
1931       }
1932
1933       std::ostringstream os;
1934       os << "Projections for " << rPhantom.name() << ": nDet=" << m_iDefaultNDet
1935         << ", nView=" << m_iDefaultNView << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample
1936         << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength
1937         << ", ViewRatio=" << m_dDefaultViewRatio << ", ScanRatio=" << m_dDefaultScanRatio
1938         << ", Geometry=" << sGeometry.c_str() << ", FanBeamAngle=" <<
1939         convertRadiansToDegrees (theScanner.fanBeamAngle());
1940       pProj->setCalcTime (timer.timerEnd());
1941       pProj->setRemark (os.str());
1942       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1943
1944       ::wxYield();
1945       ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
1946       if (! pProjectionDoc) {
1947         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
1948         return;
1949       }
1950       pProjectionDoc->setProjections (pProj);
1951       ProjectionFileView* projView = pProjectionDoc->getView();
1952       if (projView) {
1953         projView->OnUpdate (projView, NULL);
1954         if (projView->getCanvas())
1955               projView->getCanvas()->SetClientSize (m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView);
1956         if (wxFrame* pFrame = projView->getFrame()) {
1957           pFrame->Show(true);
1958           pFrame->SetFocus();
1959           pFrame->Raise();
1960         }
1961         GetDocumentManager()->ActivateView (projView, true, false);
1962       }
1963       ::wxYield();
1964       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1965         pProjectionDoc-> Modify(true);
1966       pProjectionDoc->UpdateAllViews (this);
1967     }
1968   }
1969 }
1970
1971
1972 void
1973 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
1974 {
1975   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
1976     m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio);
1977   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
1978   if (retVal == wxID_OK) {
1979     m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
1980     m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
1981     m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
1982     m_dDefaultRasterViewRatio = dialogRaster.getViewRatio();
1983     if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
1984       m_iDefaultRasterNSamples = 1;
1985     if (m_dDefaultRasterViewRatio < 0)
1986       m_dDefaultRasterViewRatio = 0;
1987     if (m_iDefaultRasterNX > 0 && m_iDefaultRasterNY > 0) {
1988       const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
1989
1990       ImageFile* pImageFile = new ImageFile;
1991
1992       pImageFile->setArraySize (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY);
1993       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"), wxString("Rasterization Progress"),
1994                                     pImageFile->nx() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
1995       Timer timer;
1996       for (unsigned int i = 0; i < pImageFile->nx(); i++) {
1997         rPhantom.convertToImagefile (*pImageFile, m_dDefaultRasterViewRatio, m_iDefaultRasterNSamples,
1998           Trace::TRACE_NONE, i, 1, true);
1999         if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
2000           delete pImageFile;
2001           return;
2002         }
2003       }
2004
2005       ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
2006       if (! pRasterDoc) {
2007         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2008         return;
2009       }
2010       pRasterDoc->setImageFile (pImageFile);
2011
2012       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2013         pRasterDoc->Modify (true);
2014       pRasterDoc->UpdateAllViews (this);
2015       pRasterDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2016       std::ostringstream os;
2017       os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
2018         << m_iDefaultRasterNY << ", ViewRatio=" << m_dDefaultRasterViewRatio << ", nSamples="
2019         << m_iDefaultRasterNSamples;;
2020       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2021       pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
2022       ImageFileView* rasterView = pRasterDoc->getView();
2023       if (rasterView) {
2024         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2025         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2026       }
2027
2028     }
2029   }
2030 }
2031
2032
2033 PhantomCanvas*
2034 PhantomFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2035 {
2036   PhantomCanvas* pCanvas;
2037
2038   pCanvas = new PhantomCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(0,0), 0);
2039   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2040   pCanvas->Clear();
2041
2042   return pCanvas;
2043 }
2044
2045 #if CTSIM_MDI
2046 wxDocMDIChildFrame*
2047 #else
2048 wxDocChildFrame*
2049 #endif
2050 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2051 {
2052 #if CTSIM_MDI
2053   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2054 #else
2055   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2056 #endif
2057   theApp->setIconForFrame (subframe);
2058
2059   m_pFileMenu = new wxMenu;
2060
2061   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2062   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2063   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2064   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2065   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2066
2067   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2068   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2069
2070   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2071   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2072   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2073   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2074 #ifdef CTSIM_MDI
2075   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2076   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2077   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2078 #endif
2079   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2080   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2081
2082   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
2083   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
2084   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
2085
2086   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2087   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2088   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2089   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2090   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2091
2092   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2093
2094   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2095   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
2096   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2097
2098   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2099   subframe->Centre(wxBOTH);
2100
2101   wxAcceleratorEntry accelEntries[2];
2102   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2103   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2104   wxAcceleratorTable accelTable (2, accelEntries);
2105   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2106
2107   return subframe;
2108 }
2109
2110
2111 bool
2112 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2113 {
2114   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2115   SetFrame(m_pFrame);
2116   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2117   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2118   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2119
2120   m_pFrame->SetTitle ("PhantomFileView");
2121
2122 #ifdef __X__
2123   int x, y;  // X requires a forced resize
2124   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2125   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2126 #endif
2127
2128   m_pFrame->Show(true);
2129   Activate(true);
2130
2131   return true;
2132 }
2133
2134 void
2135 PhantomFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2136 {
2137   if (m_pCanvas)
2138     m_pCanvas->Refresh();
2139 }
2140
2141 bool
2142 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2143 {
2144   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2145   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2146     return false;
2147
2148   Activate(false);
2149   if (m_pCanvas) {
2150     m_pCanvas->setView(NULL);
2151     m_pCanvas = NULL;
2152   }
2153   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2154   if (m_pFrame)
2155     m_pFrame->SetTitle(s);
2156
2157   SetFrame(NULL);
2158
2159   if (deleteWindow) {
2160     delete m_pFrame;
2161     m_pFrame = NULL;
2162     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2163       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2164   }
2165
2166   return true;
2167 }
2168
2169 void
2170 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2171 {
2172   int xsize, ysize;
2173   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2174   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2175   SGP sgp (driver);
2176   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2177   sgp.setColor (C_RED);
2178   rPhantom.show (sgp);
2179 }
2180
2181 // ProjectionCanvas
2182
2183 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2184 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2185 {
2186   m_pView = v;
2187 }
2188
2189 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2190 {
2191   m_pView = NULL;
2192 }
2193
2194 void
2195 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2196 {
2197   if (m_pView)
2198     m_pView->OnDraw(& dc);
2199 }
2200
2201 wxSize
2202 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2203 {
2204   wxSize best (0, 0);
2205   if (m_pView) {
2206     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2207     best.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2208   }
2209
2210   return best;
2211 }
2212
2213
2214 // ProjectionFileView
2215
2216 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2217
2218 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2219 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2220 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2221 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2222 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2223 END_EVENT_TABLE()
2224
2225 ProjectionFileView::ProjectionFileView()
2226 : wxView(), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pFileMenu(0)
2227 {
2228 #ifdef DEBUG
2229   m_iDefaultNX = 115;
2230   m_iDefaultNY = 115;
2231 #else
2232   m_iDefaultNX = 256;
2233   m_iDefaultNY = 256;
2234 #endif
2235
2236   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2237   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2238 #if HAVE_FFTW
2239   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2240   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2241 #else
2242   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2243   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2244 #endif
2245   m_iDefaultZeropad = 1;
2246   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF;
2247   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2248   m_iDefaultInterpParam = 1;
2249   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2250
2251   m_iDefaultPolarNX = 256;
2252   m_iDefaultPolarNY = 256;
2253   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2254   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2255 }
2256
2257 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2258 {
2259   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2260   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2261 }
2262
2263 void
2264 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2265 {
2266   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2267   std::ostringstream os;
2268   rProj.printScanInfo(os);
2269   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
2270   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2271   dialogMsg.ShowModal();
2272 }
2273
2274
2275 void
2276 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2277 {
2278   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2279   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2280     m_iDefaultPolarInterpolation, -1);
2281   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2282     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2283     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2284     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2285     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2286     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2287     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2288     if (! rProj.convertPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation)) {
2289       delete pIF;
2290       *theApp->getLog() << "Error converting to Polar\n";
2291       return;
2292     }
2293     pPolarDoc = theApp->newImageDoc ();
2294     if (! pPolarDoc) {
2295       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2296       return;
2297     }
2298     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2299     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2300     std::ostringstream os;
2301     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2302       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2303       << strInterpolation.c_str();
2304     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2305     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2306     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2307       pPolarDoc->Modify (true);
2308     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2309     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2310     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2311   }
2312 }
2313
2314 void
2315 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2316 {
2317   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2318   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2319     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad);
2320   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2321     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2322     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2323     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2324     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2325     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2326
2327     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2328     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2329       delete pIF;
2330       *theApp->getLog() << "Error converting to polar\n";
2331       return;
2332     }
2333     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2334     if (! pPolarDoc) {
2335       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2336       return;
2337     }
2338     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2339     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2340     std::ostringstream os;
2341     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2342       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2343       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2344     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2345     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2346     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2347       pPolarDoc->Modify (true);
2348     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2349     pPolarDoc->getView()->OnUpdate (this, NULL);
2350     pPolarDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2351   }
2352 }
2353
2354 void
2355 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2356 {
2357   wxMessageBox ("Fourier Reconstruction is not yet supported", "Unimplemented function");
2358 }
2359
2360 void
2361 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2362 {
2363   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY,
2364     m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration,
2365     m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector,
2366     m_iDefaultTrace);
2367
2368   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2369   if (retVal == wxID_OK) {
2370     m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2371     m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2372     wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2373     m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2374     m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2375     wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2376     m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2377     m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2378     wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2379     m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2380     wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2381     m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2382     m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2383     wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2384     m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2385     m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2386
2387     if (m_iDefaultNX > 0 && m_iDefaultNY > 0) {
2388       const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2389       ImageFile* pImageFile = new ImageFile;
2390       pImageFile->setArraySize (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2391
2392       Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2393         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2394         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace);
2395
2396       Timer timerRecon;
2397       if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2398         ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstructor, rProj, *pImageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2399         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2400           ::wxYield();
2401           if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView, true)) {
2402             delete pDlgReconstruct;
2403             delete pReconstructor;
2404             delete pImageFile;
2405             return;
2406           }
2407           ::wxYield();
2408           ::wxYield();
2409           while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2410             ::wxYield();
2411             ::wxUsleep(50);
2412           }
2413         }
2414         delete pDlgReconstruct;
2415       } else {
2416         wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT);
2417         for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2418           pReconstructor->reconstructView (iView, 1);
2419           if (! dlgProgress.Update (iView + 1)) {
2420             delete pReconstructor;
2421             delete pImageFile;
2422             return;
2423           }
2424         }
2425       }
2426       delete pReconstructor;
2427       ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2428       if (! pReconDoc) {
2429         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2430         return;
2431       }
2432       pReconDoc->setImageFile (pImageFile);
2433       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2434         pReconDoc->Modify (true);
2435       pReconDoc->UpdateAllViews (this);
2436       if (ImageFileView* rasterView = pReconDoc->getView()) {
2437         rasterView->OnUpdate (rasterView, NULL);
2438         rasterView->getFrame()->SetFocus();
2439         rasterView->getFrame()->Show(true);
2440       }
2441       std::ostringstream os;
2442       os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2443       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2444       pImageFile->labelAdd (rProj.getLabel());
2445       pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2446     }
2447   }
2448 }
2449
2450
2451 ProjectionFileCanvas*
2452 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2453 {
2454   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2455   int width, height;
2456   parent->GetClientSize(&width, &height);
2457
2458   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2459
2460   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2461   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2462   pCanvas->Clear();
2463
2464   return pCanvas;
2465 }
2466
2467 #if CTSIM_MDI
2468 wxDocMDIChildFrame*
2469 #else
2470 wxDocChildFrame*
2471 #endif
2472 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2473 {
2474 #ifdef CTSIM_MDI
2475   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2476 #else
2477   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2478 #endif
2479   theApp->setIconForFrame (subframe);
2480
2481   m_pFileMenu = new wxMenu;
2482
2483   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2484   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2485   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2486   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2487   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2488   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2489
2490   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2491   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2492
2493   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2494   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2495   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2496   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2497 #ifdef CTSIM_MDI
2498   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2499   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2500   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2501 #endif
2502   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2503   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2504
2505   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
2506   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
2507   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "&FFT->Polar Image...\tCtrl-I");
2508
2509   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
2510   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R", "Reconstruct image using filtered backprojection");
2511   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E", "Reconstruct image using inverse Fourier");
2512   reconstruct_menu->Enable (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, false);
2513
2514   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2515   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2516   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2517   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2518   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2519
2520   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2521
2522   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
2523   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
2524   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
2525   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
2526
2527   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2528   subframe->Centre(wxBOTH);
2529
2530   wxAcceleratorEntry accelEntries[4];
2531   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
2532   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
2533   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
2534   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
2535   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
2536   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2537
2538   return subframe;
2539 }
2540
2541
2542 bool
2543 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2544 {
2545   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2546   SetFrame(m_pFrame);
2547
2548   int width, height;
2549   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
2550   m_pFrame->SetTitle ("ProjectionFileView");
2551   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2552
2553 #ifdef __X__
2554   int x, y;  // X requires a forced resize
2555   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2556   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2557 #endif
2558
2559   m_pFrame->Show(true);
2560   Activate(true);
2561
2562   return true;
2563 }
2564
2565 void
2566 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2567 {
2568   wxSize clientSize = m_pFrame->GetClientSize();
2569   wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
2570
2571   if (clientSize.x > bestSize.x || clientSize.y > bestSize.y)
2572     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
2573
2574   if (m_bitmap.Ok())
2575     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
2576 }
2577
2578
2579 void
2580 ProjectionFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2581 {
2582   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2583   const int nDet = rProj.nDet();
2584   const int nView = rProj.nView();
2585   if (nDet != 0 && nView != 0) {
2586     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
2587     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2588     double min = detval[0];
2589     double max = detval[0];
2590     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
2591       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
2592       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2593       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2594         if (min > detval[ix])
2595           min = detval[ix];
2596         else if (max < detval[ix])
2597           max = detval[ix];
2598       }
2599     }
2600
2601     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
2602     double scale = (max - min) / 255;
2603     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
2604       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
2605       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
2606       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
2607         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
2608         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
2609         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
2610         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
2611       }
2612     }
2613     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
2614     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
2615     delete imageData;
2616     int xSize = nDet;
2617     int ySize = nView;
2618     xSize = clamp (xSize, 0, 800);
2619     ySize = clamp (ySize, 0, 800);
2620     m_pFrame->SetClientSize (xSize, ySize);
2621     m_pCanvas->SetScrollbars (20, 20, nDet/20, nView/20);
2622   }
2623
2624   if (m_pCanvas)
2625     m_pCanvas->Refresh();
2626 }
2627
2628 bool
2629 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2630 {
2631   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2632   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2633     return false;
2634
2635   Activate(false);
2636   if (m_pCanvas) {
2637         m_pCanvas->setView(NULL);
2638     m_pCanvas = NULL;
2639   }
2640   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2641   if (m_pFrame)
2642     m_pFrame->SetTitle(s);
2643
2644   SetFrame(NULL);
2645
2646   if (deleteWindow) {
2647     delete m_pFrame;
2648     m_pFrame = NULL;
2649     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2650       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2651   }
2652
2653   return true;
2654 }
2655
2656
2657
2658 // PlotFileCanvas
2659 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2660 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2661 {
2662   m_pView = v;
2663 }
2664
2665 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
2666 {
2667   m_pView = NULL;
2668 }
2669
2670 void
2671 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2672 {
2673   if (m_pView)
2674     m_pView->OnDraw(& dc);
2675 }
2676
2677
2678 // PlotFileView
2679
2680 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
2681
2682 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
2683 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
2684 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
2685 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
2686 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
2687 END_EVENT_TABLE()
2688
2689 PlotFileView::PlotFileView()
2690 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
2691 {
2692 }
2693
2694 PlotFileView::~PlotFileView()
2695 {
2696   if (m_pEZPlot)
2697     delete m_pEZPlot;
2698
2699   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2700 }
2701
2702 void
2703 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2704 {
2705   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
2706   std::ostringstream os;
2707   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
2708   rPlot.printHeadersBrief (os);
2709   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<<\n";
2710   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2711   dialogMsg.ShowModal();
2712 }
2713
2714
2715 void
2716 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
2717 {
2718   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2719   double min, max, mean, mode, median, stddev;
2720   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
2721   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
2722   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
2723   if (iRetVal == wxID_OK) {
2724     m_bMinSpecified = true;
2725     m_bMaxSpecified = true;
2726     double dMin, dMax;
2727     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
2728       m_dMinPixel = dMin;
2729       m_dMaxPixel = dMax;
2730       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
2731       OnUpdate (this, NULL);
2732     }
2733   }
2734 }
2735
2736 void
2737 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
2738 {
2739   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2740   double min;
2741   double max;
2742
2743   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
2744     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
2745       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
2746       return;
2747     }
2748   }
2749
2750   if (m_bMinSpecified)
2751     min = m_dMinPixel;
2752   if (m_bMaxSpecified)
2753     max = m_dMaxPixel;
2754
2755   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
2756   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
2757   if (retVal == wxID_OK) {
2758     m_bMinSpecified = true;
2759     m_bMaxSpecified = true;
2760     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
2761     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
2762     OnUpdate (this, NULL);
2763   }
2764 }
2765
2766 void
2767 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
2768 {
2769   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
2770     m_bMinSpecified = false;
2771     m_bMaxSpecified = false;
2772     OnUpdate (this, NULL);
2773   }
2774 }
2775
2776
2777 PlotFileCanvas*
2778 PlotFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
2779 {
2780   PlotFileCanvas* pCanvas;
2781   int width, height;
2782   parent->GetClientSize(&width, &height);
2783
2784   pCanvas = new PlotFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2785
2786   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2787   pCanvas->Clear();
2788
2789   return pCanvas;
2790 }
2791
2792 #if CTSIM_MDI
2793 wxDocMDIChildFrame*
2794 #else
2795 wxDocChildFrame*
2796 #endif
2797 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2798 {
2799 #ifdef CTSIM_MDI
2800   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2801 #else
2802   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2803 #endif
2804   theApp->setIconForFrame (subframe);
2805
2806   m_pFileMenu = new wxMenu;
2807
2808   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2809   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2810   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2811   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
2812   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2813   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
2814
2815   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2816   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties");
2817
2818   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2819   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2820   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2821   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2822 #ifdef CTSIM_MDI
2823   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2824   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2825   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2826 #endif
2827   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2828   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2829
2830   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
2831   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
2832   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
2833   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
2834
2835   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2836   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2837   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2838   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2839   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2840
2841   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2842
2843   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2844   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
2845   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2846
2847   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2848   subframe->Centre(wxBOTH);
2849
2850   wxAcceleratorEntry accelEntries[3];
2851   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
2852   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
2853   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
2854   wxAcceleratorTable accelTable (3, accelEntries);
2855   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2856
2857   return subframe;
2858 }
2859
2860
2861 bool
2862 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2863 {
2864   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2865   SetFrame(m_pFrame);
2866
2867   m_bMinSpecified = false;
2868   m_bMaxSpecified = false;
2869   m_dAutoScaleFactor = 1.;
2870
2871   int width, height;
2872   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2873   m_pFrame->SetTitle ("Plot File");
2874   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2875
2876 #ifdef __X__
2877   int x, y;  // X requires a forced resize
2878   m_pFrame->GetSize(&x, &y);
2879   m_pFrame->SetSize(-1, -1, x, y);
2880 #endif
2881
2882   m_pFrame->Show(true);
2883   Activate(true);
2884
2885   return true;
2886 }
2887
2888 void
2889 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2890 {
2891   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2892   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2893   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2894
2895   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2896     int xsize, ysize;
2897     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2898     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2899     SGP sgp (driver);
2900     if (m_pEZPlot)
2901       m_pEZPlot->plot (&sgp);
2902   }
2903 }
2904
2905
2906 void
2907 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2908 {
2909   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
2910   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
2911   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
2912
2913   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
2914     if (m_pEZPlot)
2915       delete m_pEZPlot;
2916     m_pEZPlot = new EZPlot;
2917
2918     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
2919       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
2920
2921     if (m_bMinSpecified) {
2922       std::ostringstream os;
2923       os << "ymin " << m_dMinPixel;
2924       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2925     }
2926
2927     if (m_bMaxSpecified) {
2928       std::ostringstream os;
2929       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
2930       m_pEZPlot->ezset (os.str());
2931     }
2932
2933     m_pEZPlot->ezset("box");
2934     m_pEZPlot->ezset("grid");
2935
2936     double* pdXaxis = new double [iNRecords];
2937     rPlotFile.getColumn (0, pdXaxis);
2938
2939     double* pdY = new double [iNRecords];
2940     for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
2941       rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
2942       m_pEZPlot->addCurve (pdXaxis, pdY, iNRecords);
2943     }
2944
2945     delete pdXaxis;
2946     delete pdY;
2947   }
2948
2949   if (m_pCanvas)
2950     m_pCanvas->Refresh();
2951 }
2952
2953 bool
2954 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2955 {
2956   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
2957   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2958     return false;
2959
2960   Activate(false);
2961   if (m_pCanvas) {
2962     m_pCanvas->setView (NULL);
2963     m_pCanvas = NULL;
2964   }
2965   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2966   if (m_pFrame)
2967     m_pFrame->SetTitle(s);
2968
2969   SetFrame(NULL);
2970   if (deleteWindow) {
2971     delete m_pFrame;
2972     m_pFrame = NULL;
2973     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2974       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2975  }
2976
2977   return true;
2978 }
2979
2980
2981 ////////////////////////////////////////////////////////////////
2982
2983
2984 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
2985
2986 TextFileView::~TextFileView()
2987 {
2988   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2989   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2990 }
2991
2992 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2993 {
2994   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2995   SetFrame (m_pFrame);
2996
2997   int width, height;
2998   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
2999   m_pFrame->SetTitle("TextFile");
3000   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
3001   m_pFrame->SetTitle("Log");
3002
3003 #ifdef __X__
3004   // X seems to require a forced resize
3005   int x, y;
3006   frame->GetSize(&x, &y);
3007   frame->SetSize(-1, -1, x, y);
3008 #endif
3009
3010   m_pFrame->Show (true);
3011   Activate (true);
3012
3013   return true;
3014 }
3015
3016 // Handled by wxTextWindow
3017 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
3018 {
3019 }
3020
3021 void TextFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3022 {
3023 }
3024
3025 bool
3026 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3027 {
3028   if (! theApp->getMainFrame()->getShuttingDown())
3029     return false;
3030
3031   Activate(false);
3032   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3033   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3034     return false;
3035
3036   SetFrame(NULL);
3037   if (deleteWindow) {
3038     delete m_pFrame;
3039     m_pFrame = NULL;
3040     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3041       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3042   }
3043
3044   return TRUE;
3045 }
3046
3047 #if CTSIM_MDI
3048 wxDocMDIChildFrame*
3049 #else
3050 wxDocChildFrame*
3051 #endif
3052 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
3053 {
3054 #if CTSIM_MDI
3055   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0,0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3056 #else
3057   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3058 #endif
3059   theApp->setIconForFrame (subframe);
3060
3061  m_pFileMenu = new wxMenu;
3062
3063   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
3064   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
3065   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
3066   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
3067   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
3068   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
3069
3070   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3071   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
3072   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
3073   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
3074 #ifdef CTSIM_MDI
3075   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3076   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
3077   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
3078 #endif
3079   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3080   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3081
3082   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3083   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
3084   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
3085   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
3086   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
3087
3088   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3089
3090   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
3091   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
3092
3093   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3094   subframe->Centre(wxBOTH);
3095
3096   return subframe;
3097 }
3098
3099
3100 // Define a constructor for my text subwindow
3101 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
3102 : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
3103 {
3104 }
3105
3106 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3107 {
3108   m_pView = NULL;
3109 }