src/views.cpp

   1 /*****************************************************************************
   2 ** FILE IDENTIFICATION
   3 **
   4 **   Name:          views.cpp
   5 **   Purpose:       View & Canvas routines for CTSim program
   6 **   Programmer:    Kevin Rosenberg
   7 **   Date Started:  July 2000
   8 **
   9 **  This is part of the CTSim program
  10 **  Copyright (c) 1983-2001 Kevin Rosenberg
  11 **
  12 **  $Id: views.cpp,v 1.157 2002/06/02 17:57:02 kevin Exp $
  13 **
  14 **  This program is free software; you can redistribute it and/or modify
  15 **  it under the terms of the GNU General Public License (version 2) as
  16 **  published by the Free Software Foundation.
  17 **
  18 **  This program is distributed in the hope that it will be useful,
  19 **  but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  20 **  MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
  21 **  GNU General Public License for more details.
  22 **
  23 **  You should have received a copy of the GNU General Public License
  24 **  along with this program; if not, write to the Free Software
  25 **  Foundation, Inc., 59 Temple Place, Suite 330, Boston, MA  02111-1307  USA
  26 ******************************************************************************/
  27
  28 #include "wx/wxprec.h"
  29 #ifndef WX_PRECOMP
  30 #include "wx/wx.h"
  31 #endif
  32
  33 #if !wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE
  34 #error You must set wxUSE_DOC_VIEW_ARCHITECTURE to 1 in setup.h!
  35 #endif
  36
  37 #include "wx/image.h"
  38 #include "wx/progdlg.h"
  39 #include "wx/clipbrd.h"
  40
  41 #include "ct.h"
  42 #include "ctsim.h"
  43 #include "docs.h"
  44 #include "views.h"
  45 #include "dialogs.h"
  46 #include "dlgprojections.h"
  47 #include "dlgreconstruct.h"
  48 #include "backprojectors.h"
  49 #include "reconstruct.h"
  50 #include "timer.h"
  51 #include "threadproj.h"
  52 #include "threadrecon.h"
  53 #include "threadraster.h"
  54
  55 #if defined(MSVC) || HAVE_SSTREAM
  56 #include <sstream>
  57 #else
  58 #include <sstream_subst>
  59 #endif
  60
  61 // Used to reduce calls to progress bar update function
  62 const short int ITER_PER_UPDATE = 10;
  63
  64 // ImageFileCanvas
  65
  66 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileCanvas, wxScrolledWindow)
  67 EVT_MOUSE_EVENTS(ImageFileCanvas::OnMouseEvent)
  68 EVT_CHAR(ImageFileCanvas::OnChar)
  69 END_EVENT_TABLE()
  70
  71
  72 ImageFileCanvas::ImageFileCanvas (ImageFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
  73 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v), m_xCursor(-1), m_yCursor(-1)
  74 {
  75 }
  76
  77 ImageFileCanvas::~ImageFileCanvas()
  78 {}
  79
  80 void
  81 ImageFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
  82 {
  83   if (m_pView)
  84     m_pView->OnDraw(& dc);
  85 }
  86
  87 void
  88 ImageFileCanvas::DrawRubberBandCursor (wxDC& dc, int x, int y)
  89 {
  90   const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
  91   int nx = rIF.nx();
  92   int ny = rIF.ny();
  93
  94   int yPt = ny - y - 1;
  95   dc.SetLogicalFunction (wxINVERT);
  96   dc.SetPen (*wxGREEN_PEN);
  97   dc.DrawLine (0, yPt, nx, yPt);
  98   dc.DrawLine (x, 0, x, ny);
  99   dc.SetLogicalFunction (wxCOPY);
 100 }
 101
 102 bool
 103 ImageFileCanvas::GetCurrentCursor (int& x, int& y)
 104 {
 105   x = m_xCursor;
 106   y = m_yCursor;
 107
 108   if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0)
 109     return true;
 110   else
 111     return false;
 112 }
 113
 114 void
 115 ImageFileCanvas::OnMouseEvent(wxMouseEvent& event)
 116 {
 117   if (! m_pView)
 118     return;
 119
 120
 121   wxClientDC dc(this);
 122   PrepareDC(dc);
 123
 124   wxPoint pt(event.GetLogicalPosition(dc));
 125
 126   const ImageFileDocument* pIFDoc = m_pView->GetDocument();
 127   if (! pIFDoc)
 128     return;
 129   const ImageFile& rIF = pIFDoc->getImageFile();
 130   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
 131   int nx = rIF.nx();
 132   int ny = rIF.ny();
 133   const int yPt = ny - 1 - pt.y;
 134   if (event.RightIsDown()) {
 135     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 136       std::ostringstream os;
 137       os << "Image value (" << pt.x << "," << yPt << ") = " << v[pt.x][yPt];
 138       if (rIF.isComplex()) {
 139         double dImag = rIF.getImaginaryArray()[pt.x][yPt];
 140         if (dImag < 0)
 141           os << " - " << -dImag;
 142         else
 143           os << " + " << dImag;
 144         os << "i\n";
 145       } else
 146         os << "\n";
 147       *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 148     } else
 149       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 150   }
 151   else if (event.LeftIsDown() || event.LeftUp() || event.RightUp()) {
 152     if (pt.x >= 0 && pt.x < nx && pt.y >= 0 && pt.y < ny) {
 153       if (m_xCursor >= 0 && m_yCursor >= 0) {
 154         DrawRubberBandCursor (dc, m_xCursor, m_yCursor);
 155       }
 156       DrawRubberBandCursor (dc, pt.x, yPt);
 157       m_xCursor = pt.x;
 158       m_yCursor = yPt;
 159       wxMenu* pMenu = m_pView->getMenuAnalyze();
 160       if (pMenu && ! pMenu->IsEnabled(IFMENU_PLOT_ROW)) {
 161         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, true);
 162         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_COL, true);
 163         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, true);
 164         pMenu->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, true);
 165         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, true);
 166         pMenu->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, true);
 167       }
 168     } else
 169       *theApp->getLog() << "Mouse out of image range (" << pt.x << "," << yPt << ")\n";
 170   }
 171   if (event.LeftUp()) {
 172     std::ostringstream os;
 173     os << "Selected column " << pt.x << " , row " << yPt << "\n";
 174     *theApp->getLog() << os.str().c_str();
 175   }
 176 }
 177
 178 void
 179 ImageFileCanvas::OnChar (wxKeyEvent& event)
 180 {
 181   if (event.GetKeyCode() == WXK_ESCAPE) {
 182     m_xCursor = -1;
 183     m_yCursor = -1;
 184     if (m_pView)
 185       m_pView->OnUpdate (NULL);
 186   } else
 187     wxScrolledWindow::OnChar (event);
 188 }
 189
 190 wxSize
 191 ImageFileCanvas::GetBestSize() const
 192 {
 193   const int iMinX = 50;
 194   const int iMinY = 20;
 195   wxSize bestSize (iMinX,iMinY);
 196
 197   if (m_pView) {
 198     const ImageFile& rIF = m_pView->GetDocument()->getImageFile();
 199     bestSize.Set  (rIF.nx(), rIF.ny());
 200   }
 201
 202   if (bestSize.x > 800)
 203     bestSize.x = 800;
 204   if (bestSize.y > 800)
 205     bestSize.y = 800;
 206
 207   if (bestSize.y < iMinY)
 208     bestSize.y = iMinY;
 209   if (bestSize.x < iMinX)
 210     bestSize.x = iMinX;
 211
 212   return bestSize;
 213 }
 214
 215
 216 // ImageFileView
 217
 218 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ImageFileView, wxView)
 219
 220 BEGIN_EVENT_TABLE(ImageFileView, wxView)
 221 EVT_MENU(IFMENU_FILE_EXPORT, ImageFileView::OnExport)
 222 EVT_MENU(IFMENU_FILE_PROPERTIES, ImageFileView::OnProperties)
 223 EVT_MENU(IFMENU_EDIT_COPY, ImageFileView::OnEditCopy)
 224 EVT_MENU(IFMENU_EDIT_CUT, ImageFileView::OnEditCut)
 225 EVT_MENU(IFMENU_EDIT_PASTE, ImageFileView::OnEditPaste)
 226 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, ImageFileView::OnScaleMinMax)
 227 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, ImageFileView::OnScaleAuto)
 228 EVT_MENU(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, ImageFileView::OnScaleFull)
 229 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_IMAGES, ImageFileView::OnCompare)
 230 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_ROW, ImageFileView::OnCompareRow)
 231 EVT_MENU(IFMENU_COMPARE_COL, ImageFileView::OnCompareCol)
 232 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, ImageFileView::OnInvertValues)
 233 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQUARE, ImageFileView::OnSquare)
 234 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SQRT, ImageFileView::OnSquareRoot)
 235 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_LOG, ImageFileView::OnLog)
 236 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_EXP, ImageFileView::OnExp)
 237 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FOURIER, ImageFileView::OnFourier)
 238 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, ImageFileView::OnInverseFourier)
 239 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder)
 240 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder)
 241 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_ADD, ImageFileView::OnAdd)
 242 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, ImageFileView::OnSubtract)
 243 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, ImageFileView::OnMultiply)
 244 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_DIVIDE, ImageFileView::OnDivide)
 245 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, ImageFileView::OnScaleSize)
 246 #if wxUSE_GLCANVAS
 247 EVT_MENU(IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, ImageFileView::OnConvert3d)
 248 #endif
 249 #ifdef HAVE_FFT
 250 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT, ImageFileView::OnFFT)
 251 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT, ImageFileView::OnIFFT)
 252 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, ImageFileView::OnFFTRows)
 253 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, ImageFileView::OnIFFTRows)
 254 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_FFT_COLS, ImageFileView::OnFFTCols)
 255 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, ImageFileView::OnIFFTCols)
 256 #endif
 257 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, ImageFileView::OnMagnitude)
 258 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_PHASE, ImageFileView::OnPhase)
 259 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_REAL, ImageFileView::OnReal)
 260 EVT_MENU(IFMENU_FILTER_IMAGINARY, ImageFileView::OnImaginary)
 261 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_ROW, ImageFileView::OnPlotRow)
 262 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_COL, ImageFileView::OnPlotCol)
 263 #ifdef HAVE_FFT
 264 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_ROW, ImageFileView::OnPlotFFTRow)
 265 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_FFT_COL, ImageFileView::OnPlotFFTCol)
 266 #endif
 267 EVT_MENU(IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, ImageFileView::OnPlotHistogram)
 268 END_EVENT_TABLE()
 269
 270 ImageFileView::ImageFileView()
 271 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0), m_pFilterMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
 272 {
 273   m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG;
 274 }
 275
 276 ImageFileView::~ImageFileView()
 277 {
 278   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
 279   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
 280 }
 281
 282
 283 void
 284 ImageFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
 285 {
 286   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 287   if (rIF.nx() == 0 || rIF.ny() == 0)
 288     *theApp->getLog() << "Properties: empty imagefile\n";
 289   else {
 290     const std::string rFilename = m_pFrame->GetTitle().c_str();
 291     std::ostringstream os;
 292     double min, max, mean, mode, median, stddev;
 293     rIF.statistics (rIF.getArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 294     os << "Filename: " << rFilename << "\n";
 295     os << "Size: (" << rIF.nx() << "," << rIF.ny() << ")\n";
 296     os << "Data type: ";
 297     if (rIF.isComplex())
 298       os << "Complex\n";
 299     else
 300       os << "Real\n";
 301     os << "Minimum: "<<min<<"\nMaximum: "<<max<<"\nMean: "<<mean<<"\nMedian: "<<median<<"\nMode: "<<mode<<"\nStandard Deviation: "<<stddev << "\n";
 302     if (rIF.isComplex()) {
 303       rIF.statistics (rIF.getImaginaryArray(), min, max, mean, mode, median, stddev);
 304       os << "Imaginary: min: "<<min<<"\nmax: "<<max<<"\nmean: "<<mean<<"\nmedian: "<<median<<"\nmode: "<<mode<<"\nstddev: "<<stddev << "\n";
 305     }
 306     if (rIF.nLabels() > 0) {
 307       rIF.printLabelsBrief (os);
 308     }
 309     *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 310     wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Imagefile Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
 311     dialogMsg.ShowModal();
 312   }
 313   GetDocument()->Activate();
 314 }
 315
 316 void
 317 ImageFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
 318 {
 319   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 320   double min, max, mean, mode, median, stddev;
 321   rIF.statistics(min, max, mean, mode, median, stddev);
 322   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
 323   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
 324   if (iRetVal == wxID_OK) {
 325     m_bMinSpecified = true;
 326     m_bMaxSpecified = true;
 327     double dMin, dMax;
 328     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
 329       m_dMinPixel = dMin;
 330       m_dMaxPixel = dMax;
 331       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
 332       GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 333     }
 334   }
 335   GetDocument()->Activate();
 336 }
 337
 338 void
 339 ImageFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
 340 {
 341   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 342   double min, max;
 343   if (! m_bMinSpecified && ! m_bMaxSpecified)
 344     rIF.getMinMax (min, max);
 345
 346   if (m_bMinSpecified)
 347     min = m_dMinPixel;
 348   if (m_bMaxSpecified)
 349     max = m_dMaxPixel;
 350
 351   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Image Minimum & Maximum", min, max);
 352   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
 353   if (retVal == wxID_OK) {
 354     m_bMinSpecified = true;
 355     m_bMaxSpecified = true;
 356     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
 357     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
 358     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 359   }
 360   GetDocument()->Activate();
 361 }
 362
 363 void
 364 ImageFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
 365 {
 366   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
 367     m_bMinSpecified = false;
 368     m_bMaxSpecified = false;
 369     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 370   }
 371   GetDocument()->Activate();
 372 }
 373
 374 void
 375 ImageFileView::OnCompare (wxCommandEvent& event)
 376 {
 377   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 378   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 379
 380   if (vecIF.size() == 0) {
 381     wxMessageBox("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 382   } else {
 383     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare(getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIF, true);
 384
 385     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 386       const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 387       ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 388       const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
 389       std::ostringstream os;
 390       double min, max, mean, mode, median, stddev;
 391       rIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 392       os << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 393       rCompareIF.statistics (min, max, mean, mode, median, stddev);
 394       os << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": minimum=" << min << ", maximum=" << max << ", mean=" << mean << ", mode=" << mode << ", median=" << median << ", stddev=" << stddev << "\n";
 395       double d, r, e;
 396       rIF.comparativeStatistics (rCompareIF, d, r, e);
 397       os << "Comparative Statistics: d=" << d << ", r=" << r << ", e=" << e << "\n";
 398       *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
 399       if (dialogGetCompare.getMakeDifferenceImage()) {
 400         ImageFile* pDifferenceImage = new ImageFile;
 401
 402         pDifferenceImage->setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 403         if (! rIF.subtractImages (rCompareIF, *pDifferenceImage)) {
 404           *theApp->getLog() << "Unable to subtract images\n";
 405           delete pDifferenceImage;
 406           return;
 407         }
 408         ImageFileDocument* pDifferenceDoc = theApp->newImageDoc();
 409         if (! pDifferenceDoc) {
 410           sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 411           return;
 412         }
 413         pDifferenceDoc->setImageFile (pDifferenceImage);
 414
 415         wxString s = GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 416         pDifferenceImage->labelsCopy (rIF, s.c_str());
 417         s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 418         pDifferenceImage->labelsCopy (rCompareIF, s.c_str());
 419         std::ostringstream osLabel;
 420         osLabel << "Compare image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str()
 421           << " and " << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": "
 422           << os.str().c_str();
 423         pDifferenceImage->labelAdd (os.str().c_str());
 424         if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 425           pDifferenceDoc->Modify (true);
 426         pDifferenceDoc->UpdateAllViews(this);
 427         pDifferenceDoc->getView()->setInitialClientSize();
 428         pDifferenceDoc->Activate();
 429       }
 430       wxMessageBox(os.str().c_str(), "Image Comparison");
 431     }
 432   }
 433 }
 434
 435 void
 436 ImageFileView::OnInvertValues (wxCommandEvent& event)
 437 {
 438   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 439   rIF.invertPixelValues (rIF);
 440   rIF.labelAdd ("Invert Pixel Values");
 441   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 442     GetDocument()->Modify (true);
 443   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 444   GetDocument()->Activate();
 445 }
 446
 447 void
 448 ImageFileView::OnSquare (wxCommandEvent& event)
 449 {
 450   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 451   rIF.square (rIF);
 452   rIF.labelAdd ("Square Pixel Values");
 453   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 454     GetDocument()->Modify (true);
 455   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 456   GetDocument()->Activate();
 457 }
 458
 459 void
 460 ImageFileView::OnSquareRoot (wxCommandEvent& event)
 461 {
 462   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 463   rIF.sqrt (rIF);
 464   rIF.labelAdd ("Square-root Pixel Values");
 465   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 466     GetDocument()->Modify (true);
 467   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 468   GetDocument()->Activate();
 469 }
 470
 471 void
 472 ImageFileView::OnLog (wxCommandEvent& event)
 473 {
 474   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 475   rIF.log (rIF);
 476   rIF.labelAdd ("Logrithm base-e Pixel Values");
 477   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 478     GetDocument()->Modify (true);
 479   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 480   GetDocument()->Activate();
 481 }
 482
 483 void
 484 ImageFileView::OnExp (wxCommandEvent& event)
 485 {
 486   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 487   rIF.exp (rIF);
 488   rIF.labelAdd ("Exponent base-e Pixel Values");
 489   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 490     GetDocument()->Modify (true);
 491   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 492   GetDocument()->Activate();
 493 }
 494
 495 void
 496 ImageFileView::OnAdd (wxCommandEvent& event)
 497 {
 498   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 499   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 500
 501   if (vecIF.size() == 0) {
 502     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 503   } else {
 504     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Add", vecIF, false);
 505
 506     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 507       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 508       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 509       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 510       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 511       if (! pNewDoc) {
 512         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 513         return;
 514       }
 515       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 516       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 517       rIF.addImages (rRHSIF, newImage);
 518       std::ostringstream os;
 519       os << "Add image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 520         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 521       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 522       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 523       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 524       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 525       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 526       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 527       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 528         pNewDoc->Modify (true);
 529       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 530       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 531       pNewDoc->Activate();
 532     }
 533   }
 534 }
 535
 536 void
 537 ImageFileView::OnSubtract (wxCommandEvent& event)
 538 {
 539   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 540   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 541
 542   if (vecIF.size() == 0) {
 543     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 544   } else {
 545     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Subtract", vecIF, false);
 546
 547     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 548       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 549       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 550       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 551       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 552       if (! pNewDoc) {
 553         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 554         return;
 555       }
 556       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 557       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 558       rIF.subtractImages (rRHSIF, newImage);
 559       std::ostringstream os;
 560       os << "Subtract image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 561         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 562       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 563       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 564       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 565       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 566       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 567       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 568       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 569         pNewDoc->Modify (true);
 570       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 571       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 572       pNewDoc->Activate();
 573     }
 574   }
 575 }
 576
 577 void
 578 ImageFileView::OnMultiply (wxCommandEvent& event)
 579 {
 580   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 581   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 582
 583   if (vecIF.size() == 0) {
 584     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 585   } else {
 586     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Multiply", vecIF, false);
 587
 588     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 589       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 590       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 591       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 592       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 593       if (! pNewDoc) {
 594         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 595         return;
 596       }
 597       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 598       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 599       rIF.multiplyImages (rRHSIF, newImage);
 600       std::ostringstream os;
 601       os << "Multiply image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
 602         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 603       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 604       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 605       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 606       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 607       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 608       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 609       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 610         pNewDoc->Modify (true);
 611       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 612       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 613       pNewDoc->Activate();
 614     }
 615   }
 616 }
 617
 618 void
 619 ImageFileView::OnDivide (wxCommandEvent& event)
 620 {
 621   std::vector<ImageFileDocument*> vecIF;
 622   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIF);
 623
 624   if (vecIF.size() == 0) {
 625     wxMessageBox ("There are no compatible image files open for comparision", "No comparison images");
 626   } else {
 627     DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Image to Divide", vecIF, false);
 628
 629     if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
 630       ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 631       ImageFileDocument* pRHSDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
 632       const ImageFile& rRHSIF = pRHSDoc->getImageFile();
 633       ImageFileDocument* pNewDoc = theApp->newImageDoc();
 634       if (! pNewDoc) {
 635         sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
 636         return;
 637       }
 638       ImageFile& newImage = pNewDoc->getImageFile();
 639       newImage.setArraySize (rIF.nx(), rIF.ny());
 640       rIF.divideImages (rRHSIF, newImage);
 641       std::ostringstream os;
 642       os << "Divide image " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " by "
 643         << pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
 644       wxString s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 645       newImage.labelsCopy (rIF, s.c_str());
 646       s = pRHSDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle() + ": ";
 647       newImage.labelsCopy (rRHSIF, s.c_str());
 648       newImage.labelAdd (os.str().c_str());
 649       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
 650       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 651         pNewDoc->Modify (true);
 652       pNewDoc->UpdateAllViews (this);
 653       pNewDoc->getView()->setInitialClientSize();
 654       pNewDoc->Activate();
 655     }
 656   }
 657 }
 658
 659
 660 #ifdef HAVE_FFT
 661 void
 662 ImageFileView::OnFFT (wxCommandEvent& event)
 663 {
 664   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 665   rIF.fft (rIF);
 666   rIF.labelAdd ("FFT Image");
 667   m_bMinSpecified = false;
 668   m_bMaxSpecified = false;
 669   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 670     GetDocument()->Modify (true);
 671   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 672   GetDocument()->Activate();
 673 }
 674
 675 void
 676 ImageFileView::OnIFFT (wxCommandEvent& event)
 677 {
 678   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 679   rIF.ifft (rIF);
 680   rIF.labelAdd ("IFFT Image");
 681   m_bMinSpecified = false;
 682   m_bMaxSpecified = false;
 683   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 684     GetDocument()->Modify (true);
 685   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 686   GetDocument()->Activate();
 687 }
 688
 689 void
 690 ImageFileView::OnFFTRows (wxCommandEvent& event)
 691 {
 692   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 693   rIF.fftRows (rIF);
 694   rIF.labelAdd ("FFT Rows");
 695   m_bMinSpecified = false;
 696   m_bMaxSpecified = false;
 697   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 698     GetDocument()->Modify (true);
 699   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 700   GetDocument()->Activate();
 701 }
 702
 703 void
 704 ImageFileView::OnIFFTRows (wxCommandEvent& event)
 705 {
 706   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 707   rIF.ifftRows (rIF);
 708   rIF.labelAdd ("IFFT Rows");
 709   m_bMinSpecified = false;
 710   m_bMaxSpecified = false;
 711   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 712     GetDocument()->Modify (true);
 713   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 714   GetDocument()->Activate();
 715 }
 716
 717 void
 718 ImageFileView::OnFFTCols (wxCommandEvent& event)
 719 {
 720   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 721   rIF.fftCols (rIF);
 722   rIF.labelAdd ("FFT Columns");
 723   m_bMinSpecified = false;
 724   m_bMaxSpecified = false;
 725   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 726     GetDocument()->Modify (true);
 727   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 728   GetDocument()->Activate();
 729 }
 730
 731 void
 732 ImageFileView::OnIFFTCols (wxCommandEvent& event)
 733 {
 734   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 735   rIF.ifftCols (rIF);
 736   rIF.labelAdd ("IFFT Columns");
 737   m_bMinSpecified = false;
 738   m_bMaxSpecified = false;
 739   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 740     GetDocument()->Modify (true);
 741   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 742   GetDocument()->Activate();
 743 }
 744 #endif
 745
 746 void
 747 ImageFileView::OnFourier (wxCommandEvent& event)
 748 {
 749   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 750   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Fourier"), wxString("Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 751   rIF.fourier (rIF);
 752   rIF.labelAdd ("Fourier Image");
 753   m_bMinSpecified = false;
 754   m_bMaxSpecified = false;
 755   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 756     GetDocument()->Modify (true);
 757   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 758   GetDocument()->Activate();
 759 }
 760
 761 void
 762 ImageFileView::OnInverseFourier (wxCommandEvent& event)
 763 {
 764   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 765   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Inverse Fourier"), wxString("Inverse Fourier Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
 766   rIF.inverseFourier (rIF);
 767   rIF.labelAdd ("Inverse Fourier Image");
 768   m_bMinSpecified = false;
 769   m_bMaxSpecified = false;
 770   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 771     GetDocument()->Modify (true);
 772   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 773   GetDocument()->Activate();
 774 }
 775
 776 void
 777 ImageFileView::OnShuffleNaturalToFourierOrder (wxCommandEvent& event)
 778 {
 779   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 780   Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (rIF);
 781   rIF.labelAdd ("Shuffle Natural To Fourier Order");
 782   m_bMinSpecified = false;
 783   m_bMaxSpecified = false;
 784   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 785     GetDocument()->Modify (true);
 786   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 787   GetDocument()->Activate();
 788 }
 789
 790 void
 791 ImageFileView::OnShuffleFourierToNaturalOrder (wxCommandEvent& event)
 792 {
 793   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 794   Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (rIF);
 795   rIF.labelAdd ("Shuffle Fourier To Natural Order");
 796   m_bMinSpecified = false;
 797   m_bMaxSpecified = false;
 798   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 799     GetDocument()->Modify (true);
 800   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 801   GetDocument()->Activate();
 802 }
 803
 804 void
 805 ImageFileView::OnMagnitude (wxCommandEvent& event)
 806 {
 807   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 808   rIF.magnitude (rIF);
 809   rIF.labelAdd ("Magnitude");
 810   m_bMinSpecified = false;
 811   m_bMaxSpecified = false;
 812   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 813     GetDocument()->Modify (true);
 814   GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 815   GetDocument()->Activate();
 816 }
 817
 818 void
 819 ImageFileView::OnPhase (wxCommandEvent& event)
 820 {
 821   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 822   if (rIF.isComplex()) {
 823     rIF.phase (rIF);
 824     rIF.labelAdd ("Phase of complex-image");
 825     m_bMinSpecified = false;
 826     m_bMaxSpecified = false;
 827     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 828       GetDocument()->Modify (true);
 829     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 830   }
 831   GetDocument()->Activate();
 832 }
 833
 834 void
 835 ImageFileView::OnReal (wxCommandEvent& event)
 836 {
 837   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 838   if (rIF.isComplex()) {
 839     rIF.real (rIF);
 840     rIF.labelAdd ("Real component of complex-image");
 841     m_bMinSpecified = false;
 842     m_bMaxSpecified = false;
 843     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 844       GetDocument()->Modify (true);
 845     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 846   }
 847   GetDocument()->Activate();
 848 }
 849
 850 void
 851 ImageFileView::OnImaginary (wxCommandEvent& event)
 852 {
 853   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
 854   if (rIF.isComplex()) {
 855     rIF.imaginary (rIF);
 856     rIF.labelAdd ("Imaginary component of complex-image");
 857     m_bMinSpecified = false;
 858     m_bMaxSpecified = false;
 859     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
 860       GetDocument()->Modify (true);
 861     GetDocument()->UpdateAllViews (this);
 862   }
 863   GetDocument()->Activate();
 864 }
 865
 866
 867 ImageFileCanvas*
 868 ImageFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
 869 {
 870   ImageFileCanvas* pCanvas = new ImageFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0),
 871                                                   wxSize(0,0), 0);
 872   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
 873   pCanvas->Clear();
 874
 875   return pCanvas;
 876 }
 877
 878 #if CTSIM_MDI
 879 wxDocMDIChildFrame*
 880 #else
 881 wxDocChildFrame*
 882 #endif
 883 ImageFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
 884 {
 885 #if CTSIM_MDI
 886   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(10,10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 887 #else
 888   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "ImageFile Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
 889 #endif
 890   theApp->setIconForFrame (subframe);
 891
 892   m_pFileMenu = new wxMenu;
 893   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
 894   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
 895   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
 896   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
 897   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
 898   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
 899   m_pFileMenu->Append(wxID_REVERT, "Re&vert");
 900
 901   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 902   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
 903   m_pFileMenu->Append(IFMENU_FILE_EXPORT, "Expor&t...");
 904
 905   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 906   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
 907   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
 908   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Preview");
 909   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 910   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
 911 #ifdef CTSIM_MDI
 912   m_pFileMenu->AppendSeparator();
 913   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
 914   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
 915 #endif
 916   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
 917   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
 918
 919   wxMenu* edit_menu = new wxMenu;
 920   edit_menu->Append(IFMENU_EDIT_COPY, "Copy\tCtrl-C");
 921   edit_menu->Append(IFMENU_EDIT_CUT, "Cut\tCtrl-X");
 922   edit_menu->Append(IFMENU_EDIT_PASTE, "Paste\tCtrl-V");
 923
 924   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
 925   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale S&et...\tCtrl-E");
 926   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
 927   view_menu->Append(IFMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display F&ull Scale\tCtrl-U");
 928
 929   m_pFilterMenu = new wxMenu;
 930   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_INVERTVALUES, "In&vert Values");
 931   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SQUARE, "&Square");
 932   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SQRT, "Square &Root");
 933   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_LOG, "&Log");
 934   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_EXP, "E&xp");
 935   m_pFilterMenu->AppendSeparator();
 936 #ifdef HAVE_FFT
 937   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FFT, "2-D &FFT\tCtrl-2");
 938   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT, "2-D &IFFT\tAlt-2");
 939   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_ROWS, "FFT Rows");
 940   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_ROWS, "IFFT Rows");
 941   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FFT_COLS, "FFT Columns");
 942   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IFFT_COLS, "IFFT Columns");
 943   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "2-D F&ourier");
 944   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "2-D Inverse Fo&urier");
 945 #else
 946   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_FOURIER, "&Fourier");
 947   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_INVERSE_FOURIER, "&Inverse Fourier");
 948 #endif
 949   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLEFOURIERTONATURALORDER, "Shuffl&e Fourier to Natural Order");
 950   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_SHUFFLENATURALTOFOURIERORDER, "Shuffle &Natural to Fourier Order");
 951   m_pFilterMenu->AppendSeparator();
 952   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_MAGNITUDE, "&Magnitude");
 953   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_PHASE, "&Phase");
 954   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_REAL, "Re&al");
 955   m_pFilterMenu->Append (IFMENU_FILTER_IMAGINARY, "Ima&ginary");
 956
 957   wxMenu* image_menu = new wxMenu;
 958   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_ADD, "&Add...");
 959   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SUBTRACT, "&Subtract...");
 960   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_MULTIPLY, "&Multiply...");
 961   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_DIVIDE, "&Divide...");
 962   image_menu->AppendSeparator();
 963   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_SCALESIZE, "S&cale Size...");
 964 #if wxUSE_GLCANVAS
 965   image_menu->Append (IFMENU_IMAGE_CONVERT3D, "Convert &3-D\tCtrl-3");
 966 #endif
 967
 968   m_pMenuAnalyze = new wxMenu;
 969   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_ROW, "Plot &Row");
 970   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_COL, "Plot &Column");
 971   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_HISTOGRAM, "Plot &Histogram");
 972   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 973   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, "P&lot FFT Row");
 974   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_PLOT_FFT_COL, "Plo&t FFT Column");
 975   m_pMenuAnalyze->AppendSeparator();
 976   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_IMAGES, "Compare &Images...");
 977   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_ROW, "Compare Ro&w");
 978   m_pMenuAnalyze->Append (IFMENU_COMPARE_COL, "Compare Colu&mn");
 979   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_ROW, false);
 980   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_COL, false);
 981   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_ROW, false);
 982   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_COMPARE_COL, false);
 983   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_ROW, false);
 984   m_pMenuAnalyze->Enable (IFMENU_PLOT_FFT_COL, false);
 985
 986   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
 987   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
 988   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
 989   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
 990   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
 991
 992   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
 993
 994   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
 995   menu_bar->Append(edit_menu, "&Edit");
 996   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
 997   menu_bar->Append(image_menu, "&Image");
 998   menu_bar->Append(m_pFilterMenu, "Fi&lter");
 999   menu_bar->Append(m_pMenuAnalyze, "&Analyze");
1000   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
1001
1002   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
1003
1004   subframe->Centre(wxBOTH);
1005
1006   wxAcceleratorEntry accelEntries[10];
1007   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), IFMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
1008   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), IFMENU_VIEW_SCALE_FULL);
1009   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), IFMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
1010   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), IFMENU_FILE_PROPERTIES);
1011   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('C'), IFMENU_EDIT_COPY);
1012   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('X'), IFMENU_EDIT_CUT);
1013   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('V'), IFMENU_EDIT_PASTE);
1014   int iEntry = 7;
1015 #ifdef HAVE_FFT
1016   accelEntries[iEntry++].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('2'), IFMENU_FILTER_FFT);
1017   accelEntries[iEntry++].Set (wxACCEL_ALT,  static_cast<int>('2'), IFMENU_FILTER_IFFT);
1018 #endif
1019 #if wxUSE_GLCANVAS
1020   accelEntries[iEntry++].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('3'), IFMENU_IMAGE_CONVERT3D);
1021 #endif
1022   wxAcceleratorTable accelTable (iEntry, accelEntries);
1023
1024   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
1025
1026   return subframe;
1027 }
1028
1029
1030 bool
1031 ImageFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
1032 {
1033   m_bMinSpecified = false;
1034   m_bMaxSpecified = false;
1035   m_dAutoScaleFactor = 1.;
1036
1037   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
1038   SetFrame (m_pFrame);
1039   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
1040   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
1041   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
1042   m_pFrame->SetTitle("ImageFileView");
1043
1044   m_pFrame->Show(true);
1045   Activate(true);
1046
1047   return true;
1048 }
1049
1050 void
1051 ImageFileView::setInitialClientSize ()
1052 {
1053   if (m_pFrame && m_pCanvas) {
1054     wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
1055
1056     m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
1057     m_pFrame->Show (true);
1058     m_pFrame->SetFocus();
1059   }
1060 }
1061
1062 void
1063 ImageFileView::OnDraw (wxDC* dc)
1064 {
1065   if (m_bitmap.Ok())
1066     dc->DrawBitmap(m_bitmap, 0, 0, false);
1067
1068   int xCursor, yCursor;
1069   if (m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor))
1070     m_pCanvas->DrawRubberBandCursor (*dc, xCursor, yCursor);
1071 }
1072
1073
1074 void
1075 ImageFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
1076 {
1077   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1078   if (m_pFilterMenu && rIF.isComplex()) {
1079     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_REAL, true);
1080     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_IMAGINARY, true);
1081     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_PHASE, true);
1082   } else {
1083     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_REAL, false);
1084     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_IMAGINARY, false);
1085     m_pFilterMenu->Enable(IFMENU_FILTER_PHASE, false);
1086   }
1087   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1088   int nx = rIF.nx();
1089   int ny = rIF.ny();
1090   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1091     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1092       double min, max;
1093       rIF.getMinMax (min, max);
1094       if (! m_bMinSpecified)
1095         m_dMinPixel = min;
1096       if (! m_bMaxSpecified)
1097         m_dMaxPixel = max;
1098     }
1099     double scaleWidth = m_dMaxPixel - m_dMinPixel;
1100
1101     unsigned char* imageData = new unsigned char [nx * ny * 3];
1102     if (! imageData) {
1103       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for Image display");
1104       return;
1105     }
1106     for (int ix = 0; ix < nx; ix++) {
1107       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1108         double scaleValue = ((v[ix][iy] - m_dMinPixel) / scaleWidth) * 255;
1109         int intensity = static_cast<int>(scaleValue + 0.5);
1110         intensity = clamp (intensity, 0, 255);
1111         int baseAddr = ((ny - 1 - iy) * nx + ix) * 3;
1112         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
1113       }
1114     }
1115     wxImage image (nx, ny, imageData, true);
1116     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
1117     delete imageData;
1118     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nx/20, ny/20);
1119     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
1120   }
1121
1122   if (m_pCanvas)
1123     m_pCanvas->Refresh();
1124 }
1125
1126 bool
1127 ImageFileView::OnClose (bool deleteWindow)
1128 {
1129   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
1130     return false;
1131
1132   Activate (false);
1133   if (m_pCanvas) {
1134     m_pCanvas->setView(NULL);
1135     m_pCanvas = NULL;
1136   }
1137   wxString s(theApp->GetAppName());
1138   if (m_pFrame)
1139     m_pFrame->SetTitle(s);
1140
1141   SetFrame(NULL);
1142
1143   if (deleteWindow) {
1144     delete m_pFrame;
1145     m_pFrame = NULL;
1146     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
1147       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
1148   }
1149
1150   return true;
1151 }
1152
1153 void
1154 ImageFileView::OnEditCopy (wxCommandEvent& event)
1155 {
1156   wxBitmapDataObject *pBitmapObject = new wxBitmapDataObject;
1157
1158   pBitmapObject->SetBitmap (m_bitmap);
1159
1160   if (wxTheClipboard->Open()) {
1161     wxTheClipboard->SetData (pBitmapObject);
1162     wxTheClipboard->Close();
1163   }
1164 }
1165
1166 void
1167 ImageFileView::OnEditCut (wxCommandEvent& event)
1168 {
1169   OnEditCopy (event);
1170   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1171   int nx = rIF.nx();
1172   int ny = rIF.ny();
1173   ImageFile* pIF = new ImageFile (nx, ny);
1174   pIF->arrayDataClear();
1175   GetDocument()->setImageFile (pIF); // deletes old IF
1176   OnUpdate(this, NULL);
1177   GetDocument()->UpdateAllViews();
1178   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1179     GetDocument()->Modify (true);
1180 }
1181
1182 void
1183 ImageFileView::OnEditPaste (wxCommandEvent& event)
1184 {
1185   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1186
1187   if (wxTheClipboard->Open()) {
1188     wxBitmap bitmap;
1189     if (wxTheClipboard->IsSupported (wxDF_BITMAP)) {
1190       wxBitmapDataObject bitmapObject;
1191       wxTheClipboard->GetData (bitmapObject);
1192       bitmap = bitmapObject.GetBitmap ();
1193     }
1194     wxTheClipboard->Close();
1195
1196     int nx = rIF.nx();
1197     int ny = rIF.ny();
1198     bool bMonochrome = false;
1199
1200     if (bitmap.Ok() == true && bitmap.GetWidth() == nx && bitmap.GetHeight() == ny) {
1201       wxImage image (bitmap);
1202       double dScale3 = 3 * 255;
1203       unsigned char* pixels = image.GetData();
1204       ImageFileArray v = rIF.getArray();
1205       for (unsigned int ix = 0; ix < rIF.nx(); ix++) {
1206         for (unsigned int iy = 0; iy < rIF.ny(); iy++) {
1207           unsigned int iBase = 3 * (iy * nx + ix);
1208           if (ix == 0 && iy == 0 && (pixels[iBase] == pixels[iBase+1] && pixels[iBase+1] == pixels[iBase+2]))
1209             bMonochrome = true;
1210           if (bMonochrome) {
1211             v[ix][ny - 1 - iy] = (pixels[iBase]+pixels[iBase+1]+pixels[iBase+2]) / dScale3;
1212           } else {
1213             double dR = pixels[iBase] / 255.;
1214             double dG = pixels[iBase+1] / 255.;
1215             double dB = pixels[iBase+2] / 255.;
1216             v[ix][ny - 1 - iy] = ImageFile::colorToGrayscale (dR, dG, dB);
1217           }
1218         }
1219       }
1220       OnUpdate(this, NULL);
1221       GetDocument()->UpdateAllViews();
1222       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1223         GetDocument()->Modify(true);
1224     }
1225   }
1226 }
1227
1228 void
1229 ImageFileView::OnExport (wxCommandEvent& event)
1230 {
1231   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1232   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1233   int nx = rIF.nx();
1234   int ny = rIF.ny();
1235   if (v != NULL && nx != 0 && ny != 0) {
1236     if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
1237       double min, max;
1238       rIF.getMinMax (min, max);
1239       if (! m_bMinSpecified)
1240         m_dMinPixel = min;
1241       if (! m_bMaxSpecified)
1242         m_dMaxPixel = max;
1243     }
1244
1245     DialogExportParameters dialogExport (getFrameForChild(), m_iDefaultExportFormatID);
1246     if (dialogExport.ShowModal() == wxID_OK) {
1247       wxString strFormatName (dialogExport.getFormatName ());
1248       m_iDefaultExportFormatID = ImageFile::convertExportFormatNameToID (strFormatName.c_str());
1249
1250       wxString strExt;
1251       wxString strWildcard;
1252       if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PGM || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PGMASCII) {
1253         strExt = ".pgm";
1254         strWildcard = "PGM Files (*.pgm)|*.pgm";
1255       }
1256 #ifdef HAVE_PNG
1257       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG || m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_PNG16) {
1258         strExt = ".png";
1259         strWildcard = "PNG Files (*.png)|*.png";
1260       }
1261 #endif
1262 #ifdef HAVE_CTN_DICOM
1263       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_DICOM) {
1264         strExt = "";
1265         strWildcard = "DICOM Files (*.*)|*.*";
1266       }
1267 #endif
1268       else if (m_iDefaultExportFormatID == ImageFile::EXPORT_FORMAT_TEXT) {
1269         strExt = ".txt";
1270         strWildcard = "Text (*.txt)|*.txt";
1271       }
1272       else {
1273         strExt = "";
1274         strWildcard = "Miscellaneous (*.*)|*.*";
1275       }
1276
1277       const wxString& strFilename = wxFileSelector (wxString("Export Filename"), wxString(""),
1278         wxString(""), strExt, strWildcard, wxOVERWRITE_PROMPT | wxHIDE_READONLY | wxSAVE);
1279       if (strFilename) {
1280         rIF.exportImage (strFormatName.c_str(), strFilename.c_str(), 1, 1, m_dMinPixel, m_dMaxPixel);
1281         *theApp->getLog() << "Exported file " << strFilename << "\n";
1282       }
1283     }
1284   }
1285 }
1286
1287 void
1288 ImageFileView::OnScaleSize (wxCommandEvent& event)
1289 {
1290   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1291   unsigned int iOldNX = rIF.nx();
1292   unsigned int iOldNY = rIF.ny();
1293
1294   DialogGetXYSize dialogGetXYSize (getFrameForChild(), "Set New X & Y Dimensions", iOldNX, iOldNY);
1295   if (dialogGetXYSize.ShowModal() == wxID_OK) {
1296     unsigned int iNewNX = dialogGetXYSize.getXSize();
1297     unsigned int iNewNY = dialogGetXYSize.getYSize();
1298     std::ostringstream os;
1299     os << "Scale Size from (" << iOldNX << "," << iOldNY << ") to (" << iNewNX << "," << iNewNY << ")";
1300     ImageFileDocument* pScaledDoc = theApp->newImageDoc();
1301     if (! pScaledDoc) {
1302       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
1303       return;
1304     }
1305     ImageFile& rScaledIF = pScaledDoc->getImageFile();
1306     rScaledIF.setArraySize (iNewNX, iNewNY);
1307     rScaledIF.labelsCopy (rIF);
1308     rScaledIF.labelAdd (os.str().c_str());
1309     rIF.scaleImage (rScaledIF);
1310     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1311     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1312       pScaledDoc->Modify (true);
1313     pScaledDoc->UpdateAllViews (this);
1314     pScaledDoc->getView()->setInitialClientSize();
1315     pScaledDoc->Activate();
1316   }
1317 }
1318
1319 #if wxUSE_GLCANVAS
1320 void
1321 ImageFileView::OnConvert3d (wxCommandEvent& event)
1322 {
1323   ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1324   Graph3dFileDocument* pGraph3d = theApp->newGraph3dDoc();
1325   pGraph3d->setBadFileOpen();
1326   pGraph3d->createFromImageFile (rIF);
1327   pGraph3d->getView()->OnUpdate (this, NULL);
1328   pGraph3d->UpdateAllViews();
1329   pGraph3d->getView()->getFrame()->SetClientSize (400, 400);
1330   pGraph3d->getView()->getFrame()->Show (true);
1331   GetDocumentManager()->ActivateView (pGraph3d->getView(), true, false);
1332   ::wxYield();
1333   pGraph3d->getView()->getCanvas()->SetFocus();
1334 }
1335 #endif
1336
1337 void
1338 ImageFileView::OnPlotRow (wxCommandEvent& event)
1339 {
1340   int xCursor, yCursor;
1341   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1342     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1343     return;
1344   }
1345
1346   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1347   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1348   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1349   int nx = rIF.nx();
1350   int ny = rIF.ny();
1351
1352   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1353     double* pX = new double [nx];
1354     double* pYReal = new double [nx];
1355     double *pYImag = NULL;
1356     double *pYMag = NULL;
1357     if (rIF.isComplex()) {
1358       pYImag = new double [nx];
1359       pYMag = new double [nx];
1360     }
1361     for (int i = 0; i < nx; i++) {
1362       pX[i] = i;
1363       pYReal[i] = v[i][yCursor];
1364       if (rIF.isComplex()) {
1365         pYImag[i] = vImag[i][yCursor];
1366         pYMag[i] = ::sqrt (v[i][yCursor] * v[i][yCursor] + vImag[i][yCursor] * vImag[i][yCursor]);
1367       }
1368     }
1369     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1370     if (! pPlotDoc) {
1371       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1372     } else {
1373       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1374       std::ostringstream os;
1375       os << "Row " << yCursor;
1376       std::string title("title ");
1377       title += os.str();
1378       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1379       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1380       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1381       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1382       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1383       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1384       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1385       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1386       if (rIF.isComplex()) {
1387         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1388         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1389         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1390         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1391         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1392         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1393         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1394         rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1395       } else
1396         rPlotFile.setCurveSize (2, nx);
1397       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1398       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1399       if (rIF.isComplex()) {
1400         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1401         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1402       }
1403       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1404         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1405       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1406       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1407       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1408     }
1409     delete pX;
1410     delete pYReal;
1411     if (rIF.isComplex()) {
1412       delete pYImag;
1413       delete pYMag;
1414     }
1415     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1416       pPlotDoc->Modify (true);
1417     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1418     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1419     pPlotDoc->Activate();
1420   }
1421 }
1422
1423 void
1424 ImageFileView::OnPlotCol (wxCommandEvent& event)
1425 {
1426   int xCursor, yCursor;
1427   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1428     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1429     return;
1430   }
1431
1432   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1433   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1434   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1435   int nx = rIF.nx();
1436   int ny = rIF.ny();
1437
1438   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1439     double* pX = new double [ny];
1440     double* pYReal = new double [ny];
1441     double* pYImag = NULL;
1442     double* pYMag = NULL;
1443     if (rIF.isComplex()) {
1444       pYImag = new double [ny];
1445       pYMag = new double [ny];
1446     }
1447     for (int i = 0; i < ny; i++) {
1448       pX[i] = i;
1449       pYReal[i] = v[xCursor][i];
1450       if (rIF.isComplex()) {
1451         pYImag[i] = vImag[xCursor][i];
1452         pYMag[i] = ::sqrt (v[xCursor][i] * v[xCursor][i] + vImag[xCursor][i] * vImag[xCursor][i]);
1453       }
1454     }
1455     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1456     if (! pPlotDoc) {
1457       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1458     } else {
1459       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1460       std::ostringstream os;
1461       os << "Column " << xCursor;
1462       std::string title("title ");
1463       title += os.str();
1464       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1465       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1466       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1467       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1468       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1469       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1470       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1471       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1472       if (rIF.isComplex()) {
1473         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1474         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1475         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1476         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1477         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1478         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1479         rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1480         rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1481       } else
1482         rPlotFile.setCurveSize (2, ny);
1483       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1484       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1485       if (rIF.isComplex()) {
1486         rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1487         rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1488       }
1489       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1490         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1491       os << " Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1492       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1493       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1494     }
1495     delete pX;
1496     delete pYReal;
1497     if (rIF.isComplex()) {
1498       delete pYImag;
1499       delete pYMag;
1500     }
1501     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1502       pPlotDoc->Modify (true);
1503     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1504     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1505     pPlotDoc->Activate();
1506   }
1507 }
1508
1509 #ifdef HAVE_FFT
1510 void
1511 ImageFileView::OnPlotFFTRow (wxCommandEvent& event)
1512 {
1513   int xCursor, yCursor;
1514   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1515     wxMessageBox ("No row selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1516     return;
1517   }
1518
1519   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1520   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1521   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1522   int nx = rIF.nx();
1523   int ny = rIF.ny();
1524
1525   if (v != NULL && yCursor < ny) {
1526     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [nx];
1527
1528     int i;
1529     for (i = 0; i < nx; i++) {
1530       pcIn[i].re = v[i][yCursor];
1531       if (rIF.isComplex())
1532         pcIn[i].im = vImag[i][yCursor];
1533       else
1534         pcIn[i].im = 0;
1535     }
1536
1537     fftw_plan plan = fftw_create_plan (nx, FFTW_FORWARD, FFTW_IN_PLACE | FFTW_ESTIMATE | FFTW_USE_WISDOM);
1538     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1539     fftw_destroy_plan (plan);
1540
1541     double* pX = new double [nx];
1542     double* pYReal = new double [nx];
1543     double* pYImag = new double [nx];
1544     double* pYMag = new double [nx];
1545     for (i = 0; i < nx; i++) {
1546       pX[i] = i;
1547       pYReal[i] = pcIn[i].re / nx;
1548       pYImag[i] = pcIn[i].im / nx;
1549       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1550     }
1551     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYReal, nx);
1552     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYImag, nx);
1553     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (pYMag, nx);
1554
1555     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1556     if (! pPlotDoc) {
1557       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1558     } else {
1559       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1560       std::ostringstream os;
1561       os << "Row " << yCursor;
1562       std::string title("title ");
1563       title += os.str();
1564       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1565       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1566       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1567       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1568       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1569       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1570       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1571       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1572       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1573       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1574       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1575       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1576       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1577       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1578       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1579       rPlotFile.setCurveSize (4, nx);
1580       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1581       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1582       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1583       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1584       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1585         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1586       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1587       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1588       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1589     }
1590     delete pX;
1591     delete pYReal;
1592     delete pYImag;
1593     delete pYMag;
1594     delete [] pcIn;
1595
1596     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1597       pPlotDoc->Modify (true);
1598     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1599     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1600     pPlotDoc->Activate();
1601   }
1602 }
1603
1604 void
1605 ImageFileView::OnPlotFFTCol (wxCommandEvent& event)
1606 {
1607   int xCursor, yCursor;
1608   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1609     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1610     return;
1611   }
1612
1613   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1614   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1615   ImageFileArrayConst vImag = rIF.getImaginaryArray();
1616   int nx = rIF.nx();
1617   int ny = rIF.ny();
1618
1619   if (v != NULL && xCursor < nx) {
1620     fftw_complex* pcIn = new fftw_complex [ny];
1621     double *pdTemp = new double [ny];
1622
1623     int i;
1624     for (i = 0; i < ny; i++)
1625       pdTemp[i] = v[xCursor][i];
1626     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1627     for (i = 0; i < ny; i++)
1628       pcIn[i].re = pdTemp[i];
1629
1630     for (i = 0; i < ny; i++) {
1631       if (rIF.isComplex())
1632         pdTemp[i] = vImag[xCursor][i];
1633       else
1634         pdTemp[i] = 0;
1635     }
1636     Fourier::shuffleNaturalToFourierOrder (pdTemp, ny);
1637     for (i = 0; i < ny; i++)
1638       pcIn[i].im = pdTemp[i];
1639
1640     fftw_plan plan = fftw_create_plan (ny, FFTW_BACKWARD, FFTW_IN_PLACE | FFTW_ESTIMATE | FFTW_USE_WISDOM);
1641     fftw_one (plan, pcIn, NULL);
1642     fftw_destroy_plan (plan);
1643
1644     double* pX = new double [ny];
1645     double* pYReal = new double [ny];
1646     double* pYImag = new double [ny];
1647     double* pYMag = new double [ny];
1648     for (i = 0; i < ny; i++) {
1649       pX[i] = i;
1650       pYReal[i] = pcIn[i].re / ny;
1651       pYImag[i] = pcIn[i].im / ny;
1652       pYMag[i] = ::sqrt (pcIn[i].re * pcIn[i].re + pcIn[i].im * pcIn[i].im);
1653     }
1654
1655     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1656     if (! pPlotDoc) {
1657       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1658     } else {
1659       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1660       std::ostringstream os;
1661       os << "Column " << xCursor;
1662       std::string title("title ");
1663       title += os.str();
1664       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1665       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1666       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1667       rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1668       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1669       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 1");
1670       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 1");
1671       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1672       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1673       rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 3");
1674       rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 3");
1675       rPlotFile.addEzsetCommand ("color 0");
1676       rPlotFile.addEzsetCommand ("solid");
1677       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1678       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1679       rPlotFile.setCurveSize (4, ny);
1680       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1681       rPlotFile.addColumn (1, pYReal);
1682       rPlotFile.addColumn (2, pYImag);
1683       rPlotFile.addColumn (3, pYMag);
1684       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++)
1685         rPlotFile.addDescription (rIF.labelGet(iL).getLabelString().c_str());
1686       os << " FFT Plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1687       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1688       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1689     }
1690     delete pX;
1691     delete pYReal;
1692     delete pYImag;
1693     delete pYMag;
1694     delete pdTemp;
1695     delete [] pcIn;
1696
1697     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1698       pPlotDoc->Modify (true);
1699     pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1700     pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1701     pPlotDoc->Activate();
1702   }
1703 }
1704 #endif
1705
1706 void
1707 ImageFileView::OnCompareCol (wxCommandEvent& event)
1708 {
1709   int xCursor, yCursor;
1710   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1711     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1712     return;
1713   }
1714
1715   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1716   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1717   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1718     wxMessageBox ("No compatible images for Column Comparison", "Error");
1719     return;
1720   }
1721   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1722
1723   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1724     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1725     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1726     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1727
1728     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1729     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1730     int nx = rIF.nx();
1731     int ny = rIF.ny();
1732
1733     if (v1 != NULL && xCursor < nx) {
1734       double* pX = new double [ny];
1735       double* pY1 = new double [ny];
1736       double* pY2 = new double [ny];
1737       for (int i = 0; i < ny; i++) {
1738         pX[i] = i;
1739         pY1[i] = v1[xCursor][i];
1740         pY2[i] = v2[xCursor][i];
1741       }
1742       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1743       if (! pPlotDoc) {
1744         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1745       } else {
1746         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1747         std::ostringstream os;
1748         os << "Column " << xCursor << " Comparison";
1749         std::string title("title ");
1750         title += os.str();
1751         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1752         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Row");
1753         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1754         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1755         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1756         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1757         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1758         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1759         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1760         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1761         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1762         rPlotFile.setCurveSize (3, ny);
1763         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1764         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1765         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1766
1767         unsigned int iL;
1768         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1769           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1770           s += ": ";
1771           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1772           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1773         }
1774         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1775           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1776           s += ": ";
1777           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1778           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1779         }
1780         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1781           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1782         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1783         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1784       }
1785       delete pX;
1786       delete pY1;
1787       delete pY2;
1788       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1789         pPlotDoc->Modify (true);
1790       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1791       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1792       pPlotDoc->Activate();
1793     }
1794   }
1795 }
1796
1797 void
1798 ImageFileView::OnCompareRow (wxCommandEvent& event)
1799 {
1800   int xCursor, yCursor;
1801   if (! m_pCanvas->GetCurrentCursor (xCursor, yCursor)) {
1802     wxMessageBox ("No column selected. Please use left mouse button on image to select column","Error");
1803     return;
1804   }
1805
1806   std::vector<ImageFileDocument*> vecIFDoc;
1807   theApp->getCompatibleImages (GetDocument(), vecIFDoc);
1808
1809   if (vecIFDoc.size() == 0) {
1810     wxMessageBox ("No compatible images for Row Comparison", "Error");
1811     return;
1812   }
1813
1814   DialogGetComparisonImage dialogGetCompare (getFrameForChild(), "Get Comparison Image", vecIFDoc, false);
1815
1816   if (dialogGetCompare.ShowModal() == wxID_OK) {
1817     ImageFileDocument* pCompareDoc = dialogGetCompare.getImageFileDocument();
1818     const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1819     const ImageFile& rCompareIF = pCompareDoc->getImageFile();
1820
1821     ImageFileArrayConst v1 = rIF.getArray();
1822     ImageFileArrayConst v2 = rCompareIF.getArray();
1823     int nx = rIF.nx();
1824     int ny = rIF.ny();
1825
1826     if (v1 != NULL && yCursor < ny) {
1827       double* pX = new double [nx];
1828       double* pY1 = new double [nx];
1829       double* pY2 = new double [nx];
1830       for (int i = 0; i < nx; i++) {
1831         pX[i] = i;
1832         pY1[i] = v1[i][yCursor];
1833         pY2[i] = v2[i][yCursor];
1834       }
1835       PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1836       if (! pPlotDoc) {
1837         sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1838       } else {
1839         PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1840         std::ostringstream os;
1841         os << "Row " << yCursor << " Comparison";
1842         std::string title("title ");
1843         title += os.str();
1844         rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1845         rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Column");
1846         rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Pixel Value");
1847         rPlotFile.addEzsetCommand ("lxfrac 0");
1848         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 1");
1849         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 2");
1850         rPlotFile.addEzsetCommand ("curve 2");
1851         rPlotFile.addEzsetCommand ("color 4");
1852         rPlotFile.addEzsetCommand ("dash 5");
1853         rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1854         rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1855         rPlotFile.setCurveSize (3, nx);
1856         rPlotFile.addColumn (0, pX);
1857         rPlotFile.addColumn (1, pY1);
1858         rPlotFile.addColumn (2, pY2);
1859         unsigned int iL;
1860         for (iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1861           std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1862           s += ": ";
1863           s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1864           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1865         }
1866         for (iL = 0; iL < rCompareIF.nLabels(); iL++) {
1867           std::string s = pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1868           s += ": ";
1869           s += rCompareIF.labelGet(iL).getLabelString();
1870           rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1871         }
1872         os << " Between " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str() << " and "
1873           << pCompareDoc->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1874         *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1875         rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1876       }
1877       delete pX;
1878       delete pY1;
1879       delete pY2;
1880       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1881         pPlotDoc->Modify (true);
1882       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1883       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1884       pPlotDoc->Activate();
1885     }
1886   }
1887 }
1888
1889 static int NUMBER_HISTOGRAM_BINS = 256;
1890
1891 void
1892 ImageFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
1893 {
1894   const ImageFile& rIF = GetDocument()->getImageFile();
1895   ImageFileArrayConst v = rIF.getArray();
1896   int nx = rIF.nx();
1897   int ny = rIF.ny();
1898
1899   if (v != NULL && nx > 0 && ny > 0) {
1900     PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
1901     if (! pPlotDoc) {
1902       sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
1903       return;
1904     }
1905
1906     double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1907     double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
1908     double dMin, dMax;
1909     rIF.getMinMax (dMin, dMax);
1910     double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
1911
1912     for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
1913       pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
1914       pY[i] = 0;
1915     }
1916     for (int ix = 0; ix < nx; ix++)
1917       for (int iy = 0; iy < ny; iy++) {
1918         int iBin = nearest<int> ((v[ix][iy] - dMin) / dBinWidth);
1919         if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
1920           pY[iBin] += 1;
1921       }
1922
1923       PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
1924       std::ostringstream os;
1925       os << "Histogram";
1926       std::string title("title ");
1927       title += os.str();
1928       rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
1929       rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Pixel Value");
1930       rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
1931       rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
1932       rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
1933       rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
1934       rPlotFile.addColumn (0, pX);
1935       rPlotFile.addColumn (1, pY);
1936       for (unsigned int iL = 0; iL < rIF.nLabels(); iL++) {
1937         std::string s = GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1938         s += ": ";
1939         s += rIF.labelGet(iL).getLabelString();
1940         rPlotFile.addDescription (s.c_str());
1941       }
1942       os << "  plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
1943       *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
1944       rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
1945       delete pX;
1946       delete pY;
1947       if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
1948         pPlotDoc->Modify (true);
1949       pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
1950       pPlotDoc->UpdateAllViews ();
1951       pPlotDoc->Activate();
1952   }
1953 }
1954
1955
1956 // PhantomCanvas
1957
1958 PhantomCanvas::PhantomCanvas (PhantomFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
1959   : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style), m_pView(v)
1960 {
1961 }
1962
1963 PhantomCanvas::~PhantomCanvas ()
1964 {
1965   m_pView = NULL;
1966 }
1967
1968 void
1969 PhantomCanvas::OnDraw (wxDC& dc)
1970 {
1971   if (m_pView)
1972     m_pView->OnDraw(& dc);
1973 }
1974
1975 wxSize
1976 PhantomCanvas::GetBestSize() const
1977 {
1978   if (! m_pView)
1979     return wxSize(0,0);
1980
1981   int xSize, ySize;
1982   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
1983   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
1984 #ifdef CTSIM_MDI
1985   ySize = xSize = (xSize / 4);
1986 #else
1987   xSize = ySize = static_cast<int>(ySize * .7);
1988 #endif
1989
1990   return wxSize (xSize, ySize);
1991 }
1992
1993
1994
1995 // PhantomFileView
1996
1997 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PhantomFileView, wxView)
1998
1999 BEGIN_EVENT_TABLE(PhantomFileView, wxView)
2000 EVT_MENU(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, PhantomFileView::OnProperties)
2001 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, PhantomFileView::OnRasterize)
2002 EVT_MENU(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, PhantomFileView::OnProjections)
2003 END_EVENT_TABLE()
2004
2005 PhantomFileView::PhantomFileView()
2006 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pFileMenu(0)
2007 {
2008 #if defined(DEBUG) || defined(_DEBUG)
2009   m_iDefaultNDet = 165;
2010   m_iDefaultNView = 180;
2011   m_iDefaultNSample = 1;
2012 #else
2013   m_iDefaultNDet = 367;
2014   m_iDefaultNView = 320;
2015   m_iDefaultNSample = 2;
2016 #endif
2017   m_iDefaultOffsetView = 0;
2018   m_dDefaultRotation = 1;
2019   m_dDefaultFocalLength = 2;
2020   m_dDefaultCenterDetectorLength = 2;
2021   m_dDefaultViewRatio = 1;
2022   m_dDefaultScanRatio = 1;
2023   m_iDefaultGeometry = Scanner::GEOMETRY_PARALLEL;
2024   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2025
2026 #ifdef DEBUG
2027   m_iDefaultRasterNX = 115;
2028   m_iDefaultRasterNY = 115;
2029   m_iDefaultRasterNSamples = 1;
2030 #else
2031   m_iDefaultRasterNX = 256;
2032   m_iDefaultRasterNY = 256;
2033   m_iDefaultRasterNSamples = 2;
2034 #endif
2035   m_dDefaultRasterViewRatio = 1;
2036 }
2037
2038 PhantomFileView::~PhantomFileView()
2039 {
2040   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2041   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);
2042 }
2043
2044 void
2045 PhantomFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2046 {
2047   const int idPhantom = GetDocument()->getPhantomID();
2048   const wxString& namePhantom = GetDocument()->getPhantomName();
2049   std::ostringstream os;
2050   os << "Phantom " << namePhantom.c_str() << " (" << idPhantom << ")" << "\n";
2051   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2052   rPhantom.printDefinitions (os);
2053 #if DEBUG
2054   rPhantom.print (os);
2055 #endif
2056   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
2057   wxMessageBox (os.str().c_str(), "Phantom Properties");
2058   GetDocument()->Activate();
2059 }
2060
2061
2062 void
2063 PhantomFileView::OnProjections (wxCommandEvent& event)
2064 {
2065   DialogGetProjectionParameters dialogProjection (getFrameForChild(),
2066     m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultOffsetView, m_iDefaultNSample, m_dDefaultRotation,
2067     m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio,
2068     m_iDefaultGeometry, m_iDefaultTrace);
2069   int retVal = dialogProjection.ShowModal();
2070   if (retVal != wxID_OK)
2071     return;
2072
2073   m_iDefaultNDet = dialogProjection.getNDet();
2074   m_iDefaultNView = dialogProjection.getNView();
2075   m_iDefaultOffsetView = dialogProjection.getOffsetView();
2076   m_iDefaultNSample = dialogProjection.getNSamples();
2077   m_iDefaultTrace = dialogProjection.getTrace();
2078   m_dDefaultRotation = dialogProjection.getRotAngle();
2079   m_dDefaultFocalLength = dialogProjection.getFocalLengthRatio();
2080   m_dDefaultCenterDetectorLength = dialogProjection.getCenterDetectorLengthRatio();
2081   m_dDefaultViewRatio = dialogProjection.getViewRatio();
2082   m_dDefaultScanRatio = dialogProjection.getScanRatio();
2083   wxString sGeometry = dialogProjection.getGeometry();
2084   m_iDefaultGeometry = Scanner::convertGeometryNameToID (sGeometry.c_str());
2085   double dRotationRadians = m_dDefaultRotation;
2086   m_dDefaultRotation /= TWOPI;  // convert back to fraction of a circle
2087
2088   if (m_iDefaultNDet <= 0 || m_iDefaultNView <= 0 || sGeometry == "")
2089     return;
2090
2091   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2092   Scanner theScanner (rPhantom, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNDet, m_iDefaultNView, m_iDefaultOffsetView, m_iDefaultNSample,
2093     dRotationRadians, m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio);
2094   if (theScanner.fail()) {
2095     wxString msg = "Failed making scanner\n";
2096     msg += theScanner.failMessage().c_str();
2097     *theApp->getLog() << msg << "\n";
2098     wxMessageBox (msg, "Error");
2099     return;
2100   }
2101
2102   std::ostringstream os;
2103   os << "Projections for " << rPhantom.name()
2104         << ": nDet=" << m_iDefaultNDet
2105     << ", nView=" << m_iDefaultNView
2106         << ", gantry offset=" << m_iDefaultOffsetView
2107         << ", nSamples=" << m_iDefaultNSample
2108     << ", RotAngle=" << m_dDefaultRotation
2109         << ", FocalLengthRatio=" << m_dDefaultFocalLength
2110     << ", CenterDetectorLengthRatio=" << m_dDefaultCenterDetectorLength
2111     << ", ViewRatio=" << m_dDefaultViewRatio
2112         << ", ScanRatio=" << m_dDefaultScanRatio
2113     << ", Geometry=" << sGeometry.c_str()
2114         << ", FanBeamAngle=" << convertRadiansToDegrees (theScanner.fanBeamAngle());
2115
2116   Timer timer;
2117   Projections* pProj = NULL;
2118   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2119     pProj = new Projections;
2120     pProj->initFromScanner (theScanner);
2121
2122     ProjectionsDialog dialogProjections (theScanner, *pProj, rPhantom, m_iDefaultTrace, dynamic_cast<wxWindow*>(getFrameForChild()));
2123     for (int iView = 0; iView < pProj->nView(); iView++) {
2124       ::wxYield();
2125       if (dialogProjections.isCancelled() || ! dialogProjections.projectView (iView)) {
2126         delete pProj;
2127         return;
2128       }
2129       ::wxYield();
2130       while (dialogProjections.isPaused()) {
2131         ::wxYield();
2132         ::wxUsleep(50);
2133       }
2134     }
2135   } else {
2136 #if HAVE_WXTHREADS
2137     if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2138       ProjectorSupervisorThread* pProjector = new ProjectorSupervisorThread (this, m_iDefaultNDet,
2139         m_iDefaultNView, m_iDefaultOffsetView, sGeometry.c_str(), m_iDefaultNSample, dRotationRadians,
2140         m_dDefaultFocalLength, m_dDefaultCenterDetectorLength, m_dDefaultViewRatio, m_dDefaultScanRatio, os.str().c_str());
2141       if (pProjector->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2142         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating projector thread");
2143         delete pProjector;
2144         return;
2145       }
2146       pProjector->SetPriority(60);
2147       pProjector->Run();
2148       return;
2149     } else
2150 #endif // HAVE_WXTHREADS
2151     {
2152       pProj = new Projections;
2153       pProj->initFromScanner (theScanner);
2154       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Projection"), wxString("Projection Progress"), pProj->nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2155       for (int i = 0; i < pProj->nView(); i++) {
2156         //theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, true, m_iDefaultTrace);
2157         theScanner.collectProjections (*pProj, rPhantom, i, 1, theScanner.offsetView(), true, m_iDefaultTrace);
2158         if ((i + 1) % ITER_PER_UPDATE == 0)
2159           if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
2160             delete pProj;
2161             return;
2162           }
2163       }
2164     }
2165   }
2166
2167   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2168   pProj->setRemark (os.str());
2169   pProj->setCalcTime (timer.timerEnd());
2170
2171   ProjectionFileDocument* pProjectionDoc = theApp->newProjectionDoc();
2172   if (! pProjectionDoc) {
2173     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create projection document");
2174     return;
2175   }
2176   pProjectionDoc->setProjections (pProj);
2177   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2178     pProjectionDoc-> Modify(true);
2179   pProjectionDoc->UpdateAllViews (this);
2180   pProjectionDoc->getView()->setInitialClientSize();
2181   pProjectionDoc->Activate();
2182 }
2183
2184
2185 void
2186 PhantomFileView::OnRasterize (wxCommandEvent& event)
2187 {
2188   DialogGetRasterParameters dialogRaster (getFrameForChild(), m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
2189     m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio);
2190   int retVal = dialogRaster.ShowModal();
2191   if (retVal != wxID_OK)
2192     return;
2193
2194   m_iDefaultRasterNX = dialogRaster.getXSize();
2195   m_iDefaultRasterNY  = dialogRaster.getYSize();
2196   m_iDefaultRasterNSamples = dialogRaster.getNSamples();
2197   m_dDefaultRasterViewRatio = dialogRaster.getViewRatio();
2198   if (m_iDefaultRasterNSamples < 1)
2199     m_iDefaultRasterNSamples = 1;
2200   if (m_dDefaultRasterViewRatio < 0)
2201     m_dDefaultRasterViewRatio = 0;
2202   if (m_iDefaultRasterNX <= 0 || m_iDefaultRasterNY <= 0)
2203     return;
2204
2205   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2206   std::ostringstream os;
2207   os << "Rasterize Phantom " << rPhantom.name() << ": XSize=" << m_iDefaultRasterNX << ", YSize="
2208     << m_iDefaultRasterNY << ", ViewRatio=" << m_dDefaultRasterViewRatio << ", nSamples="
2209     << m_iDefaultRasterNSamples;;
2210
2211 #if HAVE_WXTHREADS
2212   if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2213     RasterizerSupervisorThread* pThread = new RasterizerSupervisorThread (this, m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY,
2214       m_iDefaultRasterNSamples, m_dDefaultRasterViewRatio, os.str().c_str());
2215     if (pThread->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2216       *theApp->getLog() << "Error creating rasterizer thread\n";
2217       return;
2218     }
2219     pThread->SetPriority (60);
2220     pThread->Run();
2221   } else
2222 #endif
2223   {
2224     ImageFile* pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultRasterNX, m_iDefaultRasterNY);
2225
2226     wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Rasterize"),
2227                                   wxString("Rasterization Progress"),
2228                                   pImageFile->nx() + 1,
2229                                   getFrameForChild(),
2230                                   wxPD_CAN_ABORT );
2231     Timer timer;
2232     for (unsigned int i = 0; i < pImageFile->nx(); i++) {
2233       rPhantom.convertToImagefile (*pImageFile, m_dDefaultRasterViewRatio,
2234                                    m_iDefaultRasterNSamples, Trace::TRACE_NONE,
2235                                    i, 1, true);
2236       if ((i + 1) % ITER_PER_UPDATE == 0)
2237         if (! dlgProgress.Update (i+1)) {
2238           delete pImageFile;
2239           return;
2240         }
2241     }
2242
2243     ImageFileDocument* pRasterDoc = theApp->newImageDoc();
2244     if (! pRasterDoc) {
2245       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2246       return;
2247     }
2248     pRasterDoc->setImageFile (pImageFile);
2249     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2250       pRasterDoc->Modify (true);
2251     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2252     pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timer.timerEnd());
2253
2254     pRasterDoc->UpdateAllViews(this);
2255     pRasterDoc->getView()->setInitialClientSize();
2256     pRasterDoc->Activate();
2257   }
2258 }
2259
2260
2261 PhantomCanvas*
2262 PhantomFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2263 {
2264   PhantomCanvas* pCanvas = new PhantomCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0),
2265                                               wxSize(0,0), 0);
2266   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2267   pCanvas->Clear();
2268
2269   return pCanvas;
2270 }
2271
2272 #if CTSIM_MDI
2273 wxDocMDIChildFrame*
2274 #else
2275 wxDocChildFrame*
2276 #endif
2277 PhantomFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2278 {
2279 #if CTSIM_MDI
2280   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2281 #else
2282   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Phantom Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2283 #endif
2284   theApp->setIconForFrame (subframe);
2285
2286   m_pFileMenu = new wxMenu;
2287
2288   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
2289   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
2290   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
2291   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
2292   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close");
2293
2294   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2295   m_pFileMenu->Append(PHMMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
2296
2297   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2298   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
2299   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
2300   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
2301   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2302   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
2303 #ifdef CTSIM_MDI
2304   m_pFileMenu->AppendSeparator();
2305   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
2306   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
2307 #endif
2308   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
2309   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
2310
2311   wxMenu *process_menu = new wxMenu;
2312   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE, "&Rasterize...\tCtrl-R");
2313   process_menu->Append(PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS, "&Projections...\tCtrl-J");
2314
2315   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
2316   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
2317   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
2318   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
2319   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
2320
2321   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
2322
2323   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
2324   menu_bar->Append(process_menu, "&Process");
2325   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
2326
2327   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
2328   subframe->Centre(wxBOTH);
2329
2330   wxAcceleratorEntry accelEntries[3];
2331   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('J'), PHMMENU_PROCESS_PROJECTIONS);
2332   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PHMMENU_PROCESS_RASTERIZE);
2333   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PHMMENU_FILE_PROPERTIES);
2334   wxAcceleratorTable accelTable (3, accelEntries);
2335   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
2336
2337   return subframe;
2338 }
2339
2340
2341 bool
2342 PhantomFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
2343 {
2344   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
2345   SetFrame(m_pFrame);
2346   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
2347   m_pFrame->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2348   m_pCanvas->SetClientSize (m_pCanvas->GetBestSize());
2349   m_pFrame->SetTitle ("PhantomFileView");
2350
2351   m_pFrame->Show(true);
2352   Activate(true);
2353
2354   return true;
2355 }
2356
2357 void
2358 PhantomFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
2359 {
2360   if (m_pCanvas)
2361     m_pCanvas->Refresh();
2362 }
2363
2364 bool
2365 PhantomFileView::OnClose (bool deleteWindow)
2366 {
2367   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
2368     return false;
2369
2370   Activate(false);
2371   if (m_pCanvas) {
2372     m_pCanvas->setView(NULL);
2373     m_pCanvas = NULL;
2374   }
2375   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
2376   if (m_pFrame)
2377     m_pFrame->SetTitle(s);
2378
2379   SetFrame(NULL);
2380
2381   if (deleteWindow) {
2382     delete m_pFrame;
2383     m_pFrame = NULL;
2384     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
2385       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
2386   }
2387
2388   return true;
2389 }
2390
2391 void
2392 PhantomFileView::OnDraw (wxDC* dc)
2393 {
2394   int xsize, ysize;
2395   m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
2396   SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
2397   SGP sgp (driver);
2398   const Phantom& rPhantom = GetDocument()->getPhantom();
2399   sgp.setColor (C_RED);
2400   rPhantom.show (sgp);
2401 }
2402
2403 // ProjectionCanvas
2404
2405 ProjectionFileCanvas::ProjectionFileCanvas (ProjectionFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
2406 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
2407 {
2408   m_pView = v;
2409 }
2410
2411 ProjectionFileCanvas::~ProjectionFileCanvas ()
2412 {
2413   m_pView = NULL;
2414 }
2415
2416 void
2417 ProjectionFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
2418 {
2419   if (m_pView)
2420     m_pView->OnDraw(& dc);
2421 }
2422
2423 wxSize
2424 ProjectionFileCanvas::GetBestSize () const
2425 {
2426   const int iMinX = 50;
2427   const int iMinY = 20;
2428   wxSize bestSize (iMinX,iMinY);
2429
2430   if (m_pView) {
2431     Projections& rProj = m_pView->GetDocument()->getProjections();
2432     bestSize.Set (rProj.nDet(), rProj.nView());
2433   }
2434
2435   if (bestSize.y < iMinY)
2436     bestSize.y = iMinY;
2437   if (bestSize.x < iMinX)
2438     bestSize.x = iMinX;
2439
2440   return bestSize;
2441 }
2442
2443
2444 // ProjectionFileView
2445
2446 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(ProjectionFileView, wxView)
2447
2448 BEGIN_EVENT_TABLE(ProjectionFileView, wxView)
2449 EVT_MENU(PJMENU_FILE_PROPERTIES, ProjectionFileView::OnProperties)
2450 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, ProjectionFileView::OnReconstructFBP)
2451 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN, ProjectionFileView::OnReconstructFBPRebin)
2452 EVT_MENU(PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, ProjectionFileView::OnReconstructFourier)
2453 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_RECTANGULAR, ProjectionFileView::OnConvertRectangular)
2454 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertPolar)
2455 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar)
2456 EVT_MENU(PJMENU_CONVERT_PARALLEL, ProjectionFileView::OnConvertParallel)
2457 EVT_MENU(PJMENU_PLOT_TTHETA_SAMPLING, ProjectionFileView::OnPlotTThetaSampling)
2458 EVT_MENU(PJMENU_PLOT_HISTOGRAM, ProjectionFileView::OnPlotHistogram)
2459   // EVT_MENU(PJMENU_ARTIFACT_REDUCTION, ProjectionFileView::OnArtifactReduction)
2460 END_EVENT_TABLE()
2461
2462
2463 ProjectionFileView::ProjectionFileView()
2464 : wxView(), m_pFrame(0), m_pCanvas(0), m_pFileMenu(0)
2465 {
2466 #ifdef DEBUG
2467   m_iDefaultNX = 115;
2468   m_iDefaultNY = 115;
2469 #else
2470   m_iDefaultNX = 256;
2471   m_iDefaultNY = 256;
2472 #endif
2473
2474   m_iDefaultFilter = SignalFilter::FILTER_ABS_BANDLIMIT;
2475   m_dDefaultFilterParam = 1.;
2476 #if HAVE_FFTW
2477   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_RFFTW;
2478   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_INVERSE_FOURIER;
2479 #else
2480   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::FILTER_METHOD_CONVOLUTION;
2481   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::FILTER_GENERATION_DIRECT;
2482 #endif
2483   m_iDefaultZeropad = 1;
2484   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::BPROJ_IDIFF;
2485   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::INTERP_LINEAR;
2486   m_iDefaultInterpParam = 1;
2487   m_iDefaultTrace = Trace::TRACE_NONE;
2488
2489   m_iDefaultPolarNX = 256;
2490   m_iDefaultPolarNY = 256;
2491   m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::POLAR_INTERP_BILINEAR;
2492   m_iDefaultPolarZeropad = 1;
2493 }
2494
2495 ProjectionFileView::~ProjectionFileView()
2496 {
2497   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
2498   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
2499 }
2500
2501 void
2502 ProjectionFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
2503 {
2504   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2505   std::ostringstream os;
2506   rProj.printScanInfo(os);
2507   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<\n";
2508   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Projection File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
2509   dialogMsg.ShowModal();
2510   GetDocument()->Activate();
2511 }
2512
2513
2514 void
2515 ProjectionFileView::OnConvertRectangular (wxCommandEvent& event)
2516 {
2517   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2518
2519   int nDet = rProj.nDet();
2520   int nView = rProj.nView();
2521   ImageFile* pIF = new ImageFile (nDet, nView);
2522   ImageFileArray v = pIF->getArray();
2523   for (int iv = 0; iv < nView; iv++) {
2524     DetectorValue* detval = rProj.getDetectorArray(iv).detValues();
2525
2526     for (int id = 0; id < nDet; id++)
2527       v[id][iv] = detval[id];
2528   }
2529
2530   ImageFileDocument* pRectDoc = theApp->newImageDoc ();
2531   if (! pRectDoc) {
2532     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2533     return;
2534   }
2535   pRectDoc->setImageFile (pIF);
2536   pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2537   std::ostringstream os;
2538   os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to rectangular image";
2539   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2540   pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2541   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2542     pRectDoc->Modify (true);
2543   pRectDoc->UpdateAllViews();
2544   pRectDoc->getView()->setInitialClientSize();
2545   pRectDoc->Activate();
2546 }
2547
2548 void
2549 ProjectionFileView::OnConvertPolar (wxCommandEvent& event)
2550 {
2551   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2552   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2553     m_iDefaultPolarInterpolation, -1, IDH_DLG_POLAR);
2554   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2555     wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Convert Polar"), wxString("Conversion Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2556     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2557     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2558     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2559     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2560     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2561     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2562
2563     if (! rProj.convertPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation)) {
2564       delete pIF;
2565       *theApp->getLog() << "Error converting to Polar\n";
2566       return;
2567     }
2568
2569     pPolarDoc = theApp->newImageDoc ();
2570     if (! pPolarDoc) {
2571       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2572       return;
2573     }
2574     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2575     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2576     std::ostringstream os;
2577     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to polar image: xSize="
2578       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2579       << strInterpolation.c_str();
2580     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2581     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2582     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2583       pPolarDoc->Modify (true);
2584     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2585     pPolarDoc->getView()->setInitialClientSize();
2586     pPolarDoc->Activate();
2587   }
2588 }
2589
2590 void
2591 ProjectionFileView::OnConvertFFTPolar (wxCommandEvent& event)
2592 {
2593   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2594   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Convert to FFT Polar", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2595     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad, IDH_DLG_FFT_POLAR);
2596   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2597     wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Convert FFT Polar"), wxString("Conversion Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2598     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2599     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2600     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2601     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2602     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2603
2604     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2605     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2606       delete pIF;
2607       *theApp->getLog() << "Error converting to polar\n";
2608       return;
2609     }
2610     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2611     if (! pPolarDoc) {
2612       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2613       return;
2614     }
2615     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2616     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2617     std::ostringstream os;
2618     os << "Convert projection file " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << " to FFT polar image: xSize="
2619       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2620       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2621     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2622     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2623     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2624       pPolarDoc->Modify (true);
2625     pPolarDoc->UpdateAllViews (this);
2626     pPolarDoc->getView()->setInitialClientSize();
2627     pPolarDoc->Activate();
2628   }
2629 }
2630
2631 void
2632 ProjectionFileView::OnPlotTThetaSampling (wxCommandEvent& event)
2633 {
2634   DialogGetThetaRange dlgTheta (this->getFrame(), ParallelRaysums::THETA_RANGE_UNCONSTRAINED);
2635   if (dlgTheta.ShowModal() != wxID_OK)
2636     return;
2637
2638   int iThetaRange = dlgTheta.getThetaRange();
2639
2640   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2641   ParallelRaysums parallel (&rProj, iThetaRange);
2642   PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
2643   PlotFile& rPlot = pPlotDoc->getPlotFile();
2644   ParallelRaysums::CoordinateContainer& coordContainer = parallel.getCoordinates();
2645   double* pdT = new double [parallel.getNumCoordinates()];
2646   double* pdTheta = new double [parallel.getNumCoordinates()];
2647
2648   for (int i = 0; i < parallel.getNumCoordinates(); i++) {
2649     pdT[i] = coordContainer[i]->m_dT;
2650     pdTheta[i] = coordContainer[i]->m_dTheta;
2651   }
2652   rPlot.setCurveSize (2, parallel.getNumCoordinates(), true);
2653   rPlot.addEzsetCommand ("title T-Theta Sampling");
2654   rPlot.addEzsetCommand ("xlabel T");
2655   rPlot.addEzsetCommand ("ylabel Theta");
2656   rPlot.addEzsetCommand ("curve 1");
2657   if (rProj.nDet() < 50 && rProj.nView() < 50)
2658     rPlot.addEzsetCommand ("symbol 1"); // x symbol
2659   else
2660     rPlot.addEzsetCommand ("symbol 6"); // point symbol
2661   rPlot.addEzsetCommand ("noline");
2662   rPlot.addColumn (0, pdT);
2663   rPlot.addColumn (1, pdTheta);
2664   delete pdT;
2665   delete pdTheta;
2666   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2667     pPlotDoc->Modify (true);
2668   pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2669   pPlotDoc->UpdateAllViews ();
2670   pPlotDoc->Activate();
2671 }
2672
2673
2674 void
2675 ProjectionFileView::OnPlotHistogram (wxCommandEvent& event)
2676 {
2677   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2678   int nDet = rProj.nDet();
2679   int nView = rProj.nView();
2680
2681   if (nDet < 1 || nView < 1)
2682     return;
2683
2684   PlotFileDocument* pPlotDoc = theApp->newPlotDoc();
2685   if (! pPlotDoc) {
2686     sys_error (ERR_SEVERE, "Internal error: unable to create Plot file");
2687     return;
2688   }
2689
2690   DetectorValue* pdDetval = rProj.getDetectorArray(0).detValues();
2691   double dMin = pdDetval[0], dMax = pdDetval[0];
2692
2693   for (int iv = 0; iv < nView; iv++) {
2694     pdDetval = rProj.getDetectorArray(iv).detValues();
2695     for (int id = 0; id < nDet; id++) {
2696       double dV = pdDetval[id];
2697       if (dV < dMin)
2698         dMin = dV;
2699       else if (dV > dMax)
2700         dMax = dV;
2701     }
2702   }
2703
2704   double* pX = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
2705   double* pY = new double [NUMBER_HISTOGRAM_BINS];
2706   double dBinWidth = (dMax - dMin) / NUMBER_HISTOGRAM_BINS;
2707
2708   for (int i = 0; i < NUMBER_HISTOGRAM_BINS; i++) {
2709     pX[i] = dMin + (i + 0.5) * dBinWidth;
2710     pY[i] = 0;
2711   }
2712   for (int j = 0; j < nView; j++) {
2713     pdDetval = rProj.getDetectorArray(j).detValues();
2714     for (int id = 0; id < nDet; id++) {
2715       int iBin = nearest<int> ((pdDetval[id] - dMin) / dBinWidth);
2716       if (iBin >= 0 && iBin < NUMBER_HISTOGRAM_BINS)
2717         pY[iBin] += 1;
2718     }
2719   }
2720   PlotFile& rPlotFile = pPlotDoc->getPlotFile();
2721   std::ostringstream os;
2722   os << "Histogram";
2723   std::string title("title ");
2724   title += os.str();
2725   rPlotFile.addEzsetCommand (title.c_str());
2726   rPlotFile.addEzsetCommand ("xlabel Detector Value");
2727   rPlotFile.addEzsetCommand ("ylabel Count");
2728   rPlotFile.addEzsetCommand ("box");
2729   rPlotFile.addEzsetCommand ("grid");
2730   rPlotFile.setCurveSize (2, NUMBER_HISTOGRAM_BINS);
2731   rPlotFile.addColumn (0, pX);
2732   rPlotFile.addColumn (1, pY);
2733   rPlotFile.addDescription (rProj.remark());
2734   os << " plot of " << GetDocument()->GetFirstView()->GetFrame()->GetTitle().c_str();
2735   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2736   rPlotFile.addDescription (os.str().c_str());
2737   delete pX;
2738   delete pY;
2739   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2740     pPlotDoc->Modify (true);
2741   pPlotDoc->getView()->getFrame()->Show(true);
2742   pPlotDoc->UpdateAllViews ();
2743   pPlotDoc->Activate();
2744 }
2745
2746
2747 void
2748 ProjectionFileView::OnConvertParallel (wxCommandEvent& event)
2749 {
2750   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2751   if (rProj.geometry() == Scanner::GEOMETRY_PARALLEL) {
2752     wxMessageBox ("Projections are already parallel", "Error");
2753     return;
2754   }
2755   wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Convert to Parallel"), wxString("Conversion Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2756   Projections* pProjNew = rProj.interpolateToParallel();
2757   ProjectionFileDocument* pProjDocNew = theApp->newProjectionDoc();
2758   pProjDocNew->setProjections (pProjNew);
2759
2760   if (ProjectionFileView* projView = pProjDocNew->getView()) {
2761     projView->OnUpdate (projView, NULL);
2762     if (projView->getCanvas())
2763       projView->getCanvas()->SetClientSize (pProjNew->nDet(), pProjNew->nView());
2764     if (wxFrame* pFrame = projView->getFrame()) {
2765       pFrame->Show(true);
2766       pFrame->SetFocus();
2767       pFrame->Raise();
2768     }
2769     GetDocumentManager()->ActivateView (projView, true, false);
2770   }
2771   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2772     pProjDocNew-> Modify(true);
2773   pProjDocNew->UpdateAllViews (this);
2774   pProjDocNew->getView()->setInitialClientSize();
2775   pProjDocNew->Activate();
2776 }
2777
2778 void
2779 ProjectionFileView::OnReconstructFourier (wxCommandEvent& event)
2780 {
2781   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2782   DialogGetConvertPolarParameters dialogPolar (getFrameForChild(), "Fourier Reconstruction", m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY,
2783     m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad, IDH_DLG_RECON_FOURIER);
2784   if (dialogPolar.ShowModal() == wxID_OK) {
2785     wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction Fourier"), wxString("Reconstruction Progress"), 1, getFrameForChild(), wxPD_APP_MODAL);
2786     wxString strInterpolation (dialogPolar.getInterpolationName());
2787     m_iDefaultPolarNX = dialogPolar.getXSize();
2788     m_iDefaultPolarNY = dialogPolar.getYSize();
2789     m_iDefaultPolarZeropad = dialogPolar.getZeropad();
2790     ImageFile* pIF = new ImageFile (m_iDefaultPolarNX, m_iDefaultPolarNY);
2791
2792     m_iDefaultPolarInterpolation = Projections::convertInterpNameToID (strInterpolation.c_str());
2793     if (! rProj.convertFFTPolar (*pIF, m_iDefaultPolarInterpolation, m_iDefaultPolarZeropad)) {
2794       delete pIF;
2795       *theApp->getLog() << "Error converting to polar\n";
2796       return;
2797     }
2798 #ifdef HAVE_FFT
2799     pIF->ifft(*pIF);
2800 #endif
2801     pIF->magnitude(*pIF);
2802     Fourier::shuffleFourierToNaturalOrder (*pIF);
2803
2804     ImageFileDocument* pPolarDoc = theApp->newImageDoc();
2805     if (! pPolarDoc) {
2806       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2807       return;
2808     }
2809     pPolarDoc->setImageFile (pIF);
2810     pIF->labelAdd (rProj.getLabel().getLabelString().c_str(), rProj.calcTime());
2811     std::ostringstream os;
2812     os << "Reconstruct Fourier " << GetFrame()->GetTitle().c_str() << ": xSize="
2813       << m_iDefaultPolarNX << ", ySize=" << m_iDefaultPolarNY << ", interpolation="
2814       << strInterpolation.c_str() << ", zeropad=" << m_iDefaultPolarZeropad;
2815     *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2816     pIF->labelAdd (os.str().c_str());
2817     if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2818       pPolarDoc->Modify (true);
2819     pPolarDoc->UpdateAllViews ();
2820     pPolarDoc->getView()->setInitialClientSize();
2821     pPolarDoc->Activate();
2822   }
2823 }
2824
2825 void
2826 ProjectionFileView::OnReconstructFBPRebin (wxCommandEvent& event)
2827 {
2828   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2829   doReconstructFBP (rProj, true);
2830 }
2831
2832 void
2833 ProjectionFileView::OnReconstructFBP (wxCommandEvent& event)
2834 {
2835   Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
2836   doReconstructFBP (rProj, false);
2837 }
2838
2839 void
2840 ProjectionFileView::doReconstructFBP (const Projections& rProj, bool bRebinToParallel)
2841 {
2842   ReconstructionROI defaultROI;
2843   defaultROI.m_dXMin = -rProj.phmLen() / 2;
2844   defaultROI.m_dXMax = defaultROI.m_dXMin + rProj.phmLen();
2845   defaultROI.m_dYMin = -rProj.phmLen() / 2;
2846   defaultROI.m_dYMax = defaultROI.m_dYMin + rProj.phmLen();
2847
2848   DialogGetReconstructionParameters dialogReconstruction (getFrameForChild(), m_iDefaultNX, m_iDefaultNY,
2849     m_iDefaultFilter, m_dDefaultFilterParam, m_iDefaultFilterMethod, m_iDefaultFilterGeneration,
2850     m_iDefaultZeropad, m_iDefaultInterpolation, m_iDefaultInterpParam, m_iDefaultBackprojector,
2851     m_iDefaultTrace,  &defaultROI);
2852
2853   int retVal = dialogReconstruction.ShowModal();
2854   if (retVal != wxID_OK)
2855     return;
2856
2857   m_iDefaultNX = dialogReconstruction.getXSize();
2858   m_iDefaultNY = dialogReconstruction.getYSize();
2859   wxString optFilterName = dialogReconstruction.getFilterName();
2860   m_iDefaultFilter = SignalFilter::convertFilterNameToID (optFilterName.c_str());
2861   m_dDefaultFilterParam = dialogReconstruction.getFilterParam();
2862   wxString optFilterMethodName = dialogReconstruction.getFilterMethodName();
2863   m_iDefaultFilterMethod = ProcessSignal::convertFilterMethodNameToID(optFilterMethodName.c_str());
2864   m_iDefaultZeropad = dialogReconstruction.getZeropad();
2865   wxString optFilterGenerationName = dialogReconstruction.getFilterGenerationName();
2866   m_iDefaultFilterGeneration = ProcessSignal::convertFilterGenerationNameToID (optFilterGenerationName.c_str());
2867   wxString optInterpName = dialogReconstruction.getInterpName();
2868   m_iDefaultInterpolation = Backprojector::convertInterpNameToID (optInterpName.c_str());
2869   m_iDefaultInterpParam = dialogReconstruction.getInterpParam();
2870   wxString optBackprojectName = dialogReconstruction.getBackprojectName();
2871   m_iDefaultBackprojector = Backprojector::convertBackprojectNameToID (optBackprojectName.c_str());
2872   m_iDefaultTrace = dialogReconstruction.getTrace();
2873   dialogReconstruction.getROI (&defaultROI);
2874
2875   if (m_iDefaultNX <= 0 && m_iDefaultNY <= 0)
2876     return;
2877
2878   std::ostringstream os;
2879   os << "Reconstruct " << rProj.getFilename() << ": xSize=" << m_iDefaultNX << ", ySize=" << m_iDefaultNY << ", Filter=" << optFilterName.c_str() << ", FilterParam=" << m_dDefaultFilterParam << ", FilterMethod=" << optFilterMethodName.c_str() << ", FilterGeneration=" << optFilterGenerationName.c_str() << ", Zeropad=" << m_iDefaultZeropad << ", Interpolation=" << optInterpName.c_str() << ", InterpolationParam=" << m_iDefaultInterpParam << ", Backprojection=" << optBackprojectName.c_str();
2880   if (bRebinToParallel)
2881     os << "; Interpolate to Parallel";
2882
2883   Timer timerRecon;
2884   ImageFile* pImageFile = NULL;
2885   if (m_iDefaultTrace > Trace::TRACE_CONSOLE) {
2886     pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2887     Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2888       m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2889       optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace,
2890       &defaultROI, bRebinToParallel);
2891
2892     ReconstructDialog* pDlgReconstruct = new ReconstructDialog (*pReconstructor, rProj, *pImageFile, m_iDefaultTrace, getFrameForChild());
2893     for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2894       ::wxYield();
2895       if (pDlgReconstruct->isCancelled() || ! pDlgReconstruct->reconstructView (iView, true)) {
2896         delete pDlgReconstruct;
2897         delete pReconstructor;
2898         return;
2899       }
2900       ::wxYield();
2901       ::wxYield();
2902       while (pDlgReconstruct->isPaused()) {
2903         ::wxYield();
2904         ::wxUsleep(50);
2905       }
2906     }
2907     pReconstructor->postProcessing();
2908     delete pDlgReconstruct;
2909     delete pReconstructor;
2910   } else {
2911 #if HAVE_WXTHREADS
2912     if (theApp->getUseBackgroundTasks()) {
2913       ReconstructorSupervisorThread* pReconstructor = new ReconstructorSupervisorThread (this, m_iDefaultNX,
2914         m_iDefaultNY, optFilterName.c_str(), m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(),
2915         m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(), optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam,
2916         optBackprojectName.c_str(), os.str().c_str(), &defaultROI, bRebinToParallel);
2917       if (pReconstructor->Create() != wxTHREAD_NO_ERROR) {
2918         sys_error (ERR_SEVERE, "Error creating reconstructor thread");
2919         delete pReconstructor;
2920         return;
2921       }
2922       pReconstructor->SetPriority (60);
2923       pReconstructor->Run();
2924       return;
2925     } else
2926 #endif
2927     {
2928       pImageFile = new ImageFile (m_iDefaultNX, m_iDefaultNY);
2929       wxProgressDialog dlgProgress (wxString("Reconstruction"), wxString("Reconstruction Progress"), rProj.nView() + 1, getFrameForChild(), wxPD_CAN_ABORT );
2930       Reconstructor* pReconstructor = new Reconstructor (rProj, *pImageFile, optFilterName.c_str(),
2931         m_dDefaultFilterParam, optFilterMethodName.c_str(), m_iDefaultZeropad, optFilterGenerationName.c_str(),
2932         optInterpName.c_str(), m_iDefaultInterpParam, optBackprojectName.c_str(), m_iDefaultTrace,
2933         &defaultROI, bRebinToParallel);
2934
2935       for (int iView = 0; iView < rProj.nView(); iView++) {
2936         pReconstructor->reconstructView (iView, 1);
2937         if ((iView + 1) % ITER_PER_UPDATE == 0)
2938           if (! dlgProgress.Update (iView + 1)) {
2939             delete pReconstructor;
2940             return; // don't make new window, thread will do this
2941           }
2942       }
2943       pReconstructor->postProcessing();
2944       delete pReconstructor;
2945     }
2946   }
2947   ImageFileDocument* pReconDoc = theApp->newImageDoc();
2948   if (! pReconDoc) {
2949     sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to create image file");
2950     return;
2951   }
2952   *theApp->getLog() << os.str().c_str() << "\n";
2953   pImageFile->labelAdd (rProj.getLabel());
2954   pImageFile->labelAdd (os.str().c_str(), timerRecon.timerEnd());
2955
2956   pReconDoc->setImageFile (pImageFile);
2957   if (theApp->getAskDeleteNewDocs())
2958     pReconDoc->Modify (true);
2959   pReconDoc->UpdateAllViews();
2960   pReconDoc->getView()->setInitialClientSize();
2961   pReconDoc->Activate();
2962 }
2963
2964
2965 void
2966 ProjectionFileView::OnArtifactReduction (wxCommandEvent& event)
2967 {
2968 }
2969
2970
2971 ProjectionFileCanvas*
2972 ProjectionFileView::CreateCanvas (wxFrame *parent)
2973 {
2974   ProjectionFileCanvas* pCanvas;
2975   int width, height;
2976   parent->GetClientSize(&width, &height);
2977
2978   pCanvas = new ProjectionFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
2979
2980   pCanvas->SetScrollbars(20, 20, 50, 50);
2981   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
2982   pCanvas->Clear();
2983
2984   return pCanvas;
2985 }
2986
2987 #if CTSIM_MDI
2988 wxDocMDIChildFrame*
2989 #else
2990 wxDocChildFrame*
2991 #endif
2992 ProjectionFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
2993 {
2994 #ifdef CTSIM_MDI
2995   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2996 #else
2997   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Projection Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(0, 0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
2998 #endif
2999   theApp->setIconForFrame (subframe);
3000
3001   m_pFileMenu = new wxMenu;
3002
3003   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
3004   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
3005   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
3006   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
3007   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
3008   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
3009
3010   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3011   m_pFileMenu->Append(PJMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
3012
3013   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3014   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
3015   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
3016   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
3017   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3018   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
3019 #ifdef CTSIM_MDI
3020   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3021   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
3022   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
3023 #endif
3024   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3025   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3026
3027   wxMenu *convert_menu = new wxMenu;
3028   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_RECTANGULAR, "&Rectangular Image");
3029   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_POLAR, "&Polar Image...\tCtrl-L");
3030   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR, "FF&T->Polar Image...\tCtrl-T");
3031   convert_menu->AppendSeparator();
3032   convert_menu->Append (PJMENU_CONVERT_PARALLEL, "&Interpolate to Parallel");
3033
3034   //  wxMenu* filter_menu = new wxMenu;
3035   //  filter_menu->Append (PJMENU_ARTIFACT_REDUCTION, "&Artifact Reduction");
3036
3037   wxMenu* analyze_menu = new wxMenu;
3038   analyze_menu->Append (PJMENU_PLOT_HISTOGRAM, "&Plot Histogram");
3039   analyze_menu->Append (PJMENU_PLOT_TTHETA_SAMPLING, "Plot T-T&heta Sampling...\tCtrl-H");
3040
3041   wxMenu *reconstruct_menu = new wxMenu;
3042   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP, "&Filtered Backprojection...\tCtrl-R", "Reconstruct image using filtered backprojection");
3043   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN, "Filtered &Backprojection (Rebin to Parallel)...\tCtrl-B", "Reconstruct image using filtered backprojection");
3044   // still buggy
3045   //   reconstruct_menu->Append (PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER, "&Fourier...\tCtrl-E", "Reconstruct image using inverse Fourier");
3046
3047   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3048   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
3049   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
3050   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
3051   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
3052
3053   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3054
3055   menu_bar->Append (m_pFileMenu, "&File");
3056   menu_bar->Append (convert_menu, "&Convert");
3057   //  menu_bar->Append (filter_menu, "Fi&lter");
3058   menu_bar->Append (analyze_menu, "&Analyze");
3059   menu_bar->Append (reconstruct_menu, "&Reconstruct");
3060   menu_bar->Append (help_menu, "&Help");
3061
3062   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3063   subframe->Centre(wxBOTH);
3064
3065   wxAcceleratorEntry accelEntries[7];
3066   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('L'), PJMENU_CONVERT_POLAR);
3067   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('T'), PJMENU_CONVERT_FFT_POLAR);
3068   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('R'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP);
3069   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('B'), PJMENU_RECONSTRUCT_FBP_REBIN);
3070   accelEntries[4].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PJMENU_RECONSTRUCT_FOURIER);
3071   accelEntries[5].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PJMENU_FILE_PROPERTIES);
3072   accelEntries[6].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('H'), PJMENU_PLOT_TTHETA_SAMPLING);
3073   wxAcceleratorTable accelTable (7, accelEntries);
3074   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
3075
3076   return subframe;
3077 }
3078
3079
3080 bool
3081 ProjectionFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3082 {
3083   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3084   SetFrame(m_pFrame);
3085
3086   int width, height;
3087   m_pFrame->GetClientSize (&width, &height);
3088   m_pFrame->SetTitle ("ProjectionFileView");
3089   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
3090
3091   m_pFrame->Show(true);
3092   Activate(true);
3093
3094   return true;
3095 }
3096
3097 void
3098 ProjectionFileView::OnDraw (wxDC* dc)
3099 {
3100   if (m_bitmap.Ok())
3101     dc->DrawBitmap (m_bitmap, 0, 0, false);
3102 }
3103
3104
3105 void
3106 ProjectionFileView::setInitialClientSize ()
3107 {
3108   wxSize bestSize = m_pCanvas->GetBestSize();
3109
3110   if (bestSize.x > 800)
3111     bestSize.x = 800;
3112   if (bestSize.y > 800)
3113     bestSize.y = 800;
3114
3115   m_pFrame->SetClientSize (bestSize);
3116   m_pFrame->Show (true);
3117   m_pFrame->SetFocus();
3118 }
3119
3120 void
3121 ProjectionFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3122 {
3123   const Projections& rProj = GetDocument()->getProjections();
3124   const int nDet = rProj.nDet();
3125   const int nView = rProj.nView();
3126   if (nDet != 0 && nView != 0) {
3127     const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(0);
3128     const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
3129     double min = detval[0];
3130     double max = detval[0];
3131     for (int iy = 0; iy < nView; iy++) {
3132       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray(iy);
3133       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
3134       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
3135         if (min > detval[ix])
3136           min = detval[ix];
3137         else if (max < detval[ix])
3138           max = detval[ix];
3139       }
3140     }
3141
3142     unsigned char* imageData = new unsigned char [nDet * nView * 3];
3143     if (! imageData) {
3144       sys_error (ERR_SEVERE, "Unable to allocate memory for image display");
3145       return;
3146     }
3147     double scale = (max - min) / 255;
3148     for (int iy2 = 0; iy2 < nView; iy2++) {
3149       const DetectorArray& detarray = rProj.getDetectorArray (iy2);
3150       const DetectorValue* detval = detarray.detValues();
3151       for (int ix = 0; ix < nDet; ix++) {
3152         int intensity = static_cast<int>(((detval[ix] - min) / scale) + 0.5);
3153         intensity = clamp(intensity, 0, 255);
3154         int baseAddr = (iy2 * nDet + ix) * 3;
3155         imageData[baseAddr] = imageData[baseAddr+1] = imageData[baseAddr+2] = intensity;
3156       }
3157     }
3158     wxImage image (nDet, nView, imageData, true);
3159     m_bitmap = image.ConvertToBitmap();
3160     delete imageData;
3161   }
3162
3163     m_pCanvas->SetScrollbars(20, 20, nDet/20, nView/20);
3164     m_pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
3165
3166     if (m_pCanvas)
3167       m_pCanvas->Refresh();
3168 }
3169
3170 bool
3171 ProjectionFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3172 {
3173   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3174   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3175     return false;
3176
3177   Activate(false);
3178   if (m_pCanvas) {
3179         m_pCanvas->setView(NULL);
3180     m_pCanvas = NULL;
3181   }
3182   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
3183   if (m_pFrame)
3184     m_pFrame->SetTitle(s);
3185
3186   SetFrame(NULL);
3187
3188   if (deleteWindow) {
3189     delete m_pFrame;
3190     m_pFrame = NULL;
3191     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3192       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3193   }
3194
3195   return true;
3196 }
3197
3198
3199
3200 // PlotFileCanvas
3201 PlotFileCanvas::PlotFileCanvas (PlotFileView* v, wxFrame *frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, const long style)
3202 : wxScrolledWindow(frame, -1, pos, size, style)
3203 {
3204   m_pView = v;
3205 }
3206
3207 wxSize
3208 PlotFileCanvas::GetBestSize() const
3209 {
3210   if (! m_pView)
3211     return wxSize(0,0);
3212
3213   int xSize, ySize;
3214   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
3215   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
3216 #ifdef CTSIM_MDI
3217   ySize = xSize = (xSize / 4);
3218 #else
3219   ySize = xSize;
3220 #endif
3221   return wxSize (xSize, ySize);
3222 }
3223
3224 PlotFileCanvas::~PlotFileCanvas ()
3225 {
3226   m_pView = NULL;
3227 }
3228
3229 void
3230 PlotFileCanvas::OnDraw(wxDC& dc)
3231 {
3232   if (m_pView)
3233     m_pView->OnDraw(& dc);
3234 }
3235
3236
3237 // PlotFileView
3238
3239 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(PlotFileView, wxView)
3240
3241 BEGIN_EVENT_TABLE(PlotFileView, wxView)
3242 EVT_MENU(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, PlotFileView::OnProperties)
3243 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, PlotFileView::OnScaleMinMax)
3244 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, PlotFileView::OnScaleAuto)
3245 EVT_MENU(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, PlotFileView::OnScaleFull)
3246 END_EVENT_TABLE()
3247
3248 PlotFileView::PlotFileView()
3249 : wxView(), m_pFrame(NULL), m_pCanvas(NULL), m_pEZPlot(NULL), m_pFileMenu(0), m_bMinSpecified(false), m_bMaxSpecified(false)
3250 {
3251 }
3252
3253 PlotFileView::~PlotFileView()
3254 {
3255   if (m_pEZPlot)
3256     delete m_pEZPlot;
3257
3258   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
3259 }
3260
3261 void
3262 PlotFileView::OnProperties (wxCommandEvent& event)
3263 {
3264   const PlotFile& rPlot = GetDocument()->getPlotFile();
3265   std::ostringstream os;
3266   os << "Columns: " << rPlot.getNumColumns() << ", Records: " << rPlot.getNumRecords() << "\n";
3267   rPlot.printHeadersBrief (os);
3268   *theApp->getLog() << ">>>>\n" << os.str().c_str() << "<<<<<\n";
3269   wxMessageDialog dialogMsg (getFrameForChild(), os.str().c_str(), "Plot File Properties", wxOK | wxICON_INFORMATION);
3270   dialogMsg.ShowModal();
3271   GetDocument()->Activate();
3272 }
3273
3274
3275 void
3276 PlotFileView::OnScaleAuto (wxCommandEvent& event)
3277 {
3278   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3279   double min, max, mean, mode, median, stddev;
3280   rPlotFile.statistics (1, min, max, mean, mode, median, stddev);
3281   DialogAutoScaleParameters dialogAutoScale (getFrameForChild(), mean, mode, median, stddev, m_dAutoScaleFactor);
3282   int iRetVal = dialogAutoScale.ShowModal();
3283   if (iRetVal == wxID_OK) {
3284     m_bMinSpecified = true;
3285     m_bMaxSpecified = true;
3286     double dMin, dMax;
3287     if (dialogAutoScale.getMinMax (&dMin, &dMax)) {
3288       m_dMinPixel = dMin;
3289       m_dMaxPixel = dMax;
3290       m_dAutoScaleFactor = dialogAutoScale.getAutoScaleFactor();
3291       OnUpdate (this, NULL);
3292     }
3293   }
3294   GetDocument()->Activate();
3295 }
3296
3297 void
3298 PlotFileView::OnScaleMinMax (wxCommandEvent& event)
3299 {
3300   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3301   double min;
3302   double max;
3303
3304   if (! m_bMinSpecified || ! m_bMaxSpecified) {
3305     if (! rPlotFile.getMinMax (1, min, max)) {
3306       *theApp->getLog() << "Error: unable to find Min/Max\n";
3307       return;
3308     }
3309   }
3310
3311   if (m_bMinSpecified)
3312     min = m_dMinPixel;
3313   if (m_bMaxSpecified)
3314     max = m_dMaxPixel;
3315
3316   DialogGetMinMax dialogMinMax (getFrameForChild(), "Set Y-axis Minimum & Maximum", min, max);
3317   int retVal = dialogMinMax.ShowModal();
3318   if (retVal == wxID_OK) {
3319     m_bMinSpecified = true;
3320     m_bMaxSpecified = true;
3321     m_dMinPixel = dialogMinMax.getMinimum();
3322     m_dMaxPixel = dialogMinMax.getMaximum();
3323     OnUpdate (this, NULL);
3324   }
3325   GetDocument()->Activate();
3326 }
3327
3328 void
3329 PlotFileView::OnScaleFull (wxCommandEvent& event)
3330 {
3331   if (m_bMinSpecified || m_bMaxSpecified) {
3332     m_bMinSpecified = false;
3333     m_bMaxSpecified = false;
3334     OnUpdate (this, NULL);
3335   }
3336   GetDocument()->Activate();
3337 }
3338
3339
3340 PlotFileCanvas*
3341 PlotFileView::CreateCanvas (wxFrame* parent)
3342 {
3343   PlotFileCanvas* pCanvas;
3344   int width, height;
3345   parent->GetClientSize(&width, &height);
3346
3347   pCanvas = new PlotFileCanvas (this, parent, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), 0);
3348
3349   pCanvas->SetBackgroundColour(*wxWHITE);
3350   pCanvas->Clear();
3351
3352   return pCanvas;
3353 }
3354
3355 #if CTSIM_MDI
3356 wxDocMDIChildFrame*
3357 #else
3358 wxDocChildFrame*
3359 #endif
3360 PlotFileView::CreateChildFrame(wxDocument *doc, wxView *view)
3361 {
3362 #ifdef CTSIM_MDI
3363   wxDocMDIChildFrame *subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
3364 #else
3365   wxDocChildFrame *subframe = new wxDocChildFrame(doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "Plot Frame", wxPoint(10, 10), wxSize(500, 300), wxDEFAULT_FRAME_STYLE);
3366 #endif
3367   theApp->setIconForFrame (subframe);
3368
3369   m_pFileMenu = new wxMenu;
3370
3371   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
3372   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
3373   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
3374   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
3375   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
3376   m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
3377
3378   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3379   m_pFileMenu->Append(PLOTMENU_FILE_PROPERTIES, "P&roperties\tCtrl-I");
3380
3381   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3382   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
3383   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
3384   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
3385   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3386   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
3387 #ifdef CTSIM_MDI
3388   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3389   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
3390   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
3391 #endif
3392   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3393   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3394
3395   wxMenu *view_menu = new wxMenu;
3396   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX, "Display Scale &Set...\tCtrl-E");
3397   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO, "Display Scale &Auto...\tCtrl-A");
3398   view_menu->Append(PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL, "Display &Full Scale\tCtrl-U");
3399
3400   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3401   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
3402   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
3403   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
3404   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
3405
3406   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3407
3408   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
3409   menu_bar->Append(view_menu, "&View");
3410   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
3411
3412   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3413   subframe->Centre(wxBOTH);
3414
3415   wxAcceleratorEntry accelEntries[4];
3416   accelEntries[0].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('E'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_MINMAX);
3417   accelEntries[1].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('A'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_AUTO);
3418   accelEntries[2].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('U'), PLOTMENU_VIEW_SCALE_FULL);
3419   accelEntries[3].Set (wxACCEL_CTRL, static_cast<int>('I'), PLOTMENU_FILE_PROPERTIES);
3420   wxAcceleratorTable accelTable (4, accelEntries);
3421   subframe->SetAcceleratorTable (accelTable);
3422
3423   return subframe;
3424 }
3425
3426
3427 bool
3428 PlotFileView::OnCreate (wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3429 {
3430   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3431   SetFrame(m_pFrame);
3432
3433   m_bMinSpecified = false;
3434   m_bMaxSpecified = false;
3435   m_dAutoScaleFactor = 1.;
3436
3437   int width, height;
3438   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
3439   m_pFrame->SetTitle ("Plot File");
3440   m_pCanvas = CreateCanvas (m_pFrame);
3441
3442   m_pFrame->Show(true);
3443   Activate(true);
3444
3445   return true;
3446 }
3447
3448 void
3449 PlotFileView::OnDraw (wxDC* dc)
3450 {
3451   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3452   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
3453   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
3454
3455   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
3456     int xsize, ysize;
3457     m_pCanvas->GetClientSize (&xsize, &ysize);
3458     SGPDriver driver (dc, xsize, ysize);
3459     SGP sgp (driver);
3460     if (m_pEZPlot)
3461       m_pEZPlot->plot (&sgp);
3462   }
3463 }
3464
3465
3466 void
3467 PlotFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3468 {
3469   const PlotFile& rPlotFile = GetDocument()->getPlotFile();
3470   const int iNColumns = rPlotFile.getNumColumns();
3471   const int iNRecords = rPlotFile.getNumRecords();
3472   const bool bScatterPlot = rPlotFile.getIsScatterPlot();
3473
3474   if (iNColumns > 0 && iNRecords > 0) {
3475     if (m_pEZPlot)
3476       delete m_pEZPlot;
3477     m_pEZPlot = new EZPlot;
3478
3479     for (unsigned int iEzset = 0; iEzset < rPlotFile.getNumEzsetCommands(); iEzset++)
3480       m_pEZPlot->ezset (rPlotFile.getEzsetCommand (iEzset));
3481
3482     if (m_bMinSpecified) {
3483       std::ostringstream os;
3484       os << "ymin " << m_dMinPixel;
3485       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3486     }
3487
3488     if (m_bMaxSpecified) {
3489       std::ostringstream os;
3490       os << "ymax " << m_dMaxPixel;
3491       m_pEZPlot->ezset (os.str());
3492     }
3493
3494     m_pEZPlot->ezset("box");
3495     m_pEZPlot->ezset("grid");
3496
3497     double* pdX = new double [iNRecords];
3498     double* pdY = new double [iNRecords];
3499     if (! bScatterPlot) {
3500       rPlotFile.getColumn (0, pdX);
3501
3502       for (int iCol = 1; iCol < iNColumns; iCol++) {
3503         rPlotFile.getColumn (iCol, pdY);
3504         m_pEZPlot->addCurve (pdX, pdY, iNRecords);
3505       }
3506     } else {
3507       rPlotFile.getColumn (0, pdX);
3508       rPlotFile.getColumn (1, pdY);
3509       m_pEZPlot->addCurve (pdX, pdY, iNRecords);
3510     }
3511     delete pdX;
3512     delete pdY;
3513   }
3514
3515   if (m_pCanvas)
3516     m_pCanvas->Refresh();
3517 }
3518
3519 bool
3520 PlotFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3521 {
3522   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3523   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3524     return false;
3525
3526   Activate(false);
3527   if (m_pCanvas) {
3528     m_pCanvas->setView (NULL);
3529     m_pCanvas = NULL;
3530   }
3531   wxString s(wxTheApp->GetAppName());
3532   if (m_pFrame)
3533     m_pFrame->SetTitle(s);
3534
3535   SetFrame(NULL);
3536   if (deleteWindow) {
3537     delete m_pFrame;
3538     m_pFrame = NULL;
3539     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3540       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3541   }
3542
3543   return true;
3544 }
3545
3546
3547 ////////////////////////////////////////////////////////////////
3548
3549
3550 IMPLEMENT_DYNAMIC_CLASS(TextFileView, wxView)
3551
3552 TextFileView::~TextFileView()
3553 {
3554   GetDocumentManager()->FileHistoryRemoveMenu (m_pFileMenu);
3555   GetDocumentManager()->ActivateView(this, FALSE, TRUE);;
3556 }
3557
3558 bool TextFileView::OnCreate(wxDocument *doc, long WXUNUSED(flags) )
3559 {
3560   m_pFrame = CreateChildFrame(doc, this);
3561   SetFrame (m_pFrame);
3562
3563   int width, height;
3564   m_pFrame->GetClientSize(&width, &height);
3565   m_pFrame->SetTitle("TextFile");
3566   m_pCanvas = new TextFileCanvas (this, m_pFrame, wxPoint(0, 0), wxSize(width, height), wxTE_MULTILINE | wxTE_READONLY);
3567   m_pFrame->SetTitle("Log");
3568
3569   m_pFrame->Show (true);
3570   Activate (true);
3571
3572   return true;
3573 }
3574
3575 // Handled by wxTextWindow
3576 void TextFileView::OnDraw(wxDC *WXUNUSED(dc) )
3577 {
3578 }
3579
3580 void TextFileView::OnUpdate (wxView *WXUNUSED(sender), wxObject *WXUNUSED(hint) )
3581 {
3582 }
3583
3584 bool
3585 TextFileView::OnClose (bool deleteWindow)
3586 {
3587   if (! theApp->getMainFrame()->getShuttingDown())
3588     return false;
3589
3590   Activate(false);
3591   //GetDocumentManager()->ActivateView (this, false, true);
3592   if (! GetDocument() || ! GetDocument()->Close())
3593     return false;
3594
3595   SetFrame(NULL);
3596   if (deleteWindow) {
3597     delete m_pFrame;
3598     m_pFrame = NULL;
3599     if (GetDocument() && GetDocument()->getBadFileOpen())
3600       ::wxYield();  // wxWindows bug workaround
3601   }
3602
3603   return TRUE;
3604 }
3605
3606 #if CTSIM_MDI
3607 wxDocMDIChildFrame*
3608 #else
3609 wxDocChildFrame*
3610 #endif
3611 TextFileView::CreateChildFrame (wxDocument *doc, wxView *view)
3612 {
3613 #if CTSIM_MDI
3614   wxDocMDIChildFrame* subframe = new wxDocMDIChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(0,0), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3615 #else
3616   wxDocChildFrame* subframe = new wxDocChildFrame (doc, view, theApp->getMainFrame(), -1, "TextFile Frame", wxPoint(-1, -1), wxSize(300, 150), wxDEFAULT_FRAME_STYLE, "Log");
3617 #endif
3618   theApp->setIconForFrame (subframe);
3619
3620   m_pFileMenu = new wxMenu;
3621
3622   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_PHANTOM, "Cr&eate Phantom...\tCtrl-P");
3623   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_CREATE_FILTER, "Create &Filter...\tCtrl-F");
3624   m_pFileMenu->Append(wxID_OPEN, "&Open...\tCtrl-O");
3625   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVE, "&Save\tCtrl-S");
3626   m_pFileMenu->Append(wxID_SAVEAS, "Save &As...");
3627   //  m_pFileMenu->Append(wxID_CLOSE, "&Close\tCtrl-W");
3628
3629   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3630   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT, "&Print...");
3631   m_pFileMenu->Append(wxID_PRINT_SETUP, "Print &Setup...");
3632   m_pFileMenu->Append(wxID_PREVIEW, "Print Pre&view");
3633   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3634   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_IMPORT, "&Import...\tCtrl-M");
3635 #ifdef CTSIM_MDI
3636   m_pFileMenu->AppendSeparator();
3637   m_pFileMenu->Append (MAINMENU_FILE_PREFERENCES, "Prefere&nces...");
3638   m_pFileMenu->Append(MAINMENU_FILE_EXIT, "E&xit");
3639 #endif
3640   GetDocumentManager()->FileHistoryAddFilesToMenu(m_pFileMenu);
3641   GetDocumentManager()->FileHistoryUseMenu(m_pFileMenu);
3642
3643   wxMenu *help_menu = new wxMenu;
3644   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_CONTENTS, "&Contents\tF1");
3645   help_menu->Append (MAINMENU_HELP_TIPS, "&Tips");
3646   help_menu->Append (IDH_QUICKSTART, "&Quick Start");
3647   help_menu->Append(MAINMENU_HELP_ABOUT, "&About");
3648
3649   wxMenuBar *menu_bar = new wxMenuBar;
3650
3651   menu_bar->Append(m_pFileMenu, "&File");
3652   menu_bar->Append(help_menu, "&Help");
3653
3654   subframe->SetMenuBar(menu_bar);
3655   subframe->Centre(wxBOTH);
3656
3657   return subframe;
3658 }
3659
3660
3661 // Define a constructor for my text subwindow
3662 TextFileCanvas::TextFileCanvas (TextFileView* v, wxFrame* frame, const wxPoint& pos, const wxSize& size, long style)
3663 : wxTextCtrl (frame, -1, "", pos, size, style), m_pView(v)
3664 {
3665 }
3666
3667 TextFileCanvas::~TextFileCanvas ()
3668 {
3669   m_pView = NULL;
3670 }
3671
3672 wxSize
3673 TextFileCanvas::GetBestSize() const
3674 {
3675   int xSize, ySize;
3676   theApp->getMainFrame()->GetClientSize (&xSize, &ySize);
3677   xSize = maxValue<int> (xSize, ySize);
3678 #ifdef CTSIM_MDI
3679   ySize = xSize = (xSize / 4);
3680 #else
3681   ySize = xSize;
3682 #endif
3683   return wxSize (xSize, ySize);
3684 }