obj.lisp

   1 ;;; $Id: obj.lisp,v 1.1 2002/10/05 20:17:14 kevin Exp $
   2 ;;;
   3 ;;; UMLS object defintions and printing routines
   4
   5 (in-package :umlisp)
   6 (declaim (optimize (speed 3) (safety 1)))
   7
   8 (defclass umlsclass ()
   9   ()
  10   (:metaclass ml-class)
  11   (:documentation "Parent class of all UMLS objects"))
  12
  13
  14 (defmethod print-object ((obj umlsclass) (s stream))
  15   (print-unreadable-object (obj s :type t :identity t)
  16     (let ((fmt (make-instance 'gu.ml::textformat)))
  17       (apply #'format
  18              s (funcall (gu.ml::obj-data-fmtstr fmt) obj)
  19              (multiple-value-list
  20               (funcall (funcall (gu.ml::obj-data-value-func fmt) obj) obj))))))
  21
  22
  23 (defclass umlisp-user (umlsclass)
  24   ((id :type fixnum :initarg :id :reader id)
  25    (first-name :type string :initarg :first-name :reader first-name)
  26    (last-name :type string :initarg :last-name :reader last-name)
  27    (organization :type string :initarg :organization :reader organization)
  28    (address1 :type string :initarg :address1 :reader address1)
  29    (address2 :type string :initarg :address2 :reader address2)
  30    (city :type string :initarg :city :reader city)
  31    (state :type string :initarg :state :reader state)
  32    (zip :type string :initarg :zip :reader zip)
  33    (country :type string :initarg :country :reader country)
  34    (licensed :type boolean :initarg :licensed :reader licensed)
  35    (occupation :type string :initarg :occupation :reader occupation)
  36    (email :type string :initarg :email :reader email)
  37    (passwd :type string :initarg :passwd :reader passwd)
  38    (srl :type fixnum :initarg :srl :reader srl)
  39    (timeout :type fixnum :initarg :timeout :reader timeout)
  40    (maillist :type boolean :initarg :maillist :reader maillist)
  41    (datetime-created :type string :initarg :datetime-created
  42                      :reader datetime-created)
  43    (datetime-modified :type string :initarg :datetime-modified
  44                       :reader datetime-modified))
  45    (:default-initargs
  46     :id nil :first-name nil :last-name nil :email nil :passwd nil :srl nil
  47     :organization nil :address1 nil :address2 nil :city nil :state nil
  48     :zip nil :country nil :licensed nil :occupation nil :maillist nil
  49     :timeout nil :datetime-created nil :datetime-modified nil)
  50   (:metaclass ml-class)
  51   (:title "UMLisp User")
  52   (:fields
  53    (id :fixnum) (first-name :string) (last-name :string) (email :string)
  54    (occupation :string) (organization :string) (address1 :string)
  55    (address2 :string) (city :string) (state :string) (zip :string)
  56    (country :string) (licensed :boolean) (maillist :boolean) (srl :fixnum)
  57    (timeout :fixnum) (datetime-created :string) (datetime-modified :string))
  58   (:documentation "Class for UMLisp user database"))
  59
  60 (defclass ustats (umlsclass)
  61   ((name :type string :initarg :name :reader name)
  62    (hits :type integer :initarg :hits :reader hits)
  63    (srl :type fixnum :initarg :srl :reader srl))
  64   (:metaclass ml-class)
  65   (:default-initargs :name nil :hits nil :srl nil)
  66   (:title "UMLS Statistic")
  67   (:fields (name :string) (hits :commainteger) (srl :fixnum))
  68   (:documentation "Custom Table: UMLS Database statistics."))
  69
  70 (defclass usrl (umlsclass)
  71   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
  72    (srl :type integer :initarg :srl :reader srl))
  73   (:metaclass ml-class)
  74   (:default-initargs :sab nil :srl nil)
  75   (:title "Source Restriction Level")
  76   (:fields (sab :string) (srl :fixnum))
  77   (:documentation "Custom Table: Source Restriction Level"))
  78
  79 (defclass bsab (umlsclass)
  80   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
  81    (name :type string :initarg :name :reader name)
  82    (hits :type fixnum :initarg :hits :reader hits))
  83   (:metaclass ml-class)
  84   (:default-initargs :sab nil :name nil :hits nil)
  85   (:title "Source of Abbreviation")
  86   (:fields (sab :string) (name :string) (hits :commainteger))
  87   (:ref-fields (sab find-ustr-sab (("subobjects" "no"))))
  88   (:documentation "Bonus SAB file"))
  89
  90 (defclass btty (umlsclass)
  91   ((tty :type string :initarg :tty :reader tty)
  92    (name :type string :initarg :name :reader name))
  93   (:metaclass ml-class)
  94   (:default-initargs :tty nil :name nil)
  95   (:title "Bonus TTY")
  96   (:fields (tty :string) (name :fixnum))
  97   (:documentation "Bonus TTY file"))
  98
  99 (defclass brel (umlsclass)
 100   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 101    (sl :type string :initarg :sl :reader sl)
 102    (rel :type string :initarg :rel :reader rel)
 103    (rela :type string :initarg :rela :reader rela)
 104    (hits :type fixnum :initarg :hits :reader hits))
 105   (:metaclass ml-class)
 106   (:default-initargs :sab nil :sl nil :rel nil :rela nil :hits nil)
 107   (:title "Bonus REL")
 108   (:fields
 109    (sab :string) (sl :string) (rel :string) (rela :string) (hits :commainteger))
 110   (:documentation "Bonus REL file"))
 111
 112 (defclass batn (umlsclass)
 113   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 114    (atn :type string :initarg :atn :reader atn)
 115    (hits :type fixnum :initarg :hits :reader hits))
 116   (:metaclass ml-class)
 117   (:default-initargs :sab nil :atn nil)
 118   (:title "Bonus ATN")
 119   (:fields (sab :string) (atn :string) (hits :commaninteger))
 120   (:documentation "Bonus ATN file"))
 121
 122 (defclass urank (umlsclass)
 123   ((rank :type fixnum :initarg :rank :reader rank)
 124    (sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 125    (tty :type string :initarg :tty :reader tty)
 126    (supres :type string :initarg :supres :reader supres))
 127   (:metaclass ml-class)
 128   (:default-initargs :rank nil :sab nil :tty nil :supres nil)
 129   (:title "Rank")
 130   (:fields (rank :fixnum) (sab :string) (tty :string) (supres :string)))
 131
 132 (defclass udef (umlsclass)
 133   ((def :type string :initarg :def :reader def)
 134    (sab :type string :initarg :sab :reader sab))
 135   (:metaclass ml-class)
 136   (:default-initargs :def nil :sab nil)
 137   (:title "Definition")
 138   (:ref-fields (sab find-bsab-sab))
 139   (:fields (sab :string) (def :cdata)))
 140
 141 (defclass usat (umlsclass)
 142   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 143    (code :type string :initarg :code :reader code)
 144    (atn :type string :initarg :atn :reader atn)
 145    (atv :type string :initarg :atv :reader atv))
 146   (:metaclass ml-class)
 147   (:default-initargs :sab nil :code nil :atn nil :atv nil)
 148   (:title "Simple Attribute")
 149   (:ref-fields (sab find-bsab-sab))
 150   (:fields (sab :string) (code :string) (atn :string) (atv :cdata)))
 151
 152 (defclass uso (umlsclass)
 153   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 154    (code :type string :initarg :code :reader code)
 155    (tty :type string :initarg :tty :reader tty)
 156    (srl :type fixnum :initarg :srl :reader srl))
 157   (:metaclass ml-class)
 158   (:default-initargs :sab nil :code nil :tty nil :srl nil)
 159   (:title "Source")
 160   (:ref-fields (sab find-bsab-sab) (tty find-btty-tty))
 161   (:fields (sab :string) (code :string) (tty :string) (srl :fixnum)))
 162
 163 (defclass ucxt (umlsclass)
 164   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 165    (code :type string :initarg :code :reader code)
 166    (rnk :type fixnum :initarg :rnk :reader rnk)
 167    (cxn :type fixnum :initarg :cxn :reader cxn)
 168    (cxl :type string :initarg :cxl :reader cxl)
 169    (cxs :type string :initarg :cxs :reader cxs)
 170    (cui2 :type fixnum :initarg :cui2 :reader cui2)
 171    (hcd :type string :initarg :hcd :reader hcd)
 172    (rela :type string :initarg :rela :reader rela)
 173    (xc :type string  :initarg :xc :reader xc))
 174   (:metaclass ml-class)
 175   (:default-initargs :sab nil :code nil :rnk nil :cxn nil :cxl nil :cxs nil
 176                      :cui2 nil :hcd nil :rela nil :xc nil)
 177   (:title "Context")
 178   (:ref-fields (sab find-bsab-sab) (cui2 find-ucon-cui))
 179   (:fields
 180    (sab :string) (code :string) (rnk :fixnum) (cxn :fixnum) (cxl :string)
 181    (hcd :string) (rela :string) (xc :string) (cui2 :string fmt-cui)
 182    (cxs :cdata)))
 183
 184 (defclass ustr (umlsclass)
 185   ((sui :type fixnum :initarg :sui :reader sui)
 186    (cui :type fixnum :initarg :cui :reader cui)
 187    (lui :type fixnum :initarg :lui :reader lui)
 188    (cuisui :type integer :initarg :cuisui :reader cuisui )
 189    (str :type string :initarg :str :reader str)
 190    (lrl :type fixnum :initarg :lrl :reader lrl)
 191    (stt :type string :initarg :stt :reader stt)
 192    (s#sat :reader s#sat)
 193    (s#so :reader s#so)
 194    (s#cxt :reader s#cxt))
 195   (:metaclass ml-class)
 196   (:default-initargs
 197    :sui nil :cui nil :lui nil :cuisui nil :str nil :lrl nil :stt nil)
 198   (:title "String")
 199   (:subobjects-lists (s#sat usat) (s#so uso) (s#cxt ucxt))
 200   (:fields (sui :string fmt-sui) (stt :string) (lrl :fixnum) (str :cdata))
 201   (:ref-fields (sui find-ustr-sui)))
 202
 203 (defclass ulo (umlsclass)
 204   ((isn :type string :initarg :isn :reader isn)
 205    (fr :type fixnum :initarg :fr :reader fr)
 206    (un :type string :initarg :un :reader un)
 207    (sui :type fixnum :initarg :sui :reader sui)
 208    (sna :type string :initarg :sna :reader sna)
 209    (soui :type string :initarg :soui :reader soui))
 210   (:metaclass ml-class)
 211   (:default-initargs :isn nil :fr nil :un nil :sui nil :sna nil :soui nil)
 212   (:title "Locator")
 213   (:fields (isn :string) (fr :fixnum) (un :string) (sna :string)
 214            (soui :string) (sui :string fmt-sui) (suistr :string)))
 215
 216 (defclass uterm (umlsclass)
 217   ((lui :type fixnum :initarg :lui :reader lui)
 218    (cui :type fixnum :initarg :cui :reader cui)
 219    (lat :type string :initarg :lat :reader lat)
 220    (ts :type string  :initarg :ts :reader ts)
 221    (lrl :type fixnum :initarg :lrl :reader lrl)
 222    (s#str :reader s#str)
 223    (s#sat :reader s#sat))
 224   (:metaclass ml-class)
 225   (:default-initargs :lui nil :cui nil :lat nil :ts nil :lrl nil)
 226   (:title "Term")
 227   (:subobjects-lists (s#sat usat) (s#str ustr))
 228   (:fields (lui :string fmt-lui) (lat :string) (ts :string) (lrl :fixnum))
 229   (:ref-fields (lui find-uterm-lui)))
 230
 231 (defclass usty (umlsclass)
 232   ((tui :type fixnum :initarg :tui :reader tui)
 233    (sty :type string :initarg :sty :reader sty))
 234   (:metaclass ml-class)
 235   (:default-initargs :tui nil :sty nil)
 236   (:title "Semantic Type")
 237   (:ref-fields (tui find-ucon-tui (("subobjects" "no"))))
 238   (:fields (tui :string fmt-tui) (sty :string)))
 239
 240 (defclass urel (umlsclass)
 241   ((rel :type string :initarg :rel :reader rel)
 242    (cui1 :type fixnum :initarg :cui1 :reader cui1)
 243    (cui2 :type fixnum :initarg :cui2 :reader cui2)
 244    (pfstr2 :type string :initarg :pfstr2 :reader pfstr2)
 245    (rela :type string :initarg :rela :reader rela)
 246    (sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 247    (sl :type string  :initarg :sl :reader sl)
 248    (mg :type string  :initarg :mg :reader mg))
 249   (:metaclass ml-class)
 250   (:default-initargs
 251    :rel nil :cui1 nil :cui2 nil :pfstr2 nil :rela nil :sab nil :sl nil :mg nil)
 252   (:title "Relationship")
 253   (:ref-fields (rel find-brel-rel) (sab find-bsab-sab) (cui2 find-ucon-cui))
 254   (:fields (rel :string) (rela :string) (sab :string) (sl :string)
 255            (mg :string) (cui2 :string fmt-cui) (pfstr2 :cdata)))
 256
 257 (defclass ucoc (umlsclass)
 258   ((cui1 :type fixnum :initarg :cui1 :reader cui1)
 259    (cui2 :type fixnum :initarg :cui2 :reader cui2)
 260    (pfstr2 :type string :initarg :pfstr2 :reader pfstr2)
 261    (soc :type string :initarg :soc :reader soc)
 262    (cot :type string :initarg :cot :reader cot)
 263    (cof :type fixnum :initarg :cof :reader cof)
 264    (coa :type string :initarg :coa :reader coa))
 265   (:metaclass ml-class)
 266   (:default-initargs
 267    :cui1 nil :cui2 nil :pfstr2 nil :soc nil :cot nil :cof nil :coa nil)
 268   (:title "Co-occuring Concept")
 269   (:ref-fields (cui2 find-ucon-cui))
 270   (:fields (soc :string) (cot :string) (cof :fixnum) (coa :cdata)
 271            (cui2 :string fmt-cui) (pfstr2 :cdata)))
 272
 273
 274 (defclass uatx (umlsclass)
 275   ((sab :type string :initarg :sab :reader sab)
 276    (rel :type string :initarg :rel :reader rel)
 277    (atx :type string :initarg :atx :reader atx))
 278   (:metaclass ml-class)
 279   (:default-initargs :sab nil :rel nil :atx nil)
 280   (:title "Associated Expression")
 281   (:fields (sab :string) (rel :string) (atx :cdata)))
 282
 283 (defclass ucon (umlsclass)
 284   ((cui :type fixnum :initarg :cui :reader cui )
 285    (pfstr :initarg :pfstr :reader pfstr)
 286    (lrl :initarg :lrl :reader lrl)
 287    (s#term :reader s#term)
 288    (s#def :reader s#def)
 289    (s#lo :reader s#lo)
 290    (s#rel :reader s#rel)
 291    (s#coc :reader s#coc)
 292    (s#sat :reader s#sat)
 293    (s#atx :reader s#atx)
 294    (s#sty :reader s#sty))
 295   (:metaclass ml-class)
 296   (:default-initargs :cui nil :pfstr nil :lrl nil)
 297   (:title "Concept")
 298   (:subobjects-lists
 299    (s#def udef) (s#sty usty) (s#lo ulo) (s#atx uatx) (s#sat usat) (s#rel urel)
 300    (s#coc ucoc) (s#term uterm))
 301   (:fields (cui :string fmt-cui) (lrl :fixum) (pfstr :cdata))
 302   (:ref-fields (cui find-ucon-cui)))
 303
 304 (defclass uxw (umlsclass)
 305   ((wd :type string :initarg :wd :reader wd)
 306    (cui :type fixnum :initform nil :initarg :cui :reader cui)
 307    (lui :type fixnum :initform nil :initarg :lui :reader lui)
 308    (sui :type fixnum :initform nil :initarg :sui :reader sui))
 309   (:metaclass ml-class)
 310   (:default-initargs :wd nil :cui nil :lui nil :sui nil)
 311   (:title "XW Index")
 312   (:fields (wd :string) (cui :string fmt-cui) (lui :string fmt-lui)
 313            (sui :string fmt-sui)))
 314
 315 (defclass uxnw (umlsclass)
 316   ((lat :type string :initarg :lat :reader lat)
 317    (nwd :type string :initarg :nwd :reader nwd)
 318   (cuilist :type list :initarg :cuilist :reader uxnw-cuilist))
 319   (:metaclass ml-class)
 320   (:default-initargs :lat nil :nwd nil :cuilist nil)
 321   (:title "XNW Index")
 322   (:fields (lat :string) (nwd :string) (cuilist :string)))
 323
 324 (defclass uxns (umlsclass)
 325   ((lat :type string :initarg :lat :reader lat)
 326    (nstr :type string :initarg :nstr :reader nstr)
 327    (cuilist :type list :initarg :cuilist :reader cuilist))
 328   (:metaclass ml-class)
 329   (:default-initargs :lat nil :nstr nil :cuilist nil)
 330   (:title "XNS Index")
 331   (:fields (lat :string) (nstr :string) (cuilist :string)))
 332
 333
 334 ;;; LEX objects
 335
 336 (defclass lexterm (umlsclass)
 337   ((eui :type fixnum :initarg :eui :reader eui)
 338    (wrd :type string :initarg :wrd :reader wrd)
 339    (s#abr :reader s#abr)
 340    (s#agr :reader s#agr)
 341    (s#cmp :reader s#cmp)
 342    (s#mod :reader s#mod)
 343    (s#nom :reader s#nom)
 344    (s#prn :reader s#prn)
 345    (s#prp :reader s#prp)
 346    (s#spl :reader s#spl)
 347    (s#trm :reader s#trm)
 348    (s#typ :reader s#typ))
 349   (:metaclass ml-class)
 350   (:default-initargs :eui nil :wrd nil)
 351   (:title "Lexical Term")
 352   (:subobjects-lists
 353    (s#abr labr) (s#agr lagr) (s#cmp lcmp) (s#mod lmod) (s#nom unom)
 354    (s#prn lprn) (s#prp lprp) (s#spl lspl) (s#trm ltrm) (s#typ ltyp))
 355   (:fields (eui :string fmt-eui) (wrd :string))
 356   (:ref-fields (eui find-lexterm-eui)))
 357
 358
 359 (defclass labr  (umlsclass)
 360   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 361    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 362    (abr :type string :initarg :abr :reader abr)
 363    (eui2 :type integer :initarg :eui2 :reader eui2)
 364    (bas2 :type string :initarg :bas2 :reader bas2))
 365   (:metaclass ml-class)
 366   (:default-initargs :eui nil :bas nil :abr nil :eui2 nil :bas2 nil)
 367   (:title "Abbreviations and Acronyms")
 368   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (abr :string)
 369            (eui2 :string fmt-eui) (bas2 :string )))
 370
 371 (defclass lagr  (umlsclass)
 372   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 373    (str :type string :initarg :str :reader str)
 374    (sca :type string :initarg :sca :reader sca)
 375    (agr :type string :initarg :agr :reader agr)
 376    (cit :type string :initarg :cit :reader cit)
 377    (bas :type string :initarg :bas :reader bas))
 378   (:metaclass ml-class)
 379   (:default-initargs :eui nil :str nil :sca nil :agr nil :cit nil :bas nil)
 380   (:title "Agreement and Inflection")
 381   (:fields (eui :string fmt-eui) (str :string) (sca :string) (agr :string)
 382            (cit :string) (bas :string)))
 383
 384 (defclass lcmp  (umlsclass)
 385   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 386    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 387    (sca :type string :initarg :sca :reader sca)
 388    (com :type string :initarg :com :reader com))
 389   (:metaclass ml-class)
 390   (:default-initargs :eui nil :bas nil :sca nil :com nil)
 391   (:title "Complementation")
 392   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (sca :string) (com :string)))
 393
 394 (defclass lmod  (umlsclass)
 395   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 396    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 397    (sca :type string :initarg :sca :reader sca)
 398    (psnmod :type string :initarg :psnmod :reader psnmod)
 399    (fea :type string :initarg :fea :reader fea))
 400   (:metaclass ml-class)
 401   (:default-initargs :eui nil :bas nil :sca nil :psnmod nil :fea nil)
 402   (:title "Modifiers")
 403   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (sca :string) (psnmod :string)
 404            (fea :string)))
 405
 406 (defclass lnom  (umlsclass)
 407   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 408    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 409    (sca :type string :initarg :sca :reader sca)
 410    (eui2 :type integer :initarg :eui2 :reader eui2)
 411    (bas2 :type string :initarg :bas2 :reader bas2)
 412    (sca2 :type string :initarg :sca2 :reader sca2))
 413   (:metaclass ml-class)
 414   (:default-initargs :eui nil :bas nil :sca nil :eui2 nil :bas2 nil :sca2 nil)
 415   (:title "Nominalizations")
 416   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (sca :string)
 417            (eui2 :string fmt-eui) (bas2 :string) (sca2 :string)))
 418
 419 (defclass lprn  (umlsclass)
 420   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 421    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 422    (num :type string :initarg :num :reader num)
 423    (gnd :type string :initarg :gnd :reader gnd)
 424    (cas :type string :initarg :cas :reader cas)
 425    (pos :type string :initarg :pos :reader pos)
 426    (qnt :type string :initarg :qnt :reader qnt)
 427    (fea :type string :initarg :fea :reader fea))
 428   (:metaclass ml-class)
 429   (:default-initargs :eui nil :bas nil :num nil :gnd nil :cas nil
 430                      :pos nil :qnt nil :fea nil)
 431   (:title "Pronouns")
 432   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (num :string) (gnd :string)
 433            (cas :string) (pos :string) (qnt :string) (fea :string)))
 434
 435 (defclass lprp  (umlsclass)
 436   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 437    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 438    (str :type string :initarg :str :reader str)
 439    (sca :type string :initarg :sca :reader sca)
 440    (fea :type string :initarg :fea :reader fea))
 441   (:metaclass ml-class)
 442   (:default-initargs :eui nil :bas nil :str nil :sca nil :fea nil)
 443   (:title "Properties")
 444   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (str :string) (sca :string)
 445            (fea :string)))
 446
 447
 448 (defclass lspl  (umlsclass)
 449   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 450    (spv :type string :initarg :spv :reader spv)
 451    (bas :type string :initarg :bas :reader bas))
 452   (:metaclass ml-class)
 453   (:default-initargs :eui nil :spv nil :bas nil)
 454   (:title "Spelling Variants")
 455   (:fields (eui :string fmt-eui) (spv :string) (bas :string)))
 456
 457
 458
 459 (defclass ltrm  (umlsclass)
 460   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 461    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 462    (gen :type string :initarg :gen :reader gen))
 463   (:metaclass ml-class)
 464   (:default-initargs :eui nil :bas nil :gen nil)
 465   (:title "Trade Marks")
 466   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (gen :string)))
 467
 468 (defclass ltyp  (umlsclass)
 469   ((eui :type integer :initarg :eui :reader eui)
 470    (bas :type string :initarg :bas :reader bas)
 471    (sca :type string :initarg :sca :reader sca)
 472    (typ :type string :initarg :typ :reader typ))
 473   (:metaclass ml-class)
 474   (:default-initargs :eui nil :bas nil :sca nil :typ nil)
 475   (:title "Inflection Type")
 476   (:fields (eui :string fmt-eui) (bas :string) (sca :string) (typ :string)))
 477
 478 (defclass lwd (umlsclass)
 479   ((wrd :type string :initarg :wrd :reader wrd)
 480    (euilist :type list :initarg :euilist :reader euilist))
 481   (:metaclass ml-class)
 482   (:default-initargs :wrd nil :euilist nil)
 483   (:title "Lexical Word Index")
 484   (:fields (wrd :string) (euilist :string)))
 485
 486 ;;; Semantic NET objects
 487
 488 (defclass sdef (umlsclass)
 489   ((rt :type string :initarg :rt :reader rt)
 490    (ui :type integer :initarg :ui :reader ui)
 491    (styrl :type string :initarg :styrl :reader styrl)
 492    (stnrtn :type string :initarg :stnrtn :reader stnrtn)
 493    (def :type string :initarg :def :reader def)
 494    (ex :type string :initarg :ex :reader ex)
 495    (un :type string :initarg :un :reader un)
 496    (rh :type string :initarg :rh :reader rh)
 497    (abr :type string :initarg :abr :reader abr)
 498    (rin :type string :initarg :rin :reader rin))
 499   (:metaclass ml-class)
 500   (:default-initargs
 501    :rt nil :ui nil :styrl nil :stnrtn nil :def nil :ex nil :un nil :rh nil
 502    :abr nil :rin nil)
 503   (:title "Basic information about Semantic Types and Relations")
 504   (:fields
 505    (rt :string) (ui :string fmt-tui) (styrl :string) (stnrtn :string-tui)
 506    (def :string) (ex :string) (un :string) (rh :string) (abr :string)
 507    (rin :string)))
 508
 509 (defclass sstr (umlsclass)
 510   ((styrl :type string :initarg :styrl :reader styrl)
 511    (rl :type string :initarg :rl :reader rl)
 512    (styrl2 :type string :initarg :styrl2 :reader styrl2)
 513    (ls :type string :initarg :ls :reader ls))
 514   (:metaclass ml-class)
 515   (:default-initargs :styrl nil :rl nil :styrl2 nil :ls nil)
 516   (:title "Structure of the Network")
 517   (:fields (styrl :string) (rl :string) (styrl2 :string) (ls :string)))
 518
 519 (defclass sstre1 (umlsclass)
 520   ((ui :type integer :initarg :ui :reader ui)
 521    (ui2 :type integer :initarg :ui2 :reader ui2)
 522    (ui3 :type integer :initarg :ui3 :reader ui3))
 523   (:metaclass ml-class)
 524   (:default-initargs :ui nil :ui2 nil :ui3 nil)
 525   (:title "Fully Inherited Set of Releatons (TUI's)")
 526   (:fields (ui :string fmt-tui) (ui2 :string fmt-tui) (ui3 :string fmt-tui)))
 527
 528 (defclass sstre2 (umlsclass)
 529   ((sty :type string :initarg :ui :reader sty)
 530    (rl :type string :initarg :ui2 :reader rl)
 531    (sty2 :type string :initarg :ui3 :reader sty2))
 532   (:metaclass ml-class)
 533   (:default-initargs :sty nil :rl nil :sty2 nil)
 534   (:title "Fully Inherited Set of Releatons (strings)")
 535   (:fields (sty :string) (rl :string) (sty2 :string)))
 536
 537 ;;; Formatting routines
 538
 539 (defmethod fmt-cui ((c ucon))
 540   (format nil "C~7,'0d" (cui c)))
 541
 542 (defmethod fmt-cui ((c fixnum))
 543   (format nil "C~7,'0d" c))
 544
 545 (defmethod fmt-cui ((c string))
 546   (if (eql (aref c 0) #\C)
 547       c
 548     (format nil "C~7,'0d" (parse-integer c))))
 549
 550 (defmethod fmt-cui ((c null))
 551   (format nil "nil"))
 552
 553 (defmethod fmt-lui ((l uterm))
 554   (format nil "L~7,'0d" (lui l)))
 555
 556 (defmethod fmt-lui ((l fixnum))
 557   (format nil "L~7,'0d" l))
 558
 559 (defmethod fmt-lui ((l string))
 560   (if (eql (aref l 0) #\L)
 561       l
 562   (format nil "L~7,'0d" (parse-integer l))))
 563
 564 (defmethod fmt-sui ((s ustr))
 565   (format nil "S~7,'0d" (sui s)))
 566
 567 (defmethod fmt-sui ((s fixnum))
 568   (format nil "S~7,'0d" s))
 569
 570 (defmethod fmt-sui ((s string))
 571   (if (eql (aref s 0) #\S)
 572       s
 573   (format nil "S~7,'0d" (parse-integer s))))
 574
 575 (defmethod fmt-tui ((s fixnum))
 576   (format nil "T~3,'0d" s))
 577
 578 (defmethod fmt-tui ((s string))
 579   (if (eql (aref s 0) #\T)
 580       s
 581   (format nil "T~3,'0d" (parse-integer s))))
 582
 583 (defmethod fmt-eui ((e fixnum))
 584   (format nil "E~7,'0d" e))
 585
 586 (defmethod fmt-eui ((e string))
 587   (if (eql (aref e 0) #\E)
 588       e
 589     (format nil "E~7,'0d" (parse-integer e))))
 590
 591 (defmethod fmt-eui ((e null))
 592   (format nil "nil"))
 593
 594 ;;; Generic display functions
 595
 596 (eval-when (:compile-toplevel :load-toplevel :execute)
 597 (defun english-term-p (obj)
 598   (and (eq (class-name (class-of obj)) 'uterm)
 599        (string-equal (lat obj) "ENG"))))
 600
 601 (defun display-umls-obj
 602   (obj &key (os *standard-output*) (format :text) (label nil)
 603        (file-wrapper t) (english-only nil) (subobjects nil)
 604        (refvars nil))
 605   (display-ml-class
 606    obj :os os :format format :label label :subobjects subobjects
 607    :file-wrapper file-wrapper
 608    :english-only-function (if english-only #'english-term-p nil)
 609    :refvars refvars))
 610
 611 (defmacro defludisp-ml-class (newfuncname lookup-func)
 612   "Defines functions for looking up and displaying objects"
 613   `(defun ,newfuncname
 614      (keyval &key (os *standard-output*) (format :text) (label nil)
 615              (file-wrapper t) (english-only nil) (subobjects nil))
 616      (let ((obj (funcall ,lookup-func keyval)))
 617        (display-umls-obj obj :os os :format format :label label
 618                          :file-wrapper file-wrapper :english-only english-only
 619                          :subobjects subobjects))))
 620
 621 (defludisp-ml-class disp-con #'find-ucon-cui)
 622 (defludisp-ml-class disp-term #'find-uterm-lui)
 623 (defludisp-ml-class disp-str #'find-ustr-sui)
 624