sql-classes.lisp

   1 ;;;; -*- Mode: Lisp; Syntax: ANSI-Common-Lisp; Base: 10; Package: umlisp -*-
   2 ;;;; *************************************************************************
   3 ;;;; FILE IDENTIFICATION
   4 ;;;;
   5 ;;;; Name:     sql-classes.lisp
   6 ;;;; Purpose:  Routines for reading UMLS objects from SQL database
   7 ;;;; Author:   Kevin M. Rosenberg
   8 ;;;; Created:  Apr 2000
   9 ;;;;
  10 ;;;; $Id$
  11 ;;;;
  12 ;;;; This file, part of UMLisp, is
  13 ;;;;    Copyright (c) 2000-2006 by Kevin M. Rosenberg, M.D.
  14 ;;;;
  15 ;;;; UMLisp users are granted the rights to distribute and use this software
  16 ;;;; as governed by the terms of the GNU General Public License.
  17 ;;;; *************************************************************************
  18
  19 (in-package #:umlisp)
  20
  21
  22 (defvar *current-srl* nil)
  23 (defun current-srl ()
  24   *current-srl*)
  25 (defun current-srl! (srl)
  26   (setq *current-srl* srl))
  27
  28 (defmacro query-string (table fields &optional srl where-name where-value
  29                         &key (lrl "KCUILRL") single distinct order like)
  30   (let* ((%%fields (format nil "select ~A~{~:@(~A~)~^,~} from ~:@(~A~)"
  31                            (if distinct "distinct " "") fields table))
  32          (%%order (if order (format nil " order by ~{~:@(~A~) ~(~A~)~^,~}"
  33                                     order)
  34                       ""))
  35          (%%lrl (format nil " and ~:@(~A~)<=" lrl))
  36          (%%where (when where-name
  37                     (format nil " where ~:@(~A~)~A" where-name
  38                           (if like " like " "")))))
  39     `(concatenate
  40       'string
  41       ,%%fields
  42       ,@(when %%where (list %%where))
  43       ,@(when %%where
  44           `((typecase ,where-value
  45               #+ignore
  46               (fixnum
  47                (concatenate 'string "='" (prefixed-fixnum-string ,where-value #\0 10) "'"))
  48               (number
  49                (concatenate 'string "='" (write-to-string ,where-value) "'"))
  50               (null
  51                " is null")
  52               (t
  53                (format nil ,(if like "'%~A%'" "='~A'") ,where-value)))))
  54       (if ,srl (concatenate 'string ,%%lrl (write-to-string ,srl)) "")
  55       ,@(when %%order (list %%order))
  56       ,@(when single (list " limit 1")))))
  57
  58 (defun query-string-eval (table fields &optional srl where-name where-value
  59                           &key (lrl "KCUILRL") single distinct order like)
  60   (concatenate
  61    'string
  62    (format nil "select ~A~{~:@(~A~)~^,~} from ~:@(~A~)"
  63            (if distinct "distinct " "") fields table)
  64    (if where-name (format nil " where ~:@(~A~)" where-name) "")
  65    (if where-name
  66        (format nil
  67                (typecase where-value
  68                  (number "='~D'")
  69                  (null " is null")
  70                  (t
  71                   (if like " like '%~A%""='~A'")))
  72                where-value)
  73        "")
  74    (if srl (format nil " and ~:@(~A~)<=~D" lrl srl) "")
  75    (if order (format nil " order by ~{~:@(~A~) ~(~A~)~^,~}" order) "")
  76    (if single " limit 1" "")))
  77
  78
  79 (defmacro umlisp-query (table fields srl where-name where-value
  80                      &key (lrl "KCUILRL") single distinct order like
  81                         (query-cmd 'mutex-sql-query))
  82   "Query the UMLisp database. Return a list of umlisp objects whose name
  83 is OBJNAME from TABLE where WHERE-NAME field = WHERE-VALUE with FIELDS"
  84   `(,query-cmd
  85     (query-string ,table ,fields ,srl ,where-name ,where-value
  86      :lrl ,lrl :single ,single :distinct ,distinct :order ,order :like ,like)))
  87
  88 (defmacro umlisp-query-eval (table fields srl where-name where-value
  89                      &key (lrl "KCUILRL") single distinct order like)
  90   "Query the UMLisp database. Return a list of umlisp objects whose name
  91 is OBJNAME from TABLE where WHERE-NAME field = WHERE-VALUE with FIELDS"
  92   `(mutex-sql-query
  93     (query-string-eval ,table ,fields ,srl ,where-name ,where-value
  94      :lrl ,lrl :single ,single :distinct ,distinct :order ,order :like ,like)))
  95
  96 ;; only WHERE-VALUE and SRL are evaluated
  97 (defmacro collect-umlisp-query ((table fields srl where-name where-value
  98                                     &key (lrl "KCUILRL") distinct single
  99                                     order like (query-cmd 'mutex-sql-query))
 100                                 &body body)
 101   (let ((value (gensym))
 102         (r (gensym)))
 103     (if single
 104         `(let* ((,value ,where-value)
 105                 (tuple (car (umlisp-query ,table ,fields ,srl ,where-name ,value
 106                                           :lrl ,lrl :single ,single
 107                                           :distinct ,distinct :order ,order
 108                                           :like ,like
 109                                           :query-cmd ,query-cmd))))
 110           ,@(unless where-name `((declare (ignore ,value))))
 111           (when tuple
 112                 (destructuring-bind ,fields tuple
 113                   ,@body)))
 114         `(let ((,value ,where-value))
 115            ,@(unless where-name `((declare (ignore ,value))))
 116            (let ((,r '()))
 117              (dolist (tuple (umlisp-query ,table ,fields ,srl ,where-name ,value
 118                                           :lrl ,lrl :single ,single :distinct ,distinct
 119                                           :order ,order :like ,like))
 120                (push (destructuring-bind ,fields tuple ,@body) ,r))
 121              (nreverse ,r))
 122            #+ignore
 123            (loop for tuple in
 124                  (umlisp-query ,table ,fields ,srl ,where-name ,value
 125                                :lrl ,lrl :single ,single :distinct ,distinct
 126                                :order ,order :like ,like)
 127                collect (destructuring-bind ,fields tuple ,@body))))))
 128
 129 (defmacro collect-umlisp-query-eval ((table fields srl where-name where-value
 130                                          &key (lrl "KCUILRL") distinct single
 131                                          order like)
 132                                   &body body)
 133   (let ((value (gensym))
 134         (r (gensym))
 135         (eval-fields (cadr fields)))
 136     (if single
 137         `(let* ((,value ,where-value)
 138                 (tuple (car (umlisp-query-eval ,table ,fields ,srl ,where-name ,value
 139                                                :lrl ,lrl :single ,single
 140                                                :distinct ,distinct :order ,order
 141                                                :like ,like))))
 142           (when tuple
 143             (destructuring-bind ,eval-fields tuple
 144               ,@body)))
 145         `(let ((,value ,where-value)
 146                (,r '()))
 147            (dolist (tuple (umlisp-query-eval ,table ,fields ,srl ,where-name ,value
 148                                              :lrl ,lrl :single ,single :distinct ,distinct
 149                                              :order ,order :like ,like))
 150              (push (destructuring-bind ,eval-fields tuple ,@body) ,r))
 151            (nreverse ,r)
 152            #+ignore
 153            (loop for tuple in
 154                  (umlisp-query-eval ,table ,fields ,srl ,where-name ,value
 155                                     :lrl ,lrl :single ,single :distinct ,distinct
 156                                     :order ,order :like ,like)
 157                collect (destructuring-bind ,eval-fields tuple ,@body))))))
 158
 159 ;;;
 160 ;;; Read from SQL database
 161
 162 (defmacro ensure-cui-integer (cui)
 163   `(if (stringp ,cui)
 164     (setq ,cui (parse-cui ,cui))
 165     ,cui))
 166
 167 (defmacro ensure-lui-integer (lui)
 168   `(if (stringp ,lui)
 169     (setq ,lui (parse-lui ,lui))
 170     ,lui))
 171
 172 (defmacro ensure-sui-integer (sui)
 173   `(if (stringp ,sui)
 174     (setq ,sui (parse-sui ,sui))
 175     ,sui))
 176
 177 (defmacro ensure-tui-integer (tui)
 178   `(if (stringp ,tui)
 179     (setq ,tui (parse-tui ,tui))
 180     ,tui))
 181
 182 (defmacro ensure-eui-integer (eui)
 183   `(if (stringp ,eui)
 184     (setq ,eui (parse-eui ,eui))
 185     ,eui))
 186
 187 (defun find-ucon-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 188   "Find ucon for a cui"
 189   (ensure-cui-integer cui)
 190   (collect-umlisp-query (mrconso (kpfstr kcuilrl) srl cui cui :single t)
 191     (make-instance 'ucon :cui cui :pfstr kpfstr
 192                    :lrl (ensure-integer kcuilrl))))
 193
 194 (defun find-ucon-cui-sans-pfstr (cui &key (srl *current-srl*))
 195   "Find ucon for a cui"
 196   (ensure-cui-integer cui)
 197   (collect-umlisp-query (mrconso (kcuilrl) srl cui cui :single t)
 198     (make-instance 'ucon :cui cui :lrl (ensure-integer kcuilrl)
 199                    :pfstr nil)))
 200
 201 (defun find-pfstr-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 202   "Find preferred string for a cui"
 203   (ensure-cui-integer cui)
 204   (collect-umlisp-query (mrconso (kpfstr) srl cui cui :single t)
 205     kpfstr))
 206
 207
 208 (defun find-ucon-lui (lui &key (srl *current-srl*))
 209   "Find list of ucon for lui"
 210   (ensure-lui-integer lui)
 211   (collect-umlisp-query (mrconso (cui kpfstr kcuilrl) srl lui lui
 212                             :distinct t)
 213     (make-instance 'ucon :cui (ensure-integer cui) :pfstr kpfstr
 214                    :lrl (ensure-integer kcuilrl))))
 215
 216 (defun find-ucon-sui (sui &key (srl *current-srl*))
 217   "Find list of ucon for sui"
 218   (ensure-sui-integer sui)
 219   (collect-umlisp-query (mrconso (cui kpfstr kcuilrl) srl sui sui :distinct t)
 220     (make-instance 'ucon :cui (ensure-integer cui) :pfstr kpfstr
 221                    :lrl (ensure-integer kcuilrl))))
 222
 223 (defun find-ucon-aui (aui &key (srl *current-srl*))
 224   "Find list of ucon for aui"
 225   (ensure-sui-integer aui)
 226   (collect-umlisp-query (mrconso (cui kpfstr kcuilrl) srl aui aui :distinct t)
 227     (make-instance 'ucon :cui (ensure-integer cui) :pfstr kpfstr
 228                    :lrl (ensure-integer kcuilrl))))
 229
 230 (defun find-ucon-cuisui (cui sui &key (srl *current-srl*))
 231   "Find ucon for cui/sui"
 232   (ensure-cui-integer cui)
 233   (ensure-sui-integer sui)
 234   (when (and cui sui)
 235     (collect-umlisp-query (mrconso (kpfstr kcuilrl) srl kcuisui
 236                               (make-cuisui cui sui))
 237       (make-instance 'ucon :cui cui
 238                      :pfstr kpfstr
 239                      :lrl (ensure-integer kcuilrl)))))
 240
 241 (defun find-ucon-str (str &key (srl *current-srl*))
 242   "Find ucon that are exact match for str"
 243   (collect-umlisp-query (mrconso (cui kpfstr kcuilrl) srl str str :distinct t)
 244     (make-instance 'ucon :cui (ensure-integer cui) :pfstr kpfstr
 245                    :lrl (ensure-integer kcuilrl))))
 246
 247 (defun find-ucon-all (&key (srl *current-srl*))
 248   "Return list of all ucon's"
 249   (with-sql-connection (db)
 250     (clsql:map-query
 251      'list
 252      #'(lambda (tuple)
 253          (destructuring-bind (cui pfstr cuilrl) tuple
 254              (make-instance 'ucon :cui (ensure-integer cui)
 255                             :pfstr pfstr
 256                         :lrl (ensure-integer cuilrl))))
 257      (query-string mrconso (cui kpfstr kcuilrl) srl nil nil
 258                    :order (cui asc) :distinct t)
 259      :database db)))
 260
 261 (defun find-ucon-all2 (&key (srl *current-srl*))
 262   "Return list of all ucon's"
 263   (collect-umlisp-query (mrconso (cui kpfstr kcuilrl) srl nil nil :order (cui asc)
 264                             :distinct t)
 265     (make-instance 'ucon :cui (ensure-integer cui)
 266                    :pfstr kpfstr
 267                    :lrl (ensure-integer kcuilrl))))
 268
 269 (defun find-cui-ucon-all (&key (srl *current-srl*))
 270   "Return list of CUIs for all ucons"
 271   (collect-umlisp-query (mrconso (cui) srl nil nil :order (cui asc)
 272                                :distinct t)
 273                         cui))
 274
 275 (defun map-ucon-all (fn &key (srl *current-srl*))
 276   "Map a function over all ucon's"
 277   (with-sql-connection (db)
 278     (clsql:map-query
 279      nil
 280      #'(lambda (tuple)
 281          (destructuring-bind (cui pfstr cuilrl) tuple
 282            (funcall fn (make-instance 'ucon :cui (ensure-integer cui)
 283                                       :pfstr pfstr
 284                                       :lrl (ensure-integer cuilrl)))))
 285      (query-string mrconso (cui kpfstr kcuilrl) srl nil nil :order (cui asc)
 286                    :distinct t)
 287      :database db)))
 288
 289
 290 (defun find-udef-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 291   "Return a list of udefs for cui"
 292   (ensure-cui-integer cui)
 293   (collect-umlisp-query (mrdef (sab def suppress) srl cui cui :lrl "KSRL")
 294     (make-instance 'udef :sab sab :def def :suppress suppress)))
 295
 296 (defun find-udoc-key (key)
 297   "Return list of abbreviation documentation for a key"
 298   (collect-umlisp-query (mrdoc (value type expl) nil dockey key)
 299     (make-instance 'udoc :key key :value value :type type :expl expl)))
 300
 301 (defun find-udoc-value (value)
 302   "Return abbreviation documentation"
 303   (collect-umlisp-query (mrdoc (dockey type expl) nil value value)
 304     (make-instance 'udoc :key dockey :value value :type type :expl expl)))
 305
 306 (defun find-udoc-key-value (key value)
 307   (let ((tuple (car (mutex-sql-query
 308                      (format nil "SELECT TYPE,EXPL FROM MRDOC WHERE DOCKEY='~A' AND VALUE='~A'"
 309                              key value)))))
 310     (when tuple
 311       (make-instance 'udoc :key key :value value :type (first tuple) :expl (second tuple)))))
 312
 313 (defun find-udoc-all ()
 314   "Return all abbreviation documentation"
 315   (collect-umlisp-query (mrdoc (dockey value type expl) nil nil nil)
 316     (make-instance 'udoc :key dockey :value value :type type :expl expl)))
 317
 318 (defun find-usty-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 319   "Return a list of usty for cui"
 320   (ensure-cui-integer cui)
 321   (collect-umlisp-query (mrsty (tui sty) srl cui cui :lrl "KLRL")
 322     (make-instance 'usty :tui (ensure-integer tui) :sty sty)))
 323
 324 (defun find-usty-word (word &key (srl *current-srl*))
 325   "Return a list of usty that match word"
 326   (collect-umlisp-query (mrsty (tui sty) srl sty word :lrl klrl :like t
 327                             :distinct t)
 328     (make-instance 'usty :tui (ensure-integer tui) :sty sty)))
 329
 330 (defun find-urel-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 331   "Return a list of urel for cui"
 332   (ensure-cui-integer cui)
 333   (collect-umlisp-query (mrrel (aui1 rel stype1 cui2 aui2 stype2 rela rui srui sab sl rg dir suppress cvf kpfstr2)
 334                                srl cui1 cui :lrl "KSRL")
 335     (make-instance 'urel :cui1 cui :aui1 (ensure-integer aui1) :stype1 stype1 :rel rel
 336                    :cui2 (ensure-integer cui2) :aui2 (ensure-integer aui2) :stype2 stype2
 337                    :rui rui :srui srui :rela rela :sab sab :sl sl :rg rg :dir dir
 338                    :suppress suppress :cvf cvf :pfstr2 kpfstr2)))
 339
 340 (defun find-cui2-urel-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 341   "Return a list of urel for cui"
 342   (ensure-cui-integer cui)
 343   (collect-umlisp-query (mrrel (cui2) srl cui1
 344                                cui :lrl "KSRL")
 345                         cui2))
 346
 347 (defun find-urel-cui2 (cui2 &key (srl *current-srl*))
 348   "Return a list of urel for cui2"
 349   (ensure-cui-integer cui2)
 350   (collect-umlisp-query (mrrel (rel cui1 aui1 stype1 aui2 stype2 rela rui srui sab sl rg dir suppress cvf kpfstr2)
 351                                srl cui2 cui2 :lrl "KSRL")
 352     (make-instance 'urel :cui2 cui2 :rel rel :aui2 (ensure-integer aui2) :stype2 stype2 :rui rui :srui srui
 353                    :stype1 stype1 :cui1 (ensure-integer cui1) :aui1 (ensure-integer aui1)
 354                    :rela rela :sab sab :sl sl :rg rg :dir dir :suppress suppress :cvf cvf
 355                    :pfstr2 kpfstr2)))
 356
 357 (defun find-ucon-rel-cui2 (cui2 &key (srl *current-srl*))
 358   (ensure-cui-integer cui2)
 359   (loop for cui in (remove-duplicates
 360                     (mapcar #'cui1 (find-urel-cui2 cui2 :srl srl)))
 361         collect (find-ucon-cui cui :srl srl)))
 362
 363 (defun find-ucoc-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 364   "Return a list of ucoc for cui"
 365   (ensure-cui-integer cui)
 366   (collect-umlisp-query (mrcoc (aui1 cui2 aui2 sab cot cof coa kpfstr2) srl cui1
 367                             cui :lrl klrl :order (cof asc))
 368     (setq cui2 (ensure-integer cui2))
 369     (when (eql 0 cui2) (setq cui2 nil))
 370     (make-instance 'ucoc :cui1 cui :aui1 (ensure-integer aui1)
 371                    :cui2 (ensure-integer cui2) :aui2 (ensure-integer aui2)
 372                    :cot cot :cof (ensure-integer cof) :coa coa :sab sab
 373                    :pfstr2 kpfstr2)))
 374
 375 (defun find-ucoc-cui2 (cui2 &key (srl *current-srl*))
 376   "Return a list of ucoc for cui2"
 377   (ensure-cui-integer cui2)
 378   (collect-umlisp-query (mrcoc (cui1 aui1 aui2 sab cot cof coa kpfstr2) srl cui2
 379                             cui2 :lrl klrl :order (cof asc))
 380     (when (zerop cui2) (setq cui2 nil))
 381     (make-instance 'ucoc :cui1 (ensure-integer cui1) :cui2 cui2
 382                    :aui1 (ensure-integer aui1) :aui2 (ensure-integer aui2)
 383                    :sab sab :cot cot :cof (ensure-integer cof) :coa coa
 384                    :pfstr2 kpfstr2)))
 385
 386 (defun find-ucon-coc-cui2 (cui2 &key (srl *current-srl*))
 387   "List of ucon with co-occurance cui2"
 388   (ensure-cui-integer cui2)
 389   (mapcar
 390    #'(lambda (cui) (find-ucon-cui cui :srl srl))
 391    (remove-duplicates (mapcar #'cui1 (find-ucoc-cui2 cui2 :srl srl)))))
 392
 393
 394 (defun find-uterm-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 395   "Return a list of uterm for cui"
 396   (ensure-cui-integer cui)
 397   (collect-umlisp-query (mrconso (lui lat ts kluilrl) srl cui cui
 398                             :lrl kluilrl :distinct t)
 399     (make-instance 'uterm :lui (ensure-integer lui) :cui cui
 400                    :lat lat :ts ts :lrl (ensure-integer kluilrl))))
 401
 402 (defun find-uterm-lui (lui &key (srl *current-srl*))
 403   "Return a list of uterm for lui"
 404   (ensure-lui-integer lui)
 405   (collect-umlisp-query (mrconso (cui lat ts kluilrl) srl lui lui
 406                              :lrl kluilrl :distinct t)
 407     (make-instance 'uterm :cui (ensure-integer cui) :lui lui
 408                    :lat lat :ts ts :lrl (ensure-integer kluilrl))))
 409
 410 (defun find-uterm-cuilui (cui lui &key (srl *current-srl*))
 411   "Return single uterm for cui/lui"
 412   (ensure-cui-integer cui)
 413   (ensure-lui-integer lui)
 414   (collect-umlisp-query (mrconso (lat ts kluilrl) srl kcuilui
 415                              (make-cuilui cui lui)
 416                              :lrl kluilrl :single t)
 417     (make-instance 'uterm :cui cui :lui lui :lat lat :ts ts
 418                    :lrl (ensure-integer kluilrl))))
 419
 420 (defun find-ustr-cuilui (cui lui &key (srl *current-srl*))
 421   "Return a list of ustr for cui/lui"
 422   (ensure-cui-integer cui)
 423   (ensure-lui-integer lui)
 424   (collect-umlisp-query (mrconso (sui stt str suppress ksuilrl) srl kcuilui
 425                                  (make-cuilui cui lui) :lrl ksuilrl)
 426                 (make-instance 'ustr :sui (ensure-integer sui) :cui cui :lui lui
 427                    :cuisui (make-cuisui cui sui) :stt stt :str str :suppress suppress
 428                    :lrl (ensure-integer ksuilrl))))
 429
 430 (defun find-ustr-cuisui (cui sui &key (srl *current-srl*))
 431   "Return the single ustr for cuisui"
 432   (ensure-cui-integer cui)
 433   (ensure-sui-integer sui)
 434   (collect-umlisp-query (mrconso (lui stt str suppress ksuilrl) srl kcuisui
 435                             (make-cuisui cui sui) :lrl lsuilrl :single t)
 436     (make-instance 'ustr :sui sui :cui cui :cuisui (make-cuisui cui sui)
 437                    :lui (ensure-integer lui) :stt stt :str str :suppress suppress
 438                    :lrl (ensure-integer ksuilrl))))
 439
 440 (defun find-ustr-sui (sui &key (srl *current-srl*))
 441   "Return the list of ustr for sui"
 442   (ensure-sui-integer sui)
 443   (collect-umlisp-query (mrconso (cui lui stt str suppress ksuilrl) srl sui sui
 444                             :lrl ksuilrl)
 445     (make-instance 'ustr :sui sui :cui cui :stt stt :str str
 446                    :cuisui (make-cuisui (ensure-integer cui) sui)
 447                    :suppress suppress
 448                    :lui (ensure-integer lui) :lrl (ensure-integer ksuilrl))))
 449
 450 (defun find-ustr-sab (sab &key (srl *current-srl*))
 451   "Return the list of ustr for sab"
 452   (collect-umlisp-query (mrconso (kcuisui) srl sab sab :lrl srl)
 453     (let ((cuisui (ensure-integer kcuisui)))
 454       (apply #'find-ustr-cuisui
 455              (append
 456               (multiple-value-list (decompose-cuisui cuisui))
 457               (list :srl srl))))))
 458
 459 (defun find-ustr-all (&key (srl *current-srl*))
 460   "Return list of all ustr's"
 461     (with-sql-connection (db)
 462       (clsql:map-query
 463        'list
 464        #'(lambda (tuple)
 465            (destructuring-bind (cui lui sui stt ksuilrl suppress pfstr) tuple
 466              (make-instance 'ustr :cui (ensure-integer cui)
 467                             :lui (ensure-integer lui) :sui (ensure-integer sui)
 468                             :stt stt :str pfstr
 469                             :cuisui (make-cuisui (ensure-integer cui)
 470                                                  (ensure-integer sui))
 471                             :suppress suppress
 472                             :lrl (ensure-integer ksuilrl))))
 473        (query-string mrconso (cui lui sui stt ksuilrl kpfstr) srl nil nil :lrl ksuilrl
 474                      :distinct t
 475                      :order (sui asc))
 476        :database db)))
 477
 478 (defun find-string-sui (sui &key (srl *current-srl*))
 479   "Return the string associated with sui"
 480   (ensure-sui-integer sui)
 481   (collect-umlisp-query (mrconso (str) srl sui sui :lrl ksuilrl :single t)
 482     str))
 483
 484 (defun find-uso-cuisui (cui sui &key (srl *current-srl*))
 485   (ensure-sui-integer sui)
 486   (ensure-cui-integer cui)
 487   (collect-umlisp-query (mrconso (aui sab code srl tty saui sdui scui) srl kcuisui
 488                            (make-cuisui cui sui) :lrl srl)
 489     (make-instance 'uso :aui aui :sab sab :code code :srl srl :tty tty
 490                    :cui cui :sui sui :saui saui :sdui sdui :scui scui)))
 491
 492 (defun find-uso-aui (aui &key (srl *current-srl*))
 493   (ensure-sui-integer aui)
 494   (collect-umlisp-query (mrconso (sab cui sui code srl tty saui sdui scui) srl aui
 495                                  aui :lrl srl :single t)
 496     (make-instance 'uso :aui aui :cui cui :sab sab :code code :srl srl :tty tty
 497                    :sui sui :saui saui :sdui sdui :scui scui)))
 498
 499 (defun find-ucxt-cuisui (cui sui &key (srl *current-srl*))
 500   (ensure-cui-integer cui)
 501   (ensure-sui-integer sui)
 502   (collect-umlisp-query (mrcxt (sab rank code cxn cxl cxs cui2 hcd rela xc)
 503                             srl kcuisui (make-cuisui cui sui) :lrl ksrl)
 504                         (make-instance 'ucxt :sab sab :code code
 505                 :rank rank
 506                    :cxn (ensure-integer cxn) :cxl cxl :cxs cxs :hcd hcd
 507                    :rela rela :xc xc
 508                    :cui2 (ensure-integer cui2))))
 509
 510 (defun find-uhier-cui (cui &key (srl *current-srl*))
 511   (ensure-cui-integer cui)
 512   (collect-umlisp-query (mrhier (aui cxn paui sab rela ptr hcd cvf)
 513                             srl cui cui :lrl ksrl)
 514     (make-instance 'uhier :cui cui :aui (ensure-integer aui)
 515                    :cxn (ensure-integer cxn)
 516                    :paui (ensure-integer paui)
 517                    :sab sab :rela rela :ptr ptr :hcd hcd :cvf cvf)))
 518
 519 (defun find-uhier-all (&key (srl *current-srl*))
 520   (collect-umlisp-query (mrhier (cui aui cxn paui sab rela ptr hcd cvf)
 521                             srl nil nil :lrl ksrl)
 522     (make-instance 'uhier :cui cui :aui (ensure-integer aui)
 523                    :cxn (ensure-integer cxn)
 524                    :paui (ensure-integer paui)
 525                    :sab sab :rela rela :ptr ptr :hcd hcd :cvf cvf)))
 526
 527 (defun find-usat-ui (cui &optional (lui nil) (sui nil) &key (srl *current-srl*))
 528   (ensure-cui-integer cui)
 529   (ensure-lui-integer lui)
 530   (ensure-sui-integer sui)
 531   (let ((ls "select CODE,ATN,SAB,ATV from MRSAT where "))
 532     (cond
 533       (sui (string-append ls "KCUISUI='"
 534                           (integer-string (make-cuisui cui sui) 14)
 535                           "'"))
 536       (lui (string-append ls "KCUILUI='"
 537                           (integer-string (make-cuilui cui lui) 14)
 538                           "' and sui='0'"))
 539       (t (string-append ls "cui='" (prefixed-fixnum-string cui nil 7)
 540                         "' and lui='0' and sui='0'")))
 541     (when srl
 542       (string-append ls " and KSRL<=" (prefixed-fixnum-string srl nil 3)))
 543     (loop for tuple in (mutex-sql-query ls) collect
 544           (destructuring-bind (code atn sab atv) tuple
 545             (make-instance 'usat :code code :atn atn :sab sab :atv atv)))))
 546
 547 (defun find-usty-tui (tui)
 548   "Find usty for tui"
 549   (ensure-tui-integer tui)
 550   (collect-umlisp-query (mrsty (sty) nil tui tui :single t)
 551     (make-instance 'usty :tui tui :sty sty)))
 552
 553 (defun find-usty-sty (sty)
 554   "Find usty for a sty"
 555   (collect-umlisp-query (mrsty (tui) nil sty sty :single t)
 556     (make-instance 'usty :tui (ensure-integer tui) :sty sty)))
 557
 558 (defun find-usty-all ()
 559   "Return list of usty's for all semantic types"
 560   (collect-umlisp-query (mrsty (tui) nil nil nil :distinct t)
 561     (find-usty-tui tui)))
 562
 563 (defun find-usab-all ()
 564   "Find usab for a key"
 565   (collect-umlisp-query (mrsab (vcui rcui vsab rsab son sf sver vstart vend imeta
 566                                   rmeta slc scc srl tfr cfr cxty ttyl atnl lat
 567                                   cenc curver sabin ssn scit) nil nil nil)
 568     (make-instance 'usab :vcui (ensure-integer vcui)
 569                    :rcui (ensure-integer rcui) :vsab vsab :rsab rsab :son son
 570                    :sf sf :sver sver :vstart vstart :vend vend :imeta imeta
 571                    :rmeta rmeta :slc slc :scc scc  :srl (ensure-integer srl)
 572                    :tfr (ensure-integer tfr) :cfr (ensure-integer cfr)
 573                    :cxty cxty :ttyl ttyl :atnl atnl :lat lat :cenc cenc
 574                    :curver curver :sabin sabin :ssn ssn :scit scit)))
 575
 576 (defun find-usab-by-key (key-name key)
 577   "Find usab for a key"
 578   (collect-umlisp-query-eval ('mrsab '(vcui rcui vsab rsab son sf sver vstart
 579                                        vend imeta rmeta slc scc srl tfr cfr cxty
 580                                        ttyl atnl lat cenc curver sabin
 581                                        ssn scit)
 582                                      nil key-name key :single t)
 583      (make-instance 'usab :vcui (ensure-integer vcui)
 584                     :rcui (ensure-integer rcui) :vsab vsab :rsab rsab :son son
 585                     :sf sf :sver sver :vstart vstart :vend vend :imeta imeta
 586                     :rmeta rmeta :slc slc :scc scc :srl (ensure-integer srl)
 587                     :tfr (ensure-integer tfr) :cfr (ensure-integer cfr)
 588                     :cxty cxty :ttyl ttyl :atnl atnl :lat lat :cenc cenc
 589                     :curver curver :sabin sabin
 590                     :ssn ssn :scit scit)))
 591
 592 (defun find-usab-rsab (rsab)
 593   "Find usab for rsab"
 594   (find-usab-by-key 'rsab rsab))
 595
 596 (defun find-usab-vsab (vsab)
 597   "Find usab for vsab"
 598   (find-usab-by-key 'vsab vsab))
 599
 600 (defun find-cui-max ()
 601   (ensure-integer (caar (mutex-sql-query "select max(CUI) from MRCON"))))
 602
 603 (defun find-umap-cui (cui)
 604   (ensure-cui-integer cui)
 605   (collect-umlisp-query (mrmap (mapsetsab mapsubsetid maprank fromid fromsid fromexpr
 606                                           fromtype fromrule fromres rel rela toid tosid
 607                                           toexpr totype torule tores maprule maptype
 608                                           mapatn mapatv cvf)
 609                                nil mapsetcui cui)
 610     (make-instance 'umap :mapsetcui cui :mapsetsab mapsetsab :mapsubsetid mapsubsetid
 611                    :maprank (ensure-integer maprank) :fromid fromid :fromsid fromsid
 612                    :fromexpr fromexpr :fromtype fromtype :fromrule fromrule :fromres fromres
 613                    :rel rel :rela rela :toid toid :tosid tosid :toexpr toexpr :totype totype
 614                    :torule torule :tores tores :maprule maprule :maptype maptype :mapatn mapatn
 615                    :mapatv mapatv :cvf cvf)))
 616
 617 ;;;; Cross table find functions
 618
 619 (defun find-ucon-tui (tui &key (srl *current-srl*))
 620   "Find list of ucon for tui"
 621   (ensure-tui-integer tui)
 622   (collect-umlisp-query (mrsty (cui) srl tui tui :lrl klrl :order (cui asc))
 623     (find-ucon-cui (ensure-integer cui) :srl srl)))
 624
 625 (defun find-ucon-word (word &key (srl *current-srl*) (like nil))
 626   "Return list of ucons that match word. Optionally, use SQL's LIKE syntax"
 627   (collect-umlisp-query-eval ('mrxw_eng '(cui) srl 'wd word :like like :distinct t
 628                                      :lrl 'klrl :order '(cui asc))
 629     (find-ucon-cui cui :srl srl)))
 630
 631 (defun find-ucon-normalized-word (word &key (srl *current-srl*) (like nil))
 632   "Return list of ucons that match word, optionally use SQL's LIKE syntax"
 633   (collect-umlisp-query-eval ('mrxnw_eng '(cui) srl 'nwd word :like like :distinct t
 634                                       :lrl 'klrl :order '(cui asc))
 635     (find-ucon-cui cui :srl srl)))
 636
 637 (defun find-cui-normalized-word (word &key (srl *current-srl*) (like nil))
 638   "Return list of cui that match word, optionally use SQL's LIKE syntax"
 639   (collect-umlisp-query-eval ('mrxnw_eng '(cui) srl 'nwd word :like like :distinct t
 640                                          :lrl 'klrl :order '(cui asc))
 641                              cui))
 642
 643 (defun find-lui-normalized-word (word &key (srl *current-srl*) (like nil))
 644   "Return list of cui that match word, optionally use SQL's LIKE syntax"
 645   (collect-umlisp-query-eval ('mrxnw_eng '(lui) srl 'nwd word :like like :distinct t
 646                                          :lrl 'klrl :order '(cui asc))
 647                              lui))
 648
 649 (defun find-sui-normalized-word (word &key (srl *current-srl*) (like nil))
 650   "Return list of cui that match word, optionally use SQL's LIKE syntax"
 651   (collect-umlisp-query-eval ('mrxnw_eng '(sui) srl 'nwd word :like like :distinct t
 652                                          :lrl 'klrl :order '(cui asc))
 653                              sui))
 654
 655 (defun find-ustr-word (word &key (srl *current-srl*))
 656   "Return list of ustrs that match word"
 657   (collect-umlisp-query (mrxw_eng (cui sui) srl wd word :lrl klrl
 658                                :order (cui asc sui asc))
 659     (find-ustr-cuisui (ensure-integer cui) (ensure-integer sui) :srl srl)))
 660
 661 (defun find-ustr-normalized-word (word &key (srl *current-srl*))
 662   "Return list of ustrs that match word"
 663   (collect-umlisp-query (mrxnw_eng (cui sui) srl nwd word :lrl klrl
 664                                  :order (cui asc sui asc))
 665     (find-ustr-cuisui (ensure-integer cui) (ensure-integer sui) :srl srl)))
 666
 667 (defun find-uterm-word (word &key (srl *current-srl*))
 668   "Return list of uterms that match word"
 669   (collect-umlisp-query (mrxw_eng (cui lui) srl wd word :lrl klrl
 670                                :order (cui asc lui asc))
 671     (find-uterm-cuilui (ensure-integer cui) (ensure-integer lui) :srl srl)))
 672
 673 (defun find-uterm-normalized-word (word &key (srl *current-srl*))
 674   "Return list of uterms that match word"
 675   (collect-umlisp-query (mrxnw_eng (cui lui) srl nwd word :lrl klrl
 676                                  :order (cui asc lui asc))
 677     (find-uterm-cuilui (ensure-integer cui) (ensure-integer lui) :srl srl)))
 678
 679 (defun find-ucon-noneng-word (word &key (srl *current-srl*) (like nil))
 680   "Return list of ucons that match non-english word"
 681   (collect-umlisp-query-eval ('mrxw_noneng '(cui) srl 'wd word :like like
 682                                         :distinct t :lrl 'klrl :order '(cui asc))
 683     (find-ucon-cui cui :srl srl)))
 684
 685 (defun find-ustr-noneng-word (word &key (srl *current-srl*))
 686   "Return list of ustrs that match non-english word"
 687   (collect-umlisp-query (mrxw_noneng (cui sui) srl wd word :lrl klrl
 688                                   :order (cui asc sui asc))
 689     (find-ustr-cuisui (ensure-integer cui) (ensure-integer sui) :srl srl)))
 690
 691 ;; Special tables
 692
 693 (defun find-usrl-all ()
 694   (collect-umlisp-query (usrl (sab srl) nil nil nil :order (sab asc))
 695     (make-instance 'usrl :sab sab :srl (ensure-integer srl))))
 696
 697 ;;; Multiword lookup and score functions
 698
 699 (defun find-uobj-multiword (str obj-lookup-fun sort-fun key srl
 700                             only-exact-if-match)
 701   (let ((uobjs '()))
 702     (dolist (word (delimited-string-to-list str #\space))
 703       (setq uobjs (append uobjs (funcall obj-lookup-fun word :srl srl))))
 704     (let ((sorted
 705            (funcall sort-fun str
 706                     (delete-duplicates uobjs :test #'= :key key))))
 707       (if (and (plusp (length sorted))
 708                only-exact-if-match
 709                (multiword-match str (pfstr (first sorted))))
 710           (first sorted)
 711         sorted))))
 712
 713 (defun find-ucon-multiword (str &key (srl *current-srl*)
 714                                      (only-exact-if-match t))
 715   (find-uobj-multiword str #'find-ucon-word #'sort-score-pfstr-str
 716                        #'cui srl only-exact-if-match))
 717
 718 (defun find-uterm-multiword (str &key (srl *current-srl*)
 719                                       (only-exact-if-match t))
 720   (find-uobj-multiword str #'find-uterm-word #'sort-score-pfstr-str
 721                        #'lui srl only-exact-if-match))
 722
 723 (defun find-ustr-multiword (str &key (srl *current-srl*)
 724                                      (only-exact-if-match t))
 725   (find-uobj-multiword str #'find-ustr-word #'sort-score-ustr-str
 726                        #'sui srl only-exact-if-match))
 727
 728 (defun sort-score-pfstr-str (str uobjs)
 729   "Return list of sorted and scored ucons. Score by match of str to ucon-pfstr"
 730   (sort-score-umlsclass-str uobjs str #'pfstr))
 731
 732 (defun sort-score-ustr-str (str ustrs)
 733   "Return list of sorted and scored ucons. Score by match of str to ucon-pfstr"
 734   (sort-score-umlsclass-str ustrs str #'str))
 735
 736 (defun sort-score-umlsclass-str (objs str lookup-func)
 737   "Sort a list of objects based on scoring to a string"
 738   (let ((scored '()))
 739     (dolist (obj objs)
 740       (push (list obj (score-multiword-match str (funcall lookup-func obj)))
 741        scored))
 742     (mapcar #'car (sort scored #'> :key #'cadr))))
 743
 744
 745 ;;; LEX SQL functions
 746
 747 (defun find-lexterm-eui (eui)
 748   (ensure-eui-integer eui)
 749   (collect-umlisp-query (lrwd (wrd) nil eui eui :single t)
 750     (make-instance 'lexterm :eui eui :wrd wrd)))
 751
 752 (defun find-lexterm-word (wrd)
 753   (collect-umlisp-query (lrwd (eui) nil wrd wrd)
 754     (make-instance 'lexterm :eui (ensure-integer eui)
 755                    :wrd (copy-seq wrd))))
 756
 757 ;; LEX SQL Read functions
 758
 759 (defun find-labr-eui (eui)
 760   (ensure-eui-integer eui)
 761   (collect-umlisp-query (lrabr (bas abr eui2 bas2) nil eui eui)
 762     (make-instance 'labr :eui eui :bas bas :abr abr :bas2 bas2
 763                    :eui2 (ensure-integer eui2))))
 764
 765 (defun find-labr-bas (bas)
 766   (collect-umlisp-query (labr (eui abr eui2 bas2) nil bas bas)
 767     (make-instance 'labr :eui (ensure-integer eui) :abr abr :bas2 bas2
 768                    :bas (copy-seq bas) :eui2 (ensure-integer eui2))))
 769
 770 (defun find-lagr-eui (eui)
 771   (ensure-eui-integer eui)
 772   (collect-umlisp-query (lragr (str sca agr cit bas) nil eui eui)
 773     (make-instance 'lagr :eui eui :str str :sca sca :agr agr
 774                    :cit cit :bas bas)))
 775
 776 (defun find-lcmp-eui (eui)
 777   (ensure-eui-integer eui)
 778   (collect-umlisp-query (lrcmp (bas sca com) nil eui eui)
 779     (make-instance 'lcmp :eui eui :bas bas :sca sca :com com)))
 780
 781 (defun find-lmod-eui (eui)
 782   (ensure-eui-integer eui)
 783   (collect-umlisp-query (lrmod (bas sca psn_mod fea) nil eui eui)
 784     (make-instance 'lmod :eui eui :bas bas :sca sca :psnmod psn_mod :fea fea)))
 785
 786 (defun find-lnom-eui (eui)
 787   (ensure-eui-integer eui)
 788   (collect-umlisp-query (lrnom (bas sca eui2 bas2 sca2) nil eui eui)
 789     (make-instance 'lnom :eui eui :bas bas :sca sca :bas2 bas2 :sca2 sca2
 790                    :eui2 (ensure-integer eui2))))
 791
 792 (defun find-lprn-eui (eui)
 793   (ensure-eui-integer eui)
 794   (collect-umlisp-query (lrprn (bas num gnd cas pos qnt fea) nil eui eui)
 795     (make-instance 'lprn :eui eui :bas bas :num num :gnd gnd
 796                    :cas cas :pos pos :qnt qnt :fea fea)))
 797
 798 (defun find-lprp-eui (eui)
 799   (ensure-eui-integer eui)
 800   (collect-umlisp-query (lrprp (bas str sca fea) nil eui eui)
 801     (make-instance 'lprp :eui eui :bas bas :str str :sca sca :fea fea)))
 802
 803 (defun find-lspl-eui (eui)
 804   (ensure-eui-integer eui)
 805   (collect-umlisp-query (lrspl (spv bas) nil eui eui)
 806     (make-instance 'lspl :eui eui :spv spv :bas bas)))
 807
 808 (defun find-ltrm-eui (eui)
 809   (ensure-eui-integer eui)
 810   (collect-umlisp-query (lrtrm (bas gen) nil eui eui)
 811     (make-instance 'ltrm :eui eui :bas bas :gen gen)))
 812
 813 (defun find-ltyp-eui (eui)
 814   (ensure-eui-integer eui)
 815   (collect-umlisp-query (lrtyp (bas sca typ) nil eui eui)
 816     (make-instance 'ltyp :eui eui :bas bas :sca sca :typ typ)))
 817
 818 (defun find-lwd-wrd (wrd)
 819   (make-instance 'lwd :wrd wrd
 820                  :euilist (collect-umlisp-query (lrwd (eui) nil wrd wrd)
 821                                                 (ensure-integer eui))))
 822
 823 ;;; Semantic Network SQL access functions
 824
 825 (defun find-sdef-ui (ui)
 826   (collect-umlisp-query (srdef (rt sty_rl stn_rtn def ex un rh abr rin)
 827                             nil ui ui :single t)
 828     (make-instance 'sdef :rt rt :ui ui :styrl sty_rl :stnrtn stn_rtn
 829                    :def def :ex ex :un un :rh rh :abr abr :rin rin)))
 830
 831 (defun find-sstre1-ui (ui)
 832   (collect-umlisp-query (srstre1 (ui2 ui3) nil ui ui)
 833     (make-instance 'sstre1 :ui ui :ui2 (ensure-integer ui2)
 834                    :ui3 (ensure-integer ui3))))
 835
 836 (defun find-sstre1-ui2 (ui2)
 837   (collect-umlisp-query (srstre1 (ui ui3) nil ui2 ui2)
 838     (make-instance 'sstre1 :ui (ensure-integer ui) :ui2 ui2
 839                    :ui3 (ensure-integer ui3))))
 840
 841 (defun find-sstr-rl (rl)
 842   (collect-umlisp-query (srstre (sty_rl sty_rl2 ls) nil rl rl)
 843     (make-instance 'sstr :rl rl :styrl sty_rl :styrl2 sty_rl2 :ls ls)))
 844
 845 (defun find-sstre2-sty (sty)
 846   (collect-umlisp-query (srstre2 (rl sty2) nil sty sty)
 847     (make-instance 'sstre2 :sty (copy-seq sty) :rl rl :sty2 sty2)))
 848
 849 (defun find-sstr-styrl (styrl)
 850   (collect-umlisp-query (srstr (rl sty_rl2 ls) nil styrl styrl)
 851     (make-instance 'sstr :styrl styrl :rl rl :styrl2 sty_rl2 :ls ls)))
 852
 853
 854 ;;; **************************
 855 ;;; Local Classes
 856 ;;; **************************
 857
 858
 859 (defun make-ustats ()
 860   (with-sql-connection (conn)
 861     (ignore-errors (sql-execute "drop table USTATS" conn))
 862     (sql-execute "create table USTATS (NAME varchar(160), COUNT bigint, SRL integer)" conn)
 863
 864     (dotimes (srl 5)
 865       (insert-ustats-count conn "Concept Count" "MRCONSO" "distinct CUI" "KCUILRL" srl)
 866       (insert-ustats-count conn "Term Count" "MRCONSO" "distinct KCUILUI" "KCUILRL" srl)
 867       (insert-ustats-count conn "Distinct Term Count" "MRCONSO" "distinct LUI" "KLUILRL" srl)
 868       (insert-ustats-count conn "String Count" "MRCONSO" "*" "KSUILRL" srl)
 869       (insert-ustats-count conn "Distinct String Count" "MRCONSO" "distinct SUI" "KSUILRL" srl)
 870       (insert-ustats-count conn "Context Count" "MRCXT" "*" "KSRL" srl)
 871       (insert-ustats-count conn "Co-occuring Concept Count" "MRCOC" "*" "KLRL" srl)
 872       (insert-ustats-count conn "Definition Count" "MRDEF" "*" "KSRL" srl)
 873       #+ignore
 874       (insert-ustats-count conn "Locator Count" "MRLO" "*" "KLRL" srl)
 875       (insert-ustats-count conn "Rank Count" "MRRANK" "*" "KSRL" srl)
 876       (insert-ustats-count conn "Relationship Count" "MRREL" "*" "KSRL" srl)
 877       (insert-ustats-count conn "Semantic Type Count" "MRSTY" "*" "KLRL" srl)
 878       (insert-ustats-count conn "Simple Attribute Count" "MRSAT" "*" "KSRL" srl)
 879       (insert-ustats-count conn "Source Abbreviation Count" "MRSAB" "*" "SRL" srl)
 880       (insert-ustats-count conn "Word Index Count" "MRXW_ENG" "*" "KLRL" srl)
 881       (insert-ustats-count conn "Normalized Word Index Count" "MRXNW_ENG" "*" "KLRL" srl)
 882       (insert-ustats-count conn "Normalized String Index Count" "MRXNS_ENG" "*" "KLRL" srl))
 883     (sql-execute "create index USTATS_SRL on USTATS (SRL)" conn))
 884   (find-ustats-all))
 885
 886 (defun insert-ustats-count (conn name table count-variable srl-control srl)
 887   (insert-ustats conn name (find-count-table conn table srl count-variable srl-control) srl))
 888
 889 (defun find-count-table (conn table srl count-variable srl-control)
 890   (cond
 891    ((stringp srl-control)
 892     (ensure-integer
 893      (caar (sql-query (format nil "select count(~a) from ~a where ~a <= ~d"
 894                               count-variable table srl-control srl)
 895                       conn))))
 896    ((null srl-control)
 897     (ensure-integer
 898      (caar (sql-query (format nil "select count(~a) from ~a"
 899                               count-variable table )
 900                       conn))))
 901    (t
 902     (error "Unknown srl-control")
 903     0)))
 904
 905 (defun insert-ustats (conn name count srl)
 906   (sql-execute (format nil "insert into USTATS (name,count,srl) values ('~a',~d,~d)"
 907                        name count (if srl srl 3))
 908                conn))
 909
 910 (defun find-ustats-all (&key (srl *current-srl*))
 911   (if srl
 912       (collect-umlisp-query (ustats (name count srl) nil srl srl
 913                                     :order (name asc))
 914                             (make-instance 'ustats :name name
 915                                            :hits (ensure-integer count)
 916                                            :srl (ensure-integer srl)))
 917     (collect-umlisp-query (ustats (name count srl) nil nil nil
 918                                   :order (name asc))
 919                           (make-instance 'ustats :name name
 920                                          :hits (ensure-integer count)
 921                                          :srl (ensure-integer srl)))))
 922
 923 (defun find-ustats-srl (srl)
 924   (collect-umlisp-query (ustats (name count) nil srl srl :order (name asc))
 925                            (make-instance 'ustats :name name :hits (ensure-integer count))))
 926
 927
 928
 929 (defun find-bsab-sab (sab)
 930  (collect-umlisp-query (bonus_sab (name count) nil sab sab :single t)
 931      (make-instance 'bsab :sab sab :name name :hits (ensure-integer count))))
 932
 933 (defun find-bsab-all ()
 934  (collect-umlisp-query (bonus_sab (sab name count) nil nil nil :order (sab asc))
 935      (make-instance 'bsab :sab sab :name name :hits (ensure-integer count))))
 936
 937 (defun find-btty-tty (tty)
 938  (collect-umlisp-query (bonus_tty (name count) nil tty tty :single t)
 939      (make-instance 'btty :tty tty :name name :hits (ensure-integer count))))
 940
 941 (defun find-btty-all ()
 942  (collect-umlisp-query (bonus_tty (tty name count) nil nil nil :order (tty asc))
 943   (make-instance 'btty :tty tty :name name :hits (ensure-integer count))))
 944
 945 (defun find-brel-rel (rel)
 946   (collect-umlisp-query (bonus_rel (sab sl rel rela count) nil rel rel)
 947     (make-instance 'brel :sab sab :sl sl :rel rel :rela rela
 948                     :hits (ensure-integer count))))